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RNA免疫共沉淀测序
RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP )是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。 RIP这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化获得结合在复合物上的RNA,再通过高通量测序实现对目的RNA的信息分析。RIP技术与高通量测序的结合,能帮助研究人员更好的了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。
样本要求
• 样品类型:RIP分离的RNA样品
• 样品量:RNA总量100ng以上。
• 样品保存:将RNA溶于RNase Free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
• 样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输。
测序方案
测序模式 SE50或PE150(根据客户需求)
测序数据量 20M reads 或5Gb clean data(根据客户需求)
生物信息分析内容
1 原始数据质控检查
2 比对结果质控检查
3 测序reads全转录组分布图
4 结合峰鉴定
5 结合峰基因元件分布
6 差异结合峰检测
7 差异结合峰相关基因GO功能富集分析
8 差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析
MDL服务项目
动物实验相关、WB、IP和Co-IP服务、蛋白质纯化、蛋白质双向电泳、明胶酶谱、细胞增殖、细胞培养、细胞周期凋亡、平板克隆、免疫荧光、免疫组化、常规及特殊染色、包埋切片爬片、定量pcr、elisa检测服务、普通生化试剂盒检测、全自动生化检测项目等。
MDL服务优势
项目均配备专职项目经理及技术支持,对每一项目进行全程跟踪反馈及管理,确保项目完成情况。周期短,价格优惠,质量保证,售后无忧;公司总部坐落于北京,实验室拥有4000多平的平台,拥有自己独立的实验室,相应的仪器设备及优秀的技术团队、销售团队,可随时参观,客户可参与实验。
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