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  • 代谢组学植物

    代谢组学植物

    代谢组学植物-详情代谢组学是研究生物体、器官、组织以及细胞所产生的所有小分子代谢物科学,植物代谢组学顾名思义就是专门研究各种植物体所产生的全部代谢物,主要是对不同物种在不同生长时期或受某种刺激前后所表达的所有小分子代谢产物进行定性、定量分析,是代谢组学的一个重要分支。植物的种类和数目庞大,目前已知的植物有30万余种,其产生的初生代谢物和次生代谢物的种类更为惊人,这些结构迥异的代谢物不仅在植物体的生理

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  • 代谢组学用血清还是血浆

    代谢组学用血清还是血浆

    代谢组学用血清还是血浆-详情血液是常用的也是重要的代谢组学分析样本,通过不同的收集处理方式可以制备不同的血液样本:血清和血浆。血清是离体血液自然凝固后离心收集的上清液,主要包括各种蛋白、多肽、氨基酸、脂类、碳水化合物、生长因子、激素、无机物等。血浆是离体血液加入抗凝剂后离心收集的上清液,与血清相比,血浆中含有纤维蛋白原,也可以说血清是不含纤维蛋白原的血浆。总之,血清和血浆所含的内容物种类差别不大,

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  • 代谢组学如何鉴别代谢物

    代谢组学如何鉴别代谢物

    代谢组学如何鉴别代谢物-详情代谢物的鉴定是代谢组学(Metabolomics)研究的重要内容之一,鉴定代谢物就是确定代谢物的种类,对代谢物进行定性鉴定。质谱法(MS)和核磁共振法(NMR)是代谢组学zuì常用的分析方法,二者均可实现代谢物的定性鉴定。质谱法通常与色谱分离技术联合使用,其基本原理是利用色谱技术的分离功能将不同的代谢物质分离开来,然后再进行质谱鉴定,经质谱仪的离子源处理后的代谢物电离为不同质荷比的代谢物,

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  • 代谢组学定量分析与非定量分析

    代谢组学定量分析与非定量分析

    代谢组学定量分析与非定量分析-详情代谢组学分析的主要任务就是对混合样品中的各代谢物组分进行定性和定量鉴定,常用的分析技术包括质谱技术或核磁共振等技术。质谱技术通常需要与色谱技术如气相色谱或液相色谱联用。除了定性鉴定外,还可以利用生物信息学方法进行其他非定量分析,包括如聚类分析、多元统计分析、差异分析、差异KEGG富集分析以及趋势分析等。统计学分析可以用于判断样品的重复性、筛选差异代谢物以及进行遗传分析

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  • 代谢组学 脂质组学

    代谢组学 脂质组学

    代谢组学 脂质组学-详情代谢组学是对机体产生的所有内源性小分子代谢物进行研究的科学,这些代谢物的分子质量通常不超过1000Da,主要包括氨基酸、多肽、脂质、碳水化合物以及有机酸等。因此,脂质是代谢组学研究的物质之一,脂质组学也是代谢组学的一个重要分支。脂质是生物体内一大类不易溶于水而jí易溶于非jí性有机溶剂,如乙醚、氯仿和丙酮等的碳水化合物,它们种类和数量复杂多样且在结构上有很大的差别,主要包括脂肪酸、糖

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  • 代谢组学 血清

    代谢组学 血清

    代谢组学 血清-详情血清是血液的重要组成部分,离体血液自然凝固后析出的淡黄色液体就称为血清,由于血液自然凝固时纤维蛋白原变成了纤维蛋白,所以血清不含纤维蛋白原。血清约含有1000多种内源性小分子代谢物,是一种重要的代谢组学研究样本,其内容物成分复杂多样且jí性跨度大,主要包括血浆蛋白、生长因子、激素、无机离子、氨基酸、葡萄糖、核苷、脂类和固醇等。血清中的代谢物来源于机体的各个代谢途径,对血清中的代谢物进

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  • 代谢组学 糖类

    代谢组学 糖类

    代谢组学 糖类-详情糖类代谢组学就是专门定性和定量研究糖类物质以及糖代谢途径产生的相关物质的靶向代谢组学。糖类是机体直接的供能物质,为各项生命活动提供所需的能量。从化学结构上看,糖类是一类含有多羟基的醛/酮或水解产生这些物质的化合物。按照聚合的程度,可以将糖类分为单糖(葡萄糖等)、寡糖(蔗糖、麦芽糖和乳糖等)和多糖(淀粉、糖原和纤维素等)。糖类不仅是生物体内主要的能源物质,还可作为细胞膜的重要结构成

