单细胞质谱流式技术分析
单细胞质谱流式技术分析-详情随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的研究需要了,我们需要更进一步了解细胞之间的差异性,于是针对单细胞的各类研究技术应运而生。单细胞质谱流式(Mass Cytometry)技术是利用质谱技术对单细胞进行多参数检测的流式技术,它既有传统流式细胞术能够高速分析的特点,又兼并了质谱检测的高分辨能力。单细胞测序和质谱流式都是目前非常强大的技术,越来越多的高分文献都是将两者结
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2023-09-11 09:30
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基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现
基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现-详情所有经由HLA-I、II分子呈递在细胞表面,供T细胞检测识别的短肽,称为免疫多肽组(Immunopeptidome)。免疫多肽组学分析,旨在研究I型和II型免疫肽的动力学和组成。免疫多肽组学的深入表征可以应用于癌症、免疫疾病和传染病的新疗法的开发。免疫肽是由有核细胞在HLA或MHC抗原呈递途径的I型和II型蛋白上提交的全部肽。它在细胞介导和体液反应中定义免疫原性表位是必不可少的。确定
基于LC-MS-MS的蛋白质组学
基于LC-MS-MS的蛋白质组学-详情蛋白质组学是对生物系统中所有蛋白质的全面分析,基于质谱的蛋白质组学已成为鉴定和量化生物体蛋白质组的shǒu选工具,随着质谱和分离方法的zuì新进展,液相色谱-串联质谱(LC-MS-MS)技术得以诞生并在包括蛋白质组学在内的各种组学研究广泛运用。LC-MS-MS 技术将质谱的高精度鉴定与色谱的分离技术结合起来,可高通量提供待测物的定性和定量分析。基于LC-MS-MS的蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组
基于SILAC的定量MS
基于SILAC的定量MS-详情SILAC(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture)细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记是一种自下而上的非靶向标记蛋白质质谱定量技术,基于SILAC的定量MS即利用依赖质谱的SILAC技术进行蛋白质定量鉴定,其鉴定的原理是将正常必需氨基酸(轻标记)和同位素修饰氨基酸(重标记)掺入细胞培养物中,使新合成的蛋白质带上轻、重同位素标记,然后提取并消化细胞中的蛋白质进行LC-MS/MS分析,根据
单细胞测序
单细胞测序-详情单细胞测序技术是指对单细胞基因组或转录组进行测序,以获得基因组、转录组或其他多组学信息,从而揭示细胞群体差异和细胞发育谱系关系。传统的测序方法一般获得的信息来自于混合细胞样品,这样测序的方式往往丢失了细胞的异质性信息。单细胞测序技术结合优化的NGS测序技术,在检测单个细胞之间的异质性、识别稀有细胞、绘制细胞图谱等方面具有jí大优势。可以帮助研究人员研究细胞功能,更好地理解细胞间分化、细
植物蛋白质组学
植物蛋白质组学-详情植物蛋白质组学(Plant Proteomics)是蛋白质组学领域的一个分支,旨在研究植物蛋白质的组成、结构、功能、相互作用及调控机制等,其研究方法与蛋白质组学类似,涉及的核心技术包括蛋白质的分离、纯化、鉴定、功能注释、相互作用研究和表达调控研究等。植物蛋白质组学的研究,不仅能为植物生长发育和逆境适应的规律提供物质基础,也能为农作物抗逆性和品质改良提供理论根据和解决途径。通过对不同生长条件下、
基质辅助激光解析电离质谱蛋白用什么溶解
