IP质谱结果分析

IP质谱结果分析-详情"免疫沉淀（IP）是研究蛋白质相互作用的一种经典技术，而免疫沉淀串联质谱分析（IP-MS）是目前应用zuì广泛的蛋白相互作用研究方法之一。在对IP样品进行质谱检测之后，需要进行IP质谱结果分析才能得出zuì终的结论。在目前的IP-MS处理中，常以蛋白的非标记定量信号强度（LFQ intensity）为指标对蛋白质进行定量分析，可通过选择更高的差异蛋白筛选阈值的设定来对实验组与对照组间蛋白定量差异进行分析。在IP-MS

通过IP所得样本进行蛋白质谱分析

通过IP所得样本进行蛋白质谱分析-详情"一般的质谱技术是不能直接研究蛋白互相作用的，需要和其他技术联用，如通过免疫沉淀（IP）所得样本进行蛋白质谱分析，然后再用质谱法鉴定IP所得样品中的蛋白质。甚至于可以比较不同样本中，这些蛋白的相对丰度并寻找差异蛋白。质谱技术不仅能够验证已知蛋白相互作用，还可以鉴定与目标蛋白发生相互作用的未知蛋白。IP即免疫沉淀，它是用靶蛋白的特异性抗体捕获细胞内的靶蛋白复合物。基于“靶

IP-MS打质谱非特异互作的蛋白一般有哪些

IP-MS打质谱非特异互作的蛋白一般有哪些-详情"免疫沉淀（IP）是研究蛋白质相互作用的一种经典技术，而免疫沉淀串联质谱分析（IP-MS）是目前应用zuì广泛的蛋白相互作用研究方法之一。IP-MS的主要原理是基于特异性抗体或其他亲和试剂与靶标蛋白的亲和作用，通过免疫共沉淀（Co-IP）将靶标蛋白与靶标蛋白相互作用的蛋白从复杂的样本中提取出来，进而进行质谱检测以鉴定靶标蛋白的相互作用蛋白。通过IP-MS研究蛋白相互作用以及互作蛋

验证蛋白磷酸化

验证蛋白磷酸化-详情"蛋白质磷酸化在许多生物学过程中起着非常重要的作用，包括细胞生长、增殖、泛素介导的蛋白降解等过程。在研究蛋白的磷酸化修饰过程中，shǒu先需要确定哪些候选蛋白被磷酸化修饰了，确定研究哪些目标蛋白，之后需要靶向的针对这些目标蛋白来分析验证蛋白磷酸化。一般可以通过几下几种方法验证蛋白磷酸化，以内源材料/过表达目的蛋白为例：（1）通过标签抗体（或者目的蛋白一抗）进行免疫沉淀（IP）实验，然后

无标记磷酸化

无标记磷酸化-详情"蛋白质磷酸化是一种重要的翻译后修饰（PTM），它动态可逆地调控细胞中几乎任意一个生物学过程。伴随着基于质谱的蛋白质组学技术和磷酸化多肽富集方法以及高通量定量技术的不断发展，磷酸化蛋白组学已经成为目前zuì为成熟的PTM研究方向。无标记磷酸化是利用无标记定量方法对具有磷酸化修饰的蛋白质肽段进行相对定量分析，以下将对两种常用的无标记磷酸化检测技术进行简单概述。传统非标记定量（Label Free Quant

体内磷酸化位点鉴定

体内磷酸化位点鉴定-详情"体内磷酸化的过程就是在激酶的催化作用下，将三磷酸腺苷（ATP）的磷酸根基团转移到蛋白的氨基酸侧链上，ATP随之变为二磷酸腺苷（ADP）。磷酸化修饰可以发生在多种氨基酸残基上，主要集中在肽链中的酪氨酸、丝氨酸、苏氨酸残基上，这些残基上具有游离的羟基，且本身不带电荷，当磷酸化作用后，蛋白质便具有了电荷，从而使结构发生变化，进一步引起蛋白质活性的变化。体内磷酸化位点鉴定主要通过质谱法进行

