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  • 转录组学与脂质组学整合分析

    转录组学与脂质组学整合分析

    转录组学与脂质组学整合分析-详情转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA的集合,转录组学是在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控的规律。脂质组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的所有脂质的集合,脂质组学是代谢组学的一个重要分支,是在整体水平上分析和鉴定生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子。结合转录组学与脂质组学数据进行整合分析,可以更系统全面地解析生物脂质分子功能和调控机

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    2023-09-18 13:09

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  • 蛋白质从头测序原理解析

    蛋白质从头测序原理解析

    蛋白质从头测序原理解析-详情导读• 蛋白质从头测序是什么?• 蛋白质从头测序分析流程是什么?• 蛋白质从头测序数据分析的理论基础是什么?一、蛋白质从头测序的原理简单来说蛋白质从头测序就是不依赖于任何现有的DNA或者蛋白质的数据库信息,直接对蛋白质氨基酸序列进行测定。蛋白质从头测序的原理是基于蛋白酶切后的肽段分子在质谱检测中有规律性的断裂,找到特定断裂模式,再根据质谱峰之间质量差即可算出对应的氨基酸信息,

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  • 蛋白糖基化

    蛋白糖基化

    蛋白糖基化-详情蛋白质糖基化是指短链的碳水化合物残基(寡糖或聚糖)通过糖苷键共价结合在蛋白肽链的特定氨基酸残基的过程。连接在蛋白质上的寡糖或聚糖就称为糖链。由于糖链结构的多样性、复杂性和不均一性,使得蛋白糖基化修饰成为zuì复杂的翻译后修饰方式之一。根据糖基化发生的氨基酸位点以及糖链的种类,可以将糖基化分为N-连接糖基化、O-连接糖基化以及糖基磷脂酰肌醇锚糖三类。蛋白糖基化具有重要的生物学功能,糖基化蛋

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  • 代谢组与16S rDNA测序整合分析

    代谢组与16S rDNA测序整合分析

    代谢组与16S rDNA测序整合分析-详情代谢组学是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的大规模研究。16S rDNA是编码16S rRNA的基因,存在于所有细菌基因组。16S rDNA既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,目前被广泛用于病原菌的检测和鉴定,以及不同微生物群落的属或种系统进化分类。整合分析16S rDNA测序数据和代谢组学数据,可揭示特定菌群与特定代谢物(群)之间的关联性,

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  • 蛋白从头测序和突变分析

    蛋白从头测序和突变分析

    蛋白从头测序和突变分析-详情蛋白质在生物体中发挥着广泛的功能,蛋白突变可能会引起蛋白质的功能异常和失活。蛋白突变还可以应用于酶工程和医药工程。百泰派克生物科技提供基于质谱的蛋白从头测序和蛋白突变分析服务。蛋白突变分析蛋白质与生命活动息息相关,在生物体中发挥着广泛的功能,包括催化代谢反应、DNA复制、对刺激作出反应、为细胞和生物体提供结构,以及将分子从一个位置运输到另一个位置。蛋白质序列是由基因决定的,

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  • 蛋白糖检测

    蛋白糖检测

    蛋白糖检测-详情蛋白糖是指发生了糖基化修饰的蛋白质,也称糖蛋白。蛋白糖检测主要就是鉴定一个蛋白质是否发生了糖基化修饰。糖蛋白检测可以通过分离富集糖基化蛋白质的技术来实现,如凝集素亲和技术、肼化学富集法以及凝胶色谱技术等。凝集素可以专一性识别并结合某一特异性的单糖或寡糖中特定的糖基序列。含糖蛋白的蛋白质样品或经酶切的聚糖肽可以按照顺序通过多种凝集素亲和色谱柱,从而筛选出不同的聚糖蛋白或聚糖肽,用于后

