DIA蛋白质组学研究流程及样品前处理

DIA蛋白质组学研究流程及样品前处理-详情DIA蛋白质组学基于全息式采集模式的质谱技术对蛋白质组进行相关研究，理论上可采集所有肽段离子的一级和二级质谱信息，对蛋白质进行高精确度的检测分析，常用于蛋白质的相对和jué对定量分析。DIA蛋白质组学研究流程大致为将提纯后的蛋白粗提取物酶切消化成小分子肽段，依次进行高效液相色谱分离和SWATH模式下的质谱检测，zuì后将质谱数据结合相关软件和生物信息学分析转换为我们需要的生

DIA蛋白质组学和iTRAQ分析

DIA蛋白质组学和iTRAQ分析-详情DIA是一种质谱分析中使用的数据采集方式，即数据非依赖性采集模式，在这种采集模式下，不用预先设定条件对肽段母离子进行筛选，而是将整个质谱扫描范围分为多个不同的小窗口，依次并循环的对每个窗口的所有离子进行高速的碎裂、扫描和检测，理论上可获取所有离子的碎片信息。DIA蛋白质组学就是利用基于DIA采集模式的质谱技术对蛋白质组学进行研究，SWATH是zuì常见的一种DIA蛋白质组学技术, SWATH技

DIA蛋白质组学分析步骤

DIA蛋白质组学分析步骤-详情DIA蛋白质组学利用基于数据非依赖采集模式的质谱技术进行蛋白质组学研究，可对复杂的、大规模的蛋白样本进行高分辨率和高灵敏度的精确定量鉴定。DIA蛋白质组学分析步骤：（1）将分离纯化后的蛋白提取物通过多重酶切反应酶切消化成小分子肽段，（2）然后利用高效液相色谱对肽段进行分离，（3）对分离后的肽段在SWATH模式下进行质谱检测，（4）zuì后结合相关软件和生物信息学分析手段对质谱数据进行深度

DIA蛋白质组学

DIA蛋白质组学-详情联系我们点击立即咨询点击提交需求科研服务电话：182-4221-8588访问品牌官网其它服务项目蛋白分析蛋白鉴定分子量测定肽质量指纹图谱分析基于Edman降解的蛋白质N端测序Pull-down靶蛋白质谱鉴定Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定蛋白测序蛋白质N/C端测序蛋白全序列测定标记转移法蛋白相互作用分析单克隆抗体从头测序蛋白从头测序和突变分析SILAC与免疫共沉淀质谱联用蛋白质相互作用分析蛋白质相互作用质谱分析GST pull-down

Pull down

Pull down-详情Pull down实验，又称拉下实验，是一种体外亲和纯化技术，蛋白Pull down技术可以提供一种诱饵蛋白来特异性识别配体蛋白质，以达到富集、分离、纯化某种配体蛋白质的目的，是体外研究蛋白与蛋白相互作用的有力工具。蛋白质Pull down将被亲和试剂标签（如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸六肽、生物素）标记的诱饵蛋白固定在某种固体基质（如琼脂糖）上，当目标蛋白或细胞、组织抽提液流经该基质时，可与该诱饵蛋白相互作用的

DDA和PRM

DDA和PRM-详情DDA（Data Dependent Acquisition）和PRM（Parallel Reaction Monitoring）是两种不同的质谱数据采集模式。DDA数据依赖采集模式主要用于非靶向蛋白质组学的研究，PRM平行反应监测则多用于靶向蛋白质组学的研究。DDA采集模式在非靶向蛋白质定量研究中应用广泛，常见的蛋白质定量技术如Label Free、iTRAQ、TMT和SILAC等都是基于DDA采集模式的质谱分析技术。DDA依赖于预先设定的母离子筛选条件选择合适的母离子进行二级

DDA和DIA

DDA和DIA-详情DDA（Data Dependent Acquisition）和DIA（Data Independent Acquisition）是质谱分析中常用的两种数据采集模式。DDA数据依赖采集模式，是zuì原始zuì简单的数据采集模式，在进行一级质谱分析后，根据设定的筛选条件筛选母离子进行二级质谱分析，可获得更多的碎片信息。该方法筛选目标离子采用的窗口较窄，在一定上可减少干扰离子的存在，但是也会导致一些离子峰强度较高的离子被当成目标离子进行二级质谱分析，从而