基质辅助激光解析电离质谱蛋白用什么溶解-详情基质辅助激光解析电离质谱(MALDI-TOF)将蛋白样品包埋在固相基质中,利用基质将激光的能量均匀的传递给样品,避免了样品直接接受强烈的激光能量,保护蛋白质分子不受破坏而电离成碎片离子。样品的缓冲液、基质的类型以及基质和样品的混合程度都会影响电离的结果,进而影响到样品分析的分辨率、灵敏度和准确度。因此,在利用MALDI-TOF分析蛋白时缓冲液和基质的选择相当重要,蛋白缓冲
iTRAQ与TMT
iTRAQ与TMT-详情蛋白质是生命物质的重要组成成分,在组成细胞的有机化合物中占7%-10%,其种类和含量的变化与其生命活动息息相关。定量蛋白质组学通过对一个体系的全部蛋白质进行精确的定性和定量鉴定来揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。定量蛋白质组学技术主要分为标记和非标记两类,标记定量蛋白组学技术又分为体内标记和体外标记。iTRAQiTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation)是由AB SCIEX公司
交联蛋白组学分析
交联蛋白组学分析-详情交联蛋白质组学分析利用交联法进行蛋白质组学研究,主要用于解决蛋白质相互作用研究中的问题,交联法依托交联剂在两个或多个蛋白质特定氨基酸残基之间形成化学键而将相互作用的蛋白质紧密结合在一起,可以维持蛋白质间的相互作用,捕获微弱、短暂的相互作用的蛋白质根据反应进行的场所和交联剂的类型可将交联法分为体内和体外交联、同源和异源以及光敏交联。体内交联反应在细胞内进行,有利于保持蛋白活性,
泛素化修饰组学
泛素化修饰组学-详情泛素化修饰组学定义泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种广泛存在于真核生物中的蛋白翻译后修饰。泛素(Ubiquitin, Ub)本身是一种小分子多肽,在相关酶的作用下,Ub能通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为泛素化修饰。根据蛋白所连接的泛素分子的多少,可以将泛素化分为单泛素化和多泛素化;根据Ub所在的位置又将多泛素化分为多聚泛素化和线形多聚泛素化。泛素化修饰主要介导蛋白质发生降解,但随
绝对定量(aqua)蛋白质组学
绝对定量(aqua)蛋白质组学-详情定量蛋白质组学是一种强大的方法,用于发现和靶向蛋白质组学分析,以了解细胞、组织或生物体中的全部蛋白质组学动态。大多数定量蛋白质组分析需要实验组中蛋白质或肽的同位素标记,然后可以通过质谱法进行区分。基于质谱的蛋白质定量方法可以分为相对定量和jué对定量两种。相对定量方法(SILAC、ICAT、ICPL和等压标签)用于比较样品之间的蛋白质或肽丰度,而具有已知同位素标记合成肽浓度的未标记样
泛素化蛋白质鉴定
泛素化蛋白质鉴定-详情蛋白泛素化定义蛋白泛素化是一种重要的蛋白质翻译后修饰形式,常发生在真核生物体内。在ATP供能的条件下,一系列泛素化酶将小分子多肽-泛素通过三个级联反应与目标蛋白质或底物蛋白质的赖氨酸残基发生共价结合,根据蛋白质连接的泛素分子的多少以及方式,可以将泛素化分为单泛素化、多聚泛素化和线形多聚泛素化。泛素化修饰在生命活动方面具有重要的调控作用,主要介导蛋白质发生降解,此外,还参与细胞的生
抗体蛋白翻译后修饰
抗体蛋白翻译后修饰-详情蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过共价添加官能团或蛋白质,调节亚基的蛋白水解切割或整个蛋白质的降解来增加蛋白质组的功能多样性。目前已发现400多种PTMs,包括磷酸化,糖基化,泛素化,亚硝基化,甲基化,乙酰化,脂化和蛋白水解等,这些修饰作为调节各种细胞过程的关键分子调节机制发生,对蛋白质的结构和功能有重大影响并影响正常细胞生物学和发病机制的几乎所有方面。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher
蛋白质磷酸化位点检测
