氨基酸代谢组学
氨基酸代谢组学-详情氨基酸是生物大分子蛋白质的基本组成单位,由一个中心碳原子、H原子、羧基(-COOH)、氨基(-NH2)和可变的R基组成。近年来发现氨基酸不仅是细胞信号分子,也是基因表达和蛋白质磷酸化级联的调节因子。此外,氨基酸也是合成各种具有重要生物学功能的激素和低分子量含氮物质的关键前体,即这些功能的实现需要一定生理浓度的氨基酸及其代谢物。除了作为蛋白质和多肽的组成部分之外,一些氨基酸还调节生长、繁殖和
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2023-09-11 09:30
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外泌体与癌症
外泌体与癌症-详情外泌体是直径为30-140 nm的细胞外囊泡(EVs)。它们是功能性物质(如蛋白质、非编码RNA、mRNA和脂质)的载体。它们在细胞中充当信使,并且具有改变受体细胞生物学活性的功能。外泌体作为保留了与亲代细胞相似的酶促活性的小囊泡,它们经历萌芽并形成多囊泡(MVBs),与质膜(PM)融合,并zuì终释放到细胞外,同时,外泌体也可以通过细胞内的内吞作用被内化,其内含物被转运至目标细胞,从而改变细胞的生物学功能
化学交联质谱
化学交联质谱-详情化学交联质谱(Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry,CXMS)是利用化学交联剂的交联作用,研究蛋白质或蛋白-蛋白复合体的空间结构以及相互作用的技术。化学交联质谱技术利用带活性基团的化学交联剂,将空间距离在化学交联剂臂长范围内的两个氨基酸通过稳定的共价键(酰胺键)连接起来,再将发生交联后的蛋白质酶切后进行质谱分析,对被交联的氨基酸残基鉴定,实现蛋白质(复合物)三维构象以
氨基酸的分析与测定
氨基酸的分析与测定-详情对氨基酸进行分析测定主要包括对氨基酸种类和含量进行鉴定,可用于蛋白质、多肽以及蛋白类药物样品的氨基酸组成分析,评估蛋白质水平(即当蛋白质水解时)或鉴定蛋白质,作为肽质量指纹图谱或MS/MS测序的补充方法。目前氨基酸分析的方法主要包括离子交换色谱法(IEC)、高效液相色谱法(HPLC)以及离子色谱法(IC)等。这三种方法都包括分离-衍生-检测的步骤:IEC通过阳离子交换柱分离,柱后茚三酮衍生,利
植物代谢组学
植物代谢组学-详情植物代谢组是代谢组学的一个重要分支,定义为以植物为研究对象的代谢组学;研究不同物种、不同基因类型或不同生态类型的植物在不同生长时期或受某种刺激前后的所有小分子代谢产物,对其进行定性、定量分析,并找出代谢变化的规律。为了在不断变化和恶劣环境下生存,植物进化出了复杂的、多细胞结构的不同功能器官;这些器官包含了多种细胞类型,这些不同类型的细胞又转移的代谢机制来精确实现它们特定的功能。环
甲基化蛋白质检测
甲基化蛋白质检测-详情甲基化是将活性甲基化合物(如硫代腺苷甲硫氨酸,SAM)的甲基在酶催化作用下共价转移到其他化合物(核酸或蛋白质)的过程。蛋白质的氨基酸残基共价结合甲基基团就称为蛋白质甲基化,发生了甲基化的蛋白质就称为甲基化蛋白质。蛋白质甲基化通常发生在精氨酸或赖氨酸残基上,精氨酸残基可以共价结合1个或2个甲基,即一甲基化精氨酸和二甲基化精氨酸;赖氨酸残基可以共价结合1-3个甲基基团。根据共价结合在氨基
比较蛋白质组
比较蛋白质组-详情比较蛋白质组又称差异蛋白质组,是指两个样本间存在表达差异的蛋白质组。比较蛋白组学(comparative proteomics)即差异蛋白质组学旨在寻找和鉴定不同条件或状态下(如不同的外界刺激、不同的生长时期等)实验组和对照组样品存在差异表达的蛋白质组。蛋白质作为生命活动的物质承担者调节各种生理活动,其在机体内的种类和含量并不是一成不变的,而是处于动态变化中的,以适应生命体的各种生长变化。对这类蛋白质