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  • 蛋白质乙酰化修饰定量分析基础知识

    蛋白质乙酰化修饰定量分析基础知识

    蛋白质乙酰化修饰定量分析基础知识-详情导读• 蛋白质乙酰化修饰定义• 蛋白质乙酰化修饰功能• 组蛋白乙酰化调控过程• 蛋白质乙酰化修饰位点鉴定流程• 蛋白质乙酰化修饰组学定量分析流程蛋白质在细胞中经过翻译后,到被运输到相应的细胞器并且发生特定的生物学作用前会经过很重要的一步加工,那就是蛋白质翻译后修饰加工。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性、定位或功能。通过蛋白质翻译后修饰也进一步增加了细胞通

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  • 蛋白圆二色谱

    蛋白圆二色谱

    蛋白圆二色谱-详情圆二色谱(circular dichroism, CD)是基于光活性物质的圆二色性发展起来的一种研究化合物空间结构的分析技术,又称圆二色光谱。蛋白质的不对称空间结构如α-螺旋、β-折叠、β-转角等使其具有圆二色性,是一种典型的光学活性物质,因此可利用圆二色谱对其空间结构进行分析。当使用平面偏振光照射蛋白质时,蛋白质对左右偏振光的吸收度不同,以不同频率的平面偏振光的波长λ作为横坐标,左(εL)、右(εR)偏振

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  • 翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析

    翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析

    翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析-详情蛋白质的翻译后修饰(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程。翻译后修饰蛋白质组是指细胞或组织等整体水平上的翻译后修饰蛋白质。目前,已知的蛋白质翻译后修饰主要包括糖基化、磷酸化、酰化、泛素化、二硫键配对、甲基化和亚硝基化等等。代谢组是细胞、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的整体水平。翻译后修饰蛋白质可以调

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  • 蛋白磷酸化鉴定技术介绍

    蛋白磷酸化鉴定技术介绍

    蛋白磷酸化鉴定技术介绍-详情蛋白质表达以后,在发挥真正功能之前,会经过多种不同的翻译后修饰,例如,磷酸化,乙酰化,糖基化等基团修饰。本文主要讲下两种研究蛋白磷酸化修饰的方法:Western Blot和质谱检测法。蛋白质翻译后修饰种类蛋白磷酸化修饰过程蛋白磷酸化修饰这一过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、苏氨酸,或酪氨酸残基上。并且磷酸化修饰的过程是可逆的,去磷酸化反应由蛋白磷酸酶催化

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  • 蛋白质等电点的测定

    蛋白质等电点的测定

    蛋白质等电点的测定-详情蛋白质表面存在一些酸碱性离子基团,如氨基、羧基、酚基、巯基等,因此蛋白质与氨基酸一样本身带有净电荷。在不同pH的溶液中解离所带的正负电荷不同,在某一pH值的溶液中,其解离的正负电荷相等,这时溶液的pH值就称为蛋白的等电点(isoelectric point, pI)。蛋白质的等电点与其空间结构有关,因此对于某一特定蛋白质来说其等电点也是固定的。当蛋白质处于与其等电点相同pH的溶液中时,在该溶液中的溶解度

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  • 定量蛋白组分析

    定量蛋白组分析

    定量蛋白组分析-详情细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中,常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。目前定量蛋白质组学技术主要分为标记(Label)和非标记的(Label Free)定量策略,其中标记策略又分为体内标记(如 SILAC、15^N 标记),以及体外标记(如 iTRAQ、TMT 标

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  • 蛋白质磷酸化修饰类别、富集和鉴定方法

    蛋白质磷酸化修饰类别、富集和鉴定方法

    蛋白质磷酸化修饰类别、富集和鉴定方法-详情导读• 蛋白质磷酸化修饰定义?• 蛋白质磷酸化修饰类别?• 蛋白质磷酸化鉴定方法有哪些?• 蛋白质磷酸化肽段富集方法?在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生过磷酸化修饰,在脊椎动物基因中,约有5%的基因编码的蛋白质是参与磷酸化和去磷酸化过程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程