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  • 代谢组学swath

    代谢组学swath

    代谢组学swath-详情代谢组学研究的主要内容就是对样品中(一般为复杂混合代谢物样品)的小分子代谢物进行定性和定量鉴定,再结合其他生信分析寻找某一生物进程代谢通路的关键代谢物,构建代谢通路的分子模型,帮助我们从本质上认识生命活动的规律。色谱-串联质谱技术是常用的代谢组学分析技术,色谱可以将代谢物与其他杂质以及各代谢物组分分离开来,再利用质谱技术检测扫描并采集代谢物离子的质谱信息对代谢产物进行定性和定量鉴

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  • 代谢组和蛋白质组区别

    代谢组和蛋白质组区别

    代谢组和蛋白质组区别-详情要了解代谢组和蛋白质组的区别,shǒu先就要了解什么是代谢组,什么是蛋白质组。本期我们就来聊聊代谢组和蛋白质组的区别和联系。代谢组是指一个细胞、组织、器官或者生物体在特定条件下产生的分子质量大多在1000Da以内的所有内源性小分子代谢产物,包括氨基酸、多肽、糖类、有机酸、脂质、尿素、维生素、丙酮酸、辅因子、核苷和核苷酸等。蛋白质组是一个生物体在特定时间表达的所有蛋白质或一个体系中的

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  • 代谢组分析

    代谢组分析

    代谢组分析-详情代谢组分析就是对生物体、器官、组织或细胞中的所有内源代谢物进行分离、定性和定量分析,旨在研究机体响应外界刺激、病理变化以及基因突变等所产生的全部小分子代谢物种类及其动态变化,揭示复杂生物学过程的分子机制。代谢组学分析的大致流程主要包括代谢物样本提取、分离与鉴定、数据分析以及生物学阐释等。代谢物的分离与鉴定就是利用质谱或核磁共振技术对代谢物进行定性定量鉴定,是代谢组分析的重要内容。在

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  • 代谢组 转录组 肠道微生物

    代谢组 转录组 肠道微生物

    代谢组 转录组 肠道微生物-详情肠道微生物以其庞大的数量和基因组数目被称为人体的另一个“器官”,也被称为人体的“第二基因组”。这些微生物主要通过小分子代谢产物与机体进行密切的相互作用,影响机体的代谢、免疫、疾病以及神经系统等多个方面,如消化吸收能力、抵御感染风险的能力以及对疾病治疗药物的反应等,在机体的生理病理以及稳态调节中起着重要的作用。转录组是指在特定发育阶段或生理条件下转录得到的所有mRNA 分子的

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  • 代谢组

    代谢组

    代谢组-详情“组”是一个整体的概念,如蛋白质组是指一个生物体表达的全部蛋白质或某一体系中的所有蛋白质。同理,代谢组(Metabolome)就是指一个细胞、组织、器官或者一个生物体在特定状态下产生的所有内源性小分子代谢产物,其分子质量大多在1000Da以内,如氨基酸、多肽、糖类、有机酸、脂质、维生素、辅因子、核苷和核苷酸等。处于基因调控网络、转录表达网络以及蛋白质作用网络下游的代谢组提供的是生物学的终端信息,小分子

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  • 代谢通量分析

    代谢通量分析

    代谢通量分析-详情代谢通量分析(Metabolic Flux Analysis,MFA)是一种重要的代谢通量组学研究技术,用于定量研究某个目标系统中各个代谢途径的分布情况,通过分析生物系统中各代谢物的产生和消耗速率来刻画生物体的生理状态,以深层次的了解生物体内遗传、代谢调控以及环境因素的相互作用。代谢通量分析通过测定目标体系中的代谢通量的速率和方向来刻画生物体的代谢情况、评估遗传或环境对生命活动的影响。其大致思路是假定一段

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  • 代谢和蛋白关联

    代谢和蛋白关联

    代谢和蛋白关联-详情蛋白质组学是研究某种生物体所表达的全部蛋白质或系统中所有蛋白质的科学,蛋白质作为生命活动的执行者,在维持机体正常运行方面发挥着重要作用,其种类和含量的变化与生物体的生长、应激以及疾病等密切相关。因此,蛋白质组学研究对揭示生命活动的本质、寻找疾病相关的生物标志物具有重要意义。代谢组是细胞或机体某个时期全部代谢物质的总和,如脂质、糖类和氨基酸等,这些物质在代谢过程中充当反应的底物或