DDA分析的非靶向蛋白质组学

DDA分析的非靶向蛋白质组学-详情非靶向蛋白质组学是相对于靶向蛋白质组学而言的，靶向蛋白质组学即靶向定量蛋白质组学，基于高分辨质谱仪对目标蛋白质或多肽进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质或多肽的精准定量。非靶向蛋白质组学顾名思义，对研究对象没有强烈的针对性，可对混合体系中的蛋白质或多肽进行精确定量。DDA是质谱分析中的一种数据依赖型采集模式，基于DDA采集模式进行非靶向定量蛋白组质组学研究分为标记和非标记两

DDA蛋白质组学

DDA蛋白质组学-详情DDA（Data Dependent Acquisition）是一种质谱分析中zuì传统和zuì简单的数据采集模式——数据依赖型扫描模式。DDA蛋白质组学就是利用基于DDA采集模式的质谱技术进行蛋白质组学研究。基于DDA数据依赖型扫描模式的蛋白质组学研究可以同时获得被测肽段离子的一级质谱和碎片信息，先进行肽段离子全扫描，然后根据预先设定的条件如母离子强度、信噪比和同位素分布等筛选母离子进行二级质谱扫描，以获取更多的碎片信

C末端氨基酸测序

C末端氨基酸测序-详情C端氨基酸测序法主要有羧肽酶法、化学法和基于质谱的方法等，羧肽酶法和串联质谱法是zuì常用的C末端氨基酸序列分析方法。羧肽酶是一种专一性水解C末端氨基酸的蛋白酶，可从蛋白质C端开始逐个释放氨基酸残基，然后再通过色谱法或质谱法对切割的氨基酸进行逐一鉴定。质谱法不需要使用专一性的切割酶，利用常规的蛋白水解酶如胰蛋白酶等对蛋白质进行酶解消化，将获得的肽段混合物进行串联质谱分析，再根据相应的

C端测序

C端测序-详情蛋白质是由氨基酸脱水缩合形成的链状高分子化合物，包含氨基端（—NH2，N端）和羧基端（—COOH，C端）两个末端。C端是蛋白质重要的结构和功能部位，一些特殊的翻译后修饰如C端剪切等，通过影响蛋白质的结构进而影响其生物学功能。因此，对蛋白C末端的氨基酸种类和序列进行研究有助于揭示蛋白的结构和功能。当前C末端测序技术尚未成熟，常用的C末端测序方法主要有羧肽酶法、化学法和基于质谱的方法等。羧肽酶法和化学法

Co-IP交联的作用

Co-IP交联的作用-详情Co-IP（Co-Immunoprecipitation）——免疫共沉淀是一种以抗原抗体特异性结合为原理，研究蛋白质与蛋白质相互作用的经典技术。Co-IPzuì主要的作用就是将细胞裂解液或蛋白混合液中相互作用的蛋白质通过免疫结合反应沉淀下来，再结合其他技术对免疫沉淀蛋白复合物进行鉴定。Co-IP免疫共沉淀利用抗原与相互作用的蛋白质复合体特异性结合，再通过抗体与抗原特异性结合作用捕获细胞裂解液或蛋白混合物中与抗原结合

Co-IP分析蛋白互作的优缺点

Co-IP分析蛋白互作的优缺点-详情免疫共沉淀Co-IP（Co-Immunoprecipitation）是经典的蛋白质相互作用研究技术，其以抗原抗体发生特异性的免疫反应为基础来研究细胞裂解液或蛋白混合物中的已知或未知蛋白质与蛋白质之间相互作用。Co-IP技术在研究蛋白相互作用中具有一定优势，当然也存在一些缺点或局限。Co-IP技术的优点（1）蛋白质以较稳定的翻译后修饰的天然状态存在；（2）所检测的产物为蛋白粗提取物；（3） 使用非变性剂裂解细