液质联用检测磷酸化位点

液质联用检测磷酸化位点-详情"过去确定磷酸化位点zuì常用的是逐步化学降解法，如丝氨酸和苏氨酸磷酸化分析方法、酪氨酸磷酸化分析方法。随着生命科学技术的发展，化学方法已经被质谱法所取代，目前可通过液质联用（LC-MS）检测磷酸化位点。液质联用一般是由前端液相色谱+质谱仪组成，液相色谱为分离系统，质谱为检测系统，样品在质谱部分和流动相分离，被离子化后，经质谱的质量分析器将离子碎片按质量数分开，经检测器得到质谱图

磷酸蛋白组学

磷酸蛋白组学-详情"蛋白质组（Proteome）是由一个基因组(Genome)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein)。蛋白质组学（Proteomics）是以蛋白质组为研究对象，对细胞、组织或生物样品中蛋白质组成、翻译后修饰（PTM）及蛋白相互作用等变化规律的科学。磷酸化是zuì为广泛研究与应用的PTM之一，它控制下游信号通路调节细胞增殖、分化和凋亡等过程。磷酸化蛋白质组（Phosphoproteome）就是蛋白质组中全部的磷酸化蛋白质。磷酸蛋

蛋白质磷酸化测序

蛋白质磷酸化测序-详情"蛋白磷酸化是在酶的催化作用下，将ATP中γ位的磷酸基团转移至蛋白质氨基酸侧链上的过程。蛋白质磷酸化在控制诸如增殖、分化和凋亡等生物过程中发挥着重要作用。了解蛋白质磷酸化过程shǒu先需要对磷酸化蛋白或肽段进行纯化富集，之后进行蛋白质磷酸化测序，根据磷酸化肽段或残基序列进一步确定磷酸化位点，zuì终确定磷酸化修饰蛋白对细胞生命活动的影响机制。质谱分析技术（Mass Spectrometry, MS）可对磷

磷酸化组学分析技术

磷酸化组学分析技术-详情"磷酸化蛋白质组（Phosphoproteome）就是蛋白质组中全部的磷酸化蛋白质，而磷酸化蛋白质组学（Phosphoproteomics）就是针对磷酸化蛋白质的全面分析，包括对磷酸化的定性、定位和定量。磷酸化蛋白质组学分析技术主要与质谱技术相结合进行分析，分析流程包括样品中提取蛋并酶解成肽段，之后利用固定金属离子亲和色谱法（IMAC）、二氧化钛亲和色谱法（TiO2）等方法富集磷酸化肽段，zuì后联合质谱检测技术进行

蛋白激酶磷酸化活性位点

蛋白激酶磷酸化活性位点-详情"磷酸化对蛋白质功能的正常发挥起着重要的调节作用，该过程是由蛋白质激酶（protein kinases， PK）催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基转移到底物蛋白质的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸等氨基酸残基上的过程。蛋白激酶是激酶家族里面zuì大的族群，可通过催化特定底物蛋白的磷酸化将ATP末端的γ-磷酸基团转移到底物蛋白质的特定氨基酸上，从而影响底物的结构和活性，进而参与一系列细胞信号传导和调节过程以在细胞

磷酸化位点的质谱检测实验原理

磷酸化位点的质谱检测实验原理-详情"磷酸化是研究zuì为频繁的翻译后修饰之一，它能控制下游信号通路调节细胞增殖、存活和分化等过程。如今，基于质谱的磷酸化蛋白质组学是一种成熟的方法，可对磷酸化蛋白和复杂样品中的肽进行磷酸化表征和定量。在此之前，进一步了解磷酸化位点的质谱检测实验原理显得愈发重要。质谱（mass spectrometry，MS）是一种分析技术，可产生包含材料样品的原子或分子质量的光谱。光谱用于确定样品的元素

IMAC富集磷酸化肽段的步骤

IMAC富集磷酸化肽段的步骤-详情"磷酸化修饰是一种可逆的蛋白修饰，调控蛋白活性，传递信号，是细胞健康和疾病的核心调控机制；真核生物中预计有三分之一的蛋白具有磷酸化修饰。然而，磷酸化修饰的丰度很低，直接进行质谱（MS）检测，非磷酸化的肽段会造成很高的背景，因此磷酸化肽段需要进行富集后检测。此外，对样品磷酸化肽段预先分离纯化并进行富集也可降低样品复杂程度，从而改善磷酸肽的MS信号并提高MS检测深度。固相金属亲和

