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糖基化是蛋白质的一种重要的翻译后修饰。根据糖链和肽链的连接方式的不同 ,蛋白质的糖基化可分为 N-糖基化和 O-糖基化。N-糖基化是通过糖链的还原端的 N-乙酰氨基葡萄糖( Glc-NAc) 和肽链中某些 Asn 侧链酰氨基上的氮原子相连。能接有糖链的 Asn 必须处于 Asn-X-Ser/Thr 3 残基构成的基序(motif) 中 ,其中 X 可为除 Pro 的任意的氨基酸残基。 O-糖基化的结构比 N-糖基化简单 ,一般糖链较短 ,但是种类比 N-糖基化多得多。肽链中可以糖基化的主要是 Ser 和 Thr ,此外还有酪氨酸、羟赖氨酸和羟脯氨酸 ,连接的位点是这些残基侧链上的羟基氧原子。百泰派克生物基于高分辨率质谱仪Obitrap Fusion Lumos,利用包含了几乎所有糖型的Byonic软件针对肽段、蛋白和抗体药物进行糖基化分析,可以确定肽段或者蛋白样品糖基化位点、N糖/O糖类型、糖基化位点糖组成。
糖谱检测和分类
案例分析:
服务案例为对一位客户提供的重组蛋白药物进行糖谱检测。拿到客户提供的理论序列之后,我们首先对序列进行了分析以确认适合项目使用的蛋白酶;通常情况下,我们会选择两种以上的蛋白酶进行酶切,以提高的肽段覆盖率;使用不同的蛋白酶进行酶切,产生不同的肽段序列,利用肽段序列相互之间的互补关系,帮助提高糖谱分析的肽谱覆盖率。以下是之前项目的部分实验数据,该项目中客户提供的是重组蛋白样品,在我们选择了合适的蛋白酶组合之后,肽段覆盖率如下图所示:
该项目中,与理论序列相比,肽段覆盖率为94%,未鉴定到的6%的序列为信号肽,在重组蛋白分泌过程中已经被切掉,因此实际的肽段覆盖率为100%。
经过Byonic软件分析之后,鉴定到的糖肽相关总结如下:
在结题报告中,我们还会提供鉴定到的每一个糖肽的二级质谱图信息。
中/英文项目报告
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 质谱图片
4. 原始数据
5. 糖谱检测结果
生物药糖谱检测一站式服务
您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告