Co-IP蛋白预测

Co-IP蛋白预测-详情免疫共沉淀Co-IP（Co-Immunoprecipitation）是以抗原抗体特异性结合为基础的一种研究已知或未知蛋白质与蛋白质之间相互作用的技术。Co-IP蛋白预测的大致流程：在细胞裂解液或蛋白混合物种加入特异性抗体，此时，抗体、抗原以及与抗原相互结合的蛋白质通过抗原与抗体之间的特异性结合形成免疫沉淀复合物，经过纯化、洗脱步骤收集免疫沉淀复合物，zuì后结合其它技术如质谱技术、免疫印迹以及SDS聚丙烯电泳等实现

Co-IP蛋白能做质谱吗

Co-IP蛋白能做质谱吗-详情Co-IP（Co-Immunoprecipitation）即免疫共沉淀，是一种基于抗原抗体特异性结合的原理发展起来的一种研究蛋白质之间相互作用的技术。Co-IP能将细胞裂解液或混合体系中相互结合的蛋白复合体沉淀出来，但是不能对其进行鉴定。因此，通常需要结合质谱技术对该相互作用的蛋白复合体进行后续的定性鉴定。免疫共沉淀结合质谱技术可以用于验证已知的蛋白质相互作用，也可以用于寻找未知的蛋白相互作用。百泰派克生

O-GlcNAc糖基化

O-GlcNAc糖基化-详情糖基化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰，旨在蛋白质合成时或合成后在特定的糖基化位点加上短链的碳水化合物残基（寡糖或聚糖）的过程。糖蛋白中糖与肽链以糖苷键共价连接，有3种主要的类型：N-连接糖基化、O-连接糖基化和糖基磷脂酰肌醇锚。O型糖与肽链上的Ser或Thr的自由羟基形成O-型糖苷键共价结合的过程就称为O-GlcNAc糖基化或O-连接糖基化、O-糖基化。该过程中糖基转移酶OGT利用核糖UDP-GlcNAc上的N-乙酰

C末端测序

C末端测序-详情C端（羧基端）序列是蛋白质和多肽一级结构的重要组成部分，也是蛋白质的功能部位。此外，蛋白质C末端还能发生一些特殊的翻译后修饰，如C端剪切等，在一定程度上影响蛋白质的结构，发挥特定的生物学功能。因此，对蛋白C末端的氨基酸种类和序列进行分析，在研究蛋白的结构和功能方面起着非常重要的作用。目前，C末端测序技术还不够成熟，常用的C末端测序方法主要有羧肽酶法、化学法和质谱法等，每种方法都存在自身的局

CD36糖基化

CD36糖基化-详情糖基化是指蛋白质上特定氨基酸共价结合短链碳水化合物（寡糖或聚糖）的过程，是真核生物中重要的蛋白质翻译后修饰方式之一。糖基化修饰通过影响蛋白质的折叠、定位、结构、运输以及生物活性等来实现各种生物学功能，如细胞识别、信号传导以及免疫应答等。CD36（cluster of differentiation 36）即白细胞分化抗原36，属多配体B型清道夫受体，是一种高度糖基化的细胞表面单链跨膜糖蛋白，广泛分布于不同细胞表面，与

Bottom-up蛋白质研究

Bottom-up蛋白质研究-详情质谱技术是目前进行蛋白质组学研究zuì常用zuì先进的技术手段，可以实现蛋白质的定性定量鉴定、结构分析、蛋白相互作用分析以及翻译后修饰分析等。根据质谱分析的对象可以将其分为不同的分析策略：自上而下（Top-down）和自下而上（Bottom-up）。Top-down策略以完整蛋白质为直接分析对象，Bottom-up策略将完整的蛋白质或多肽大分子酶解消化为小片段的肽段，以小分子肽段为直接研究对象，这种从肽段分析到

AQUA法

AQUA法-详情AQUA即蛋白jué对定量分析，是一种常用的基于质谱的靶向定量蛋白质组学技术。基于质谱的蛋白质jué对定量技术分为标记和非标记（Label Free）两种策略，AQUA法jué对定量分析就是利用同位素标记的肽段作为内标实现蛋白质的jué对定量。要进行蛋白质含量的jué对定量，就必须依据一个已知浓度的内标将相对定量数值转换为jué对定量数值。AQUAjué对定量分析将稳定同位素标记的合成肽作为内标，以区分天然肽，然后利用类