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  • 大规模蛋白分析方法

    大规模蛋白分析方法

    大规模蛋白分析方法-详情质谱技术作为蛋白质组学研究中zuì先进的技术,具有高通量、高灵敏度以及高分辨率的jué对优势,可以说目前没有任何一种技术能超越质谱技术,质谱技术无疑是进行大规模蛋白分析的shǒu选技术。基于“自下而上”(bottom-up)策略的质谱技术,又称鸟枪法(Shotgun),可以同时鉴定细胞裂解液、组织提取液、血清等样品中的成百上千的蛋白质,是大规模研究蛋白质的重要技术。“自下而上”就是通过蛋白肽段来研

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  • 打质谱鉴定泛素化位点

    打质谱鉴定泛素化位点

    打质谱鉴定泛素化位点-详情泛素(Ubiquitin,Ub)是一种小分子量多肽,在相关酶的作用下,Ub能通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为蛋白泛素化修饰,是真核生物中一种常见的蛋白翻译后修饰。根据蛋白所连接的泛素分子的多少,可以将泛素化分为单泛素化和多泛素化,根据Ub所在的位置又将多泛素化分为多聚泛素化和线形多聚泛素化。因此,一个蛋白质可能有多个泛素化修饰位点,且每个位点可能连接不止有一个泛素分子

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  • 打质谱鉴定的是混合蛋白还是单个蛋白

    打质谱鉴定的是混合蛋白还是单个蛋白

    打质谱鉴定的是混合蛋白还是单个蛋白-详情质谱技术是蛋白质组学分析中zuì主流zuì常用的技术,将蛋白质样品进行质谱分析俗称“打质谱”可以实现多种蛋白分析,包括相对分子质量、空间结构、氨基酸组成和排列顺序、含量、翻译后修饰类型和修饰位点鉴定以及蛋白质相互作用分析等。单一的蛋白质和复杂混合蛋白质样品都可以进行质谱分析,分析的原理也相同,大致流程包括:(1)将蛋白质样品多重酶切为小分子肽段;(2)液相色谱分离

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  • 纯度SEC检测

    纯度SEC检测

    纯度SEC检测-详情SEC(Size exclusion chromatography)分子筛色谱也称凝胶过滤色谱或尺寸/体积排阻色谱,是一种zuì温和、zuì简单的液相色谱分离技术,在组织提取液、核酸、蛋白质以及多肽等物质的分离纯化中广泛应用。分子筛色谱主要由色谱柱和检测器构成,色谱柱的填充物为多孔的球形颗粒材料,这种材料能起到像分子筛一样的过滤作用。分子质量较大的物质被排阻在孔外,随流动相从颗粒的间隙中流出色谱柱,洗脱路径和时间较短

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  • 纯度、等电点、蛋白浓度

    纯度、等电点、蛋白浓度

    纯度、等电点、蛋白浓度-详情蛋白质纯度、等电点以及浓度是蛋白质分析中重要的理化参数。蛋白纯度在各种蛋白质组学分析中十分重要,纯度越高的蛋白样品实验结果的可靠性越高。等电点是蛋白质基本的特征参数,指蛋白质溶解度zuì低时溶液的pH值,不同的蛋白质等电点也不同。蛋白质的浓度可以用于计算一定量的溶液中蛋白质的含量。蛋白纯度、等电点以及浓度的测定方法各有不同。常用的蛋白纯度测定方法主要有凝胶电泳法、基于色谱的

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  • 纯蛋白分子筛

    纯蛋白分子筛

    纯蛋白分子筛-详情蛋白纯化是蛋白质组学研究的重要内容,要研究一个蛋白质,shǒu先要将其从生物样品中分离纯化出来。蛋白质的纯度对后续的蛋白质研究也至关重要,含有杂质的样品往往会导致不准确的分析结果。蛋白纯化主要是依据蛋白质的相似性和差异性来开展的,根据蛋白质的相似性可以将蛋白质与非蛋白质区分开来,而不同的蛋白质的分子量和形状等差异可以作为进一步分离的依据。常用的蛋白质纯化方法大多都是基于色谱的技术,根

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