转录和蛋白组学
转录和蛋白组学-详情生物体的遗传信息遵循中心表达法则,DNA中包含的遗传信息通过转录传递到mRNA,再通过翻译表达形成具有生物学功能的蛋白质。转录组就是在一定时期或生理条件下机体表达的全部mRNA,蛋白组则是在一定时期或生理条件下机体表达的全部蛋白质。转录组是连接基因组和蛋白组的中间状态。转录组和蛋白组联合分析,就是对转录组数据和蛋白质组数据进行关联分析,获取一定时期内机体mRNA和蛋白的表达情况,利用转录组和蛋
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2023-09-11 09:30
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蛋白质的二级结构测定
蛋白质的二级结构测定-详情蛋白质的二级结构是指蛋白质主链折叠产生的由氢键维系的有规则的构象,包括三种zuì主要的结构原件,α螺旋(H)、β折叠子(E)和无规则卷曲(C)。蛋白质的二级结构是联系一级结构和三级结构的桥梁,所以二级结构的预测可为三级结构预测提供很好的起始条件。蛋白质二级结构检测的基本原理就是通过对结构已经测定的蛋白质序列和其二级结构对应关系的统计分析,归纳出一些预测规则,用于待测蛋白的二级结
LC-MS-MS法鉴定磷酸化位点
LC-MS-MS法鉴定磷酸化位点-详情蛋白磷酸化指蛋白质肽链上特定氨基酸共价结合磷酸基团的过程,结合磷酸基团的氨基酸的种类以及其处于多肽链中的位置就称为磷酸化位点。真核生物的磷酸化主要发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸等氨基酸残基上,而原核生物磷酸化主要发生在组氨酸、精氨酸和赖氨酸等残基上。利用液相色谱串联质谱技术LC-MS-MS鉴定磷酸化位点需要先鉴定发生磷酸化的肽段,在此基础上进行磷酸化位点分析。基于LC-MS-MS的磷酸
LC-MS怎么分析蛋白有没有磷酸化
LC-MS怎么分析蛋白有没有磷酸化-详情蛋白磷酸化就是在酶的作用下蛋白质的特定氨基酸共价结合磷酸基团的过程。发生了磷酸化修饰的蛋白质比没有发生修饰的蛋白质分子质量增加了磷酸基团的质量,液相色谱串联质谱技术(LC-MS)就是通过分析这种分子质量变化来判断蛋白是否发生磷酸化修饰。对于一个特定的已知序列得蛋白质,其分子质量是确定的,磷酸基团的分子质量也是已知的,通过质谱检测各肽段的分子质量,若其分子质量刚好增加了
ITS全序列与18S全序列
ITS全序列与18S全序列-详情真核生物rDNA基因编码核糖体RNA(rRNA),rDNA基因由转录区和非转录区组成,转录区包括5S、5.8S、18S和28S rDNA,分别编码5S、5.8S、18S和28S rRNA,在转录区的各rDNA之间还存在一段内转录间隔区ITS。ITS(internal transcribed space)序列是真核生物rDNA基因的内转录区域,存在于18S和5.8S rDNA以及5.8S和28S rDNA之间。其长度和序列在不同种属之间具有一定的多态性,是一段既保守又具有特异
ITS区域全长序列
ITS区域全长序列-详情ITS(internal transcribed space)是存在于真核生物中的一段rDNA转录间隔区。rDNA是编码核糖体RNA(rRNA)的基因,由转录区和非转录区组成,转录区包括18S、5.8S和28S rDNA基因,内转录间隔区ITS位于18S和5.8S rDNA之间以及5.8S和28S rDNA之间。ITS序列长度适中,从酵母到人类的各种真核生物中,ITS的序列长度在300-1000bp之间不等。其序列进化速度快,在不同种属物种之间具有一定的特异性,将其进行PCR扩增
iTRAQ差异蛋白筛选
