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质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析,根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前,蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量,即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility),主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分m/z差值非常小的肽段,使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOF Pro质谱仪,结合PASEF(Parallel Accumulation Serial Fragmentation,同步累积连续碎裂)与TIMS(Trapped Ion Mobility Spectrometry,离子迁移谱),可重复测量所有检测离子的碰撞截面(CCS),能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。
4D蛋白质组学
百泰派克生物科技提供基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学研究服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
1. 如果您提供的是co-IP样品,蛋白需求量在2-5ug左右,在寄送蛋白样品中不要包含去污剂(例如SDS)以及高的氧浓度;或者您可以直接将含有蛋白样品的beads寄给我们,由我们负责后续的实验。
2. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;动物样本大于200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,植物样品至少1g,细胞样品为1X10^7个细胞,酵母、微生物等干重200mg。
3. 如果您提供的是蛋白样品,请您保证蛋白总量在50ug以上;蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。
4. 样品运输:请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中/英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的实验参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 蛋白质组学分析结果
您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
定量蛋白组分析
靶向蛋白质组学
基于Label Free的定量蛋白组分析
基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ,TMT,SILAC
MRM/PRM定量蛋白组学分析
绝对定量分析(AQUA)
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SWATH定量蛋白组学服务
翻译后修饰蛋白组分析
磷酸化定量蛋白组学研究
乙酰化定量蛋白组研究
泛素化定量蛋白组学研究
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蛋白质组学生物信息学分析