蛋白质磷酸化位点检测-详情蛋白质磷酸化定义蛋白质磷酸化是一类由蛋白激酶催化的重要的蛋白质翻译后修饰,在蛋白激酶的作用下,三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)的末端磷酸分子断裂,与底物蛋白的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)或酪氨酸(Tyr)残基共价结合导致蛋白质磷酸化。蛋白激酶具有特异性,不同的蛋白激酶催化不同的底物蛋白氨基酸发生磷酸化,Ser/ Thr型蛋白激酶催化底物蛋白的Ser或Thr残基发生磷酸化;Tyr型蛋白激酶
抗体蛋白糖型分析
抗体蛋白糖型分析-详情抗体(免疫球蛋白,Ig)由适应性免疫系统产生,以识别和中和宿主体内外来抗原和病原体。在人体中,五类已知的Ig(IgG,IgM,IgA,IgE和IgD)在免疫反应期间由B细胞以可变量分泌。尽管这些不同种类的Ig是从Ig结构域构建的,因此在结构上是相关的,但它们在几个方面有很大的不同,例如它们的糖基化。大量研究表明,抗体蛋白的糖基化修饰特别是半乳糖程度,与年龄、性别、遗传性、妊娠、自身免疫性疾病、传染病
分泌蛋白质组学
分泌蛋白质组学-详情分泌蛋白是由细胞分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白质组学旨在研究分泌蛋白,是蛋白质组学的一部分。百泰派克生物科技提供基于质谱的分泌蛋白质组学分析服务。分泌蛋白分泌蛋白是指在细胞内合成后分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白是由细胞分泌的任何蛋白质,无论是内分泌的还是外分泌的。分泌蛋白包括许多激素、酶、毒素和抗菌肽。在真核生物中,分泌蛋白指在粗面内质网上合成的用于“出口”的蛋白质
Co-IP质谱分析
Co-IP质谱分析-详情Co-IPCo-IP(Co-Immunoprecipitation)免疫共沉淀技术,是一种基于抗体与抗原特异结合的原理发展起来的用于研究体内蛋白质相互作用的经典方法。该技术使用非变性剂裂解细胞,保留细胞中蛋白质A-蛋白质B间的相互作用,再将其与蛋白A的专一性抗体混合,此时抗体会与蛋白A结合使其沉淀,同时蛋白B也被共沉淀下来。相互作用的蛋白质种类和数量可以通过后续的质谱分析进行鉴定,即Co-IP质谱分析。Co-IP质谱分析可以用
Label Free蛋白定量
Label Free蛋白定量-详情Label Free蛋白质是生命物质的承担者,生物体的组织或细胞内的蛋白质种类和含量的变化与其生命机能有着密切的联系。定量蛋白质组学把一个细胞、组织或生命体中所有的蛋白质或一个混合体系中(通常为体外)所有的蛋白质作为研究对象,对其进行精确的定量和鉴定,用于揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。定量蛋白组学技术包括标记和非标记两类,Label Free是一种非标记蛋白质定量技术,基于液相色谱
抗体甲硫氨酸氧化翻译后修饰
抗体甲硫氨酸氧化翻译后修饰-详情甲硫氨酸又称蛋氨酸(Met),其与半胱氨酸是仅有的两种天然含硫氨基酸,硫原子在催化、金属结合、氧化还原调节以及其他翻译后修饰中起到十分关键作用。抗体甲硫氨酸氧化是指抗体蛋白中的甲硫氨酸残基发生了氧化,是上百种翻译后修饰类型中的一种,这种氧化反应是可逆的,抗体蛋白甲硫氨酸的氧化和去氧化修饰对调节体内动态平衡和信号转导具有重要意义,在阐明关键蛋白/多肽的功能方面也具有特别的
Edman测序
Edman测序-详情Edman测序原理Edman测序又称Edman降解法测序,是由埃德曼在上世纪50年代创立的用于测定蛋白质一级结构的方法。Edman测序基本原理是将蛋白多肽的N端氨基酸用化学方法依次断裂,每次只断裂一个氨基酸,通过高效液相色谱(HPLC)分析断裂后氨基酸片段,再将少了一个氨基酸的多肽链回收,重复进行以上操作,直到zuì后鉴定出整条多肽链的氨基酸排列顺序。Edman测序技术Edman测序技术每一次循环只能鉴定一个氨基酸,大致
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