iTRAQ差异蛋白筛选-详情差异蛋白筛选是差异蛋白组学研究的主要内容之一,主要是筛选不同处理条件下各样本间或同一样本不同时期表达水平存在显著差异的蛋白质,旨在寻找和筛选有意义的差异蛋白,揭示生命活动规律、生物体的调控机理以及响应外界刺激的信号通路等。已知的蛋白含量是进行差异蛋白筛选的前提条件,因此对样本的各蛋白组分进行精确定量至关重要。iTRAQ(同位素标记相对和jué对定量)是一种基于标签的蛋白质质谱定量技
IP胶条测序
IP胶条测序-详情蛋白混合物进行免疫沉淀反应(IP)后,可以得到与目标蛋白相互作用的靶蛋白,此时一般需要对靶蛋白进行进一步的鉴定,如分子量、含量、翻译后修饰以及一级结构表征等,以全面了解靶蛋白的相关信息。凝胶电泳是检测分子量zuì简单的方法,将IP免疫沉淀获得的靶蛋白进行凝胶电泳,电泳结束后蛋白胶条所处的位置对应的Maker的大小就是该靶蛋白的分子质量,此时如还要进行靶蛋白一级结构分析,可以将该蛋白胶条进行回收
HPLC多肽分子量测定
HPLC多肽分子量测定-详情分子量是化合物的基本理化参数,指组成化合物的各原子的相对原子质量之和,也是蛋白质/多肽的重要特征参数之一,在蛋白质/多肽的鉴定中扮演着十分重要的角色,分子质量的正确与否也是判断其结构正确与否的一个重要指标。常用的蛋白质/多肽的分子量鉴定方法包括SDS-凝胶电法、粘度法、凝胶渗透色谱法、凝胶过滤层析法以及质谱法等。凝胶渗透色谱法(Gel Permeation Chromatography,GPC)和凝胶过滤层析法(
HPLC蛋白纯度
HPLC蛋白纯度-详情HPLC(High Performance Liquid Chromatography)高效液相色谱法,也称为高压液相色谱,是一种用于分离、鉴定和量化混合物中的每种成分的分析化学技术。它依靠高压泵将含有样品混合物的液体通过充满固体吸附材料的色谱柱,样品中的每种成分与吸附材料的相互作用略有不同,导致不同成分的流速不同,并导致成分在流出色谱柱时发生分离。蛋白质纯度是蛋白质分析研究中一个重要的理化参数,不纯的蛋白质样本可能会导
免疫共沉淀结合蛋白质质谱
免疫共沉淀结合蛋白质质谱-详情免疫共沉淀技术(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是利用抗体与抗原特异结合的原理研究体内蛋白质相互作用的经典方法。该技术使用非变性剂裂解细胞,保留细胞中蛋白质A-蛋白质B间的相互作用,再将其与蛋白A的专一性抗体混合,此时抗体会与蛋白A结合使其沉淀,同时蛋白B也被共沉淀下来。免疫共沉淀结合蛋白质质谱就是将Co-IP得到的两种蛋白质利用质谱技术进行后续定性和定量分析。Co-IP质谱分析可以用
非标记定量蛋白质组
非标记定量蛋白质组-详情当前用于蛋白定量的方法可分为标记策略和非标记策略,标记策略是利用同位素标签进行体外或体内标记蛋白,再将标记蛋白进行量化检测。非标记策略不使用同位素标签,直接对蛋白样本进行分析。常用的非标记定量蛋白质策略主要包括荧光染料法、基于质谱的Label Free技术等。荧光染料法利用荧光染料对电泳分离的蛋白进行染色,通过荧光成像仪成像,以数字化形式采集和保存相关信息,依靠软件分析进行图谱的点检
De novo测序
De novo测序-详情De novo测序,又称从头测序,是一项不依赖于任何已知或参考序列的测序技术,它利用生物信息学分析技术将序列片段进行拼接、组装以实现整个序列的鉴定,可用于未知基因组、转录组和蛋白质的全序列分析。从头测序zuì重要、zuì关键的就是对已测得的小片段进行拼接、组装,如果在这个过程中发生拼接错误,那么将会导致整个测序结果不准确。因此,在测序前将待测样品进行多重酶切以及对序列进行反向验证是保证片段全
蛋白组学种类