蛋白磷酸化检测最新方法

蛋白磷酸化检测最新方法-详情"蛋白质磷酸化指由蛋白质激酶催化的把ATP或GTP的γ位的磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基（丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸）上的过程，而其逆向过程则是由蛋白质磷酸酶去除相应的磷酸基团。对蛋白磷酸化进行检测与表征，可更好的了解磷酸化过程及其涉及到的生理活动调控及功能。在进行蛋白磷酸化检测时，选择的方法可能会因具体样本、实验室仪器等因素而有所不同。常用的磷酸化检测方法包括32P同位素放射性标

测定磷酸化的位点

测定磷酸化的位点-详情"蛋白质磷酸化是一个通过蛋白激酶催化将ATP的磷酸基团转移到底物的氨基酸残基（丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸）上或者在信号作用下结合GTP的过程，其在细胞信号转到过程中起重要作用，是生物体内一种较为普遍的调节方式。磷酸化是研究较为普遍和深入的翻译后修饰，且参与多种细胞生命活动。磷酸化位点是指发生磷酸化修饰的氨基酸在蛋白质中所处的位置，可通过质谱技术（LC-MS/MS）进行测定，包括验证已知磷酸化位点

Pull-down silver stain

Pull-down silver stain-详情"银染（silver stain）是对聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白质进行染色的过程，在碱性条件下，甲醛可以将蛋白带上的硝酸银（银离子）还原成金属银，使银颗粒沉积在蛋白带上而染色。染色的程度与蛋白中的一些特殊的基团有关，不含或者很少含半胱氨酸残基的蛋白质有时候呈负染。Pull-down银染（Pull-down silver stain）是将Pull-down样品进行十二烷基硫酸钠聚丙烯酰氨凝胶（SDS-PAGE）电泳分离后进行银染的过程。

Pull-down,质谱

Pull-down,质谱-详情"质谱是蛋白互相作用研究中的蛋白质“检测器”，一般的质谱技术是不能直接研究蛋白互相作用的，需要和其他技术联用检测（如常见的免疫共沉淀和Pull-down等技术），然后再分析纯蛋白或者复合蛋白样品中存在的具体蛋白，甚至于可以比较不同样本中具体蛋白的相对丰度并寻找差异蛋白。基于质谱的蛋白质检测法与传统的根据分子量鉴定的十二烷基硫酸钠聚丙烯酰氨凝胶电泳法（SDS-PAGE）以及依靠特异性抗体的蛋白质印

蛋白互作分析Pull-down

蛋白互作分析Pull-down-详情"Pull-down 技术又称蛋白质体外结合实验（Binding assay in vitro）， 是一种行之有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术，蛋白互作分析Pull-down可用于初步研究两种蛋白质的相互作用分析。Pull-down技术是通过将靶蛋白亲和固定于某种基质上作为“诱饵蛋白”，当细胞抽提液与该基质接触时，与靶蛋白相互作用的配体蛋白被吸附，其他无相互作用的蛋白质则随洗脱液流出。被吸附的配体蛋白则可通过改变洗脱

蛋白纯化pull-down

蛋白纯化pull-down-详情"GST pull-down实验的基本原理是将靶蛋白-GST融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上，作为与目的蛋白亲和的支撑物，充当一种“诱饵蛋白”，然后目的蛋白溶液过柱，可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”（目的蛋白），洗脱结合物后通过SDS-PAGE电泳分析，从而证实两种蛋白间的相互作用或筛选相应的较纯的目的蛋白。谷胱甘肽S转移酶（GST）是一个含有211个氨基酸的蛋白，通常将该蛋白加入到重组蛋白的N-末端

HCP覆盖率检测

HCP覆盖率检测-详情"生物技术药物往往是借助工程细胞进行大规模生产，在生产过程中，这些宿主细胞会分泌其他蛋白质，伴随着细胞老化破裂产生的大量胞内蛋白等，形成与产品不相关的杂质，统称为宿主细胞蛋白质（host cell protein，HCP）。HCP的存在可能导致产品不稳定、疗效差等质量风险，还能引发病人的免疫副反应等安全风险。因此，需要证明HCP多克隆抗体能识别HCP的比例，即覆盖率（Coverage），对HCP覆盖率进行检测和评估。覆