蛋白质谱结果怎么分析
蛋白质谱结果怎么分析-详情利用质谱仪对蛋白质进行分析鉴定可以得到不同的数据,如一级质谱数据和二级质谱数据,这些质谱数据也就是质谱结果,都需要结合数据库、软件等进行生物信息学分析才能实现蛋白质的鉴定及序列分析等。蛋白质一级质谱数据主要是分析蛋白质酶切产生的肽段质量图谱,即肽质量指纹图谱(Peptide Mass Fingerprint,PMF),再将PMF中的肽质量数据与数据库中理论肽质量进行比较和评价,从而实现肽段的鉴定。常用
比较蛋白质组学和定向蛋白组学有何优势
比较蛋白质组学和定向蛋白组学有何优势-详情比较蛋白质组学又称差异蛋白质组学,主要是通过比较不同条件下样本的蛋白差异表达,寻找表达水平存在差异的蛋白质,从而揭示机体响应外界环境变化或者自身生长调节的本质,解释生理和病理机制,更好的认识机体生命活动规律。比较蛋白质组学建立在样本所表达的全部蛋白质的分析上,需要对全部蛋白进行无差别分析,尽可能多的定性定量鉴定样品中包含的蛋白质,在此基础上再进行差异蛋白筛
蛋白质组学与蛋白质结构
蛋白质组学与蛋白质结构-详情质谱技术是蛋白质组学研究中的一个重要技术,可用于解析蛋白质的一级结构,为预测蛋白质的高级结构提供基础。百泰派克生物科技提供基于质谱的蛋白质结构分析服务。蛋白质结构蛋白质不仅有不同的氨基酸序列,而且还通过不同的键结合在一起,并折叠成各种三维结构。折叠的形状或构象直接取决于蛋白质的线性氨基酸序列。蛋白质内氨基酸的线性序列是蛋白质的一级结构。蛋白质链相邻区域的氨基和羧基之间的
蛋白质谱生信分析
蛋白质谱生信分析-详情蛋白质谱生信分析就是对质谱数据进行生物信息学分析。所谓质谱数据就是质谱仪通过检测肽段母离子的质荷比(m/z)而得到的图谱,如肽质量指纹图谱(PMF)、肽序列图谱(PST),一般利用各种软件、数据库将质谱获得的肽离子质量与理论肽质量进行比较和评价,从而实现该肽段乃至整个蛋白的鉴定和序列分析。常用的检索工具主要包括PeptIdenet、MS-Fit、ProFound、PeptideSearch、MS-Taq、MS-Seq、PepFrag、Mascot
变性质谱分子量与非变性质谱分子量
变性质谱分子量与非变性质谱分子量-详情质谱技术通过测定待测物的质量电荷比(m/z)从而实现分子质量的鉴定,其优良的分辨率、灵敏度以及准确性使其在各种化合物如蛋白质的分子质量分析中广泛运用。通常所用的分析蛋白质分子量的质谱技术是一种变性质谱技术,变性质谱会破坏二硫键等蛋白质空间结构,当需要对含有非共价键的蛋白分析时,为了避免非共价结合被强烈的变性条件所破坏,则需在非变性的条件下进行研究。变性质谱即通过酶
血液蛋白质组学
血液蛋白质组学-详情血液蛋白质组学包括血浆蛋白质组学和血清蛋白质组学,选择血浆还是血清需根据研究目的而定。百泰派克生物科技提供基于质谱的血液蛋白质组学分析服务。血液蛋白质组学人的血液中的蛋白质基本包括了来自所有器官、组织、细胞中的蛋白质,因此血液是用于诊断各种疾病和发现生物标志物的有价值的和zuì常用的标本。血液蛋白质组学就是对血液中的蛋白质组进行研究。血液蛋白质组学蛋白质组学用血清还是血浆好血清指
iTRAQ、TMT、Label-Free
iTRAQ、TMT、Label-Free-详情研究蛋白质含量的技术主要分为标记和非标记两种策略,其中iTRAQ和TMT为体外标记蛋白定量,Label-Free为非标记定量技术。iTRAQ/TMT/Label-Free是三种不同的蛋白定量技术:iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)即同位素标记相对和绝对定量技术。iTRAQ技术通过同位素标记来实现蛋白质定量研究,经水解的蛋白质多肽N末端或赖氨酸侧链基团可以被同位素标记,通过高精度