蛋白组学种类-详情蛋白质组学就是研究某个机体表达的全套蛋白质或一个体系内所有蛋白质的科学,旨在对蛋白质进行全面综合分析以揭示生命活动的规律和分子机制。根据不同的研究目的,可以将蛋白组学分为表达蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构蛋白质组学三大分支。表达蛋白质组学是观察某种细胞或组织中蛋白质的整体表达,分析不同状态条件下蛋白质表达量变化的科学。表达蛋白质组学侧重于用图谱的方式显示、衡量和分析蛋白质表达的
蛋白组学iTRAQ是绝对定量还是相对定量
蛋白组学iTRAQ是绝对定量还是相对定量-详情iTRAQ即同位素标记相对定量和jué对定量等压标签,是美国AB SCIEX公司开发的一种体外肽标记定量蛋白质组学研究技术。其基于4种或8种同位素标签实现氨基酸基团的特异性标记,将标记的样品通过色谱分离并进行串联质谱分析,根据报告基团的质谱峰强度或峰面积可以对每一个肽段进行相对定量;如果合成一个内标肽,同时用iTRAQ试剂标记,就可以通过加入的内标肽和待测肽段报告基团的峰强度或峰
蛋白组差异分析
蛋白组差异分析-详情蛋白质是细胞功能的直接执行者,由于细胞或组织中蛋白质种类和含量有所差异,因此它们行使不同的生物学功能,扮演不同的角色。蛋白组差异分析就是分析不同样本如正常与病理状态样本、未处理与特殊处理条件下样本之间蛋白种类和含量的差异,通过寻找有意义的差异蛋白来揭示样本的生理或病理变化的分子机制。差异蛋白组学在揭示生命活动的本质方面扮演着重要的角色,广泛应用于各类疾病的发生研究、临床诊断以及
蛋白质组学检测采样
蛋白质组学检测采样-详情蛋白质组学分析需要有合乎检测标准的蛋白样本,准备好的样本就是实验取得成功的前提条件,不同类型蛋白样品的收集与预处理有不同的要求。动植物常规器官组织样本如根、茎、叶、花、心、肝、脾、脑等通常需要使用PBS将表面的污渍清洗干净,并去除无关干扰组织,再切成大小适宜的小块,zuì后用液氮速冻,于-80℃保存。细胞类样本如细菌、培养细胞等需先离心收集细胞沉淀,再用预冷的PBS进行重悬清洗,再离心
泛素蛋白组学
泛素蛋白组学-详情泛素(Ubiquitin,Ub)本身是一种小分子多肽,在相关酶的作用下,Ub通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为泛素化修饰。泛素化修饰(Ubiquitylation)是一种广泛存在于真核生物中的蛋白翻译后修饰。泛素蛋白组学就是以泛素化蛋白质为研究对象,探究其随各种生命进程的变化规律的科学。泛素化修饰主要介导蛋白质发生降解,但随着蛋白泛素化修饰的深入研究,人们发现泛素化修饰还可以参与调节其他的
多组学
多组学-详情随着高通量测序技术的发展,基因组、蛋白质组、转录组、代谢组、微生物组和脂质组等的数据被大量挖掘并应用于各类研究。为进行更深入的生命科学研究,满足系统学研究的需要,多组学应运而生。多组学将不同的组学数据进行整合分析,挖掘单一组学研究不能获取的数据,全面系统的分析各类物质的相互作用网络,促进我们更深刻的理解生理过程和分子机制,为网络生物学、系统生物学的研究提供了重要的技术手段。百泰派克生物
免疫共沉淀
免疫共沉淀-详情免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)是在免疫沉淀的基础上发展起来的研究蛋白质相互作用的分析技术,是免疫沉淀技术的补充和延伸。很多刚入门的小白可能对免疫共沉淀Co-IP还不是很了解,所以今天小编带大家一起来了解免疫共沉淀的技术原理。免疫共沉淀基于抗体与抗原特异结合的原理,利用专一性抗体特异性识别混合体系中两个相互作用的蛋白质中的其中一个,然后将两者一起沉淀出来,用来鉴定两种已知蛋白
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硫酸亚铁 七水 分析纯沪试 西陇化工/国药试剂
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