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  • 怎么测蛋白磷酸化

    怎么测蛋白磷酸化

    怎么测蛋白磷酸化-详情蛋白磷酸化检测shǒu先要明确该蛋白样品是否发生磷酸化修饰,如有磷酸化修饰,那么再分析发生磷酸化的氨基酸位点以及发生磷酸化的肽段含量。目前蛋白质磷酸化分析的方法主要有放射性标记法(32P)、免疫印迹法、荧光染色法和质谱法等。放射性标记法先用32P标记ATP,通过细胞代谢标记到磷酸化蛋白质上,再经一维或二维凝胶电泳或色谱法进行分离,zuì后通过放射自显影进行检测。免疫印迹法基于抗体特异性结合

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  • 单细胞质谱流式技术分析

    单细胞质谱流式技术分析

    单细胞质谱流式技术分析-详情随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的研究需要了,我们需要更进一步了解细胞之间的差异性,于是针对单细胞的各类研究技术应运而生。单细胞质谱流式(Mass Cytometry)技术是利用质谱技术对单细胞进行多参数检测的流式技术,它既有传统流式细胞术能够高速分析的特点,又兼并了质谱检测的高分辨能力。单细胞测序和质谱流式都是目前非常强大的技术,越来越多的高分文献都是将两者结

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  • 基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

    基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

    基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现-详情所有经由HLA-I、II分子呈递在细胞表面,供T细胞检测识别的短肽,称为免疫多肽组(Immunopeptidome)。免疫多肽组学分析,旨在研究I型和II型免疫肽的动力学和组成。免疫多肽组学的深入表征可以应用于癌症、免疫疾病和传染病的新疗法的开发。免疫肽是由有核细胞在HLA或MHC抗原呈递途径的I型和II型蛋白上提交的全部肽。它在细胞介导和体液反应中定义免疫原性表位是必不可少的。确定

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  • 基于LC-MS-MS的蛋白质组学

    基于LC-MS-MS的蛋白质组学

    基于LC-MS-MS的蛋白质组学-详情蛋白质组学是对生物系统中所有蛋白质的全面分析,基于质谱的蛋白质组学已成为鉴定和量化生物体蛋白质组的shǒu选工具,随着质谱和分离方法的zuì新进展,液相色谱-串联质谱(LC-MS-MS)技术得以诞生并在包括蛋白质组学在内的各种组学研究广泛运用。LC-MS-MS 技术将质谱的高精度鉴定与色谱的分离技术结合起来,可高通量提供待测物的定性和定量分析。基于LC-MS-MS的蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组

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  • 基于SILAC的定量MS

    基于SILAC的定量MS

    基于SILAC的定量MS-详情SILAC(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture)细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记是一种自下而上的非靶向标记蛋白质质谱定量技术,基于SILAC的定量MS即利用依赖质谱的SILAC技术进行蛋白质定量鉴定,其鉴定的原理是将正常必需氨基酸(轻标记)和同位素修饰氨基酸(重标记)掺入细胞培养物中,使新合成的蛋白质带上轻、重同位素标记,然后提取并消化细胞中的蛋白质进行LC-MS/MS分析,根据

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  • 单细胞测序

    单细胞测序

    单细胞测序-详情单细胞测序技术是指对单细胞基因组或转录组进行测序,以获得基因组、转录组或其他多组学信息,从而揭示细胞群体差异和细胞发育谱系关系。传统的测序方法一般获得的信息来自于混合细胞样品,这样测序的方式往往丢失了细胞的异质性信息。单细胞测序技术结合优化的NGS测序技术,在检测单个细胞之间的异质性、识别稀有细胞、绘制细胞图谱等方面具有jí大优势。可以帮助研究人员研究细胞功能,更好地理解细胞间分化、细

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  • 植物蛋白质组学

    植物蛋白质组学

    植物蛋白质组学-详情植物蛋白质组学(Plant Proteomics)是蛋白质组学领域的一个分支,旨在研究植物蛋白质的组成、结构、功能、相互作用及调控机制等,其研究方法与蛋白质组学类似,涉及的核心技术包括蛋白质的分离、纯化、鉴定、功能注释、相互作用研究和表达调控研究等。植物蛋白质组学的研究,不仅能为植物生长发育和逆境适应的规律提供物质基础,也能为农作物抗逆性和品质改良提供理论根据和解决途径。通过对不同生长条件下、

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