标记质谱
标记质谱-详情质谱是蛋白质组学的重要研究工具,通过测定蛋白肽段离子的质荷比(m/z)得到肽质量图谱,利用蛋白质数据库进行检索可以对其进行定性鉴定。另外,根据蛋白肽段的离子峰强度可以计算其相对含量,结合内标肽可实现jué对定量。基于质谱的蛋白质组定量方法有很多,根据是否引入同位素,可以将其分为基于同位素的标记质谱和非标记质谱定量技术(Label Free)。基于同位素标记的质谱技术将水解得到的蛋白质多肽利用同位素试
血清蛋白质组学方法
血清蛋白质组学方法-详情血清蛋白质组学多用于筛选血清中的低丰度蛋白质,因为它们是主要的生物标志物靶标。也因此血清蛋白质组学方法包括了去除高丰度蛋白质。百泰派克生物科技提供基于质谱的血清蛋白质组学分析。血清蛋白质组学血清是血液发生凝血反应后形成的位于上层的淡黄色透明液体。在凝血过程中,血液中的纤维蛋白会被凝结去除,因此血清中不含纤维蛋白,这也是血清与血浆的zuì大区别。血清中大量未参与凝血反应的物质还
蛋白质谱数据比较
蛋白质谱数据比较-详情蛋白质谱数据比较就是将蛋白质谱分析的得到的数据图进行比较分析,可以理解成两种意思:一种是将单个肽段离子的质谱图数据与检索数据库中的理论值进行比较,即对质谱获得的肽离子质量与理论肽质量进行比较和评价,从而实现蛋白肽段的鉴定;另一种可以理解为将不同蛋白组间的肽段离子质谱数据进行比较,以从整体水平分析组间的异同等。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合n
标记转移蛋白互作分析
标记转移蛋白互作分析-详情蛋白质通过相互结合形成蛋白质互作网络,参与生命过程的各个环节,如信号传递、基因表达调控、能量和物质代谢及细胞生长周期调控等。系统分析蛋白质的相互作用有助于了解特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应机制以及蛋白之间的功能联系,对研究疾病分子机制、发现新药靶点都有重要意义。常见的蛋白质相互作用分析方法主要包括Pull-down、GST Pull-down、IP、Co-IP、交联法以及标记转移法等。蛋白
植物外泌体蛋白质组学
植物外泌体蛋白质组学-详情植物外泌体蛋白质组学有助于检测和鉴定植物外泌体以及进一步了解植物外泌体的生理功能。百泰派克生物科技提供基于质谱的植物外泌体蛋白质组学分析服务。植物外泌体细胞外囊泡(extracellular vesicles)简称EV,是由细胞释放的各种具有膜结构的囊泡的统称,直径可以从30nm到8um。外泌体是细胞外囊泡的一种,直径为30-150nm,起源于内吞途径,含有核酸、蛋白质和脂质等物质。由于外泌体在细胞-细胞通讯中
甲基化分析方法
甲基化分析方法-详情蛋白甲基化是真核和原核生物中常见的翻译后修饰方式,常发生在组蛋白和非组蛋白如转录调控因子、细胞信号通路分子以及肿瘤抑制蛋白等蛋白分子上。甲基化分析的主要任务就是鉴定蛋白是否发生甲基化、发生甲基化的氨基酸位点以及甲基化的水平。目前,蛋白甲基化分析方法主要有高效液相串联质谱法和抗体法。质谱法凭借其高通量、高精度和高准确性等优势已成为当前蛋白甲基化分析的重要工具,大致分析流程是先将待
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微生物菌种查询网 烬灰刺孢链霉菌 百欧博伟生物
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