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基因标志物分析
盛世华康以基因芯片分析、甲基化检测、SNP基因分型、RT-PCR检测等技术为依托进行基于基因为标志物为进行的各项分析。
基因芯片分析
盛世华康的基因芯片分析平台利用美国SABiosciences公司(现QIAGEN公司)开发的第二代功能分类基因芯片(Real-time PCR芯片)进行高通量的基因标志物分析。这种芯片结合了实时荧光定量PCR的优点,可在一次实验中准确定量检测上百个基因的mRNA水平,将基因芯片的检测精度提高到与实时荧光定量PCR相当的水平。本平台利用平台QIAGEN的miscript miRNA PCR Array进行miRNA的高通量检测,可以一次分析多个样本的miRNA或分析少量样本的多个miRNA水平。
DNA甲基化分析
DNA甲基化是表观遗传学(Epigenectics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印迹、胚胎发育及人类肿瘤发生中起着重要作用。盛世华康提供DNA甲基化检测,主要有BSP和MSP两种方法。
●BSP法甲基化检测
用重亚硫酸盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,这种方法称为BSP-克隆测序法。
●MSP甲基化检测
用重亚硫酸盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
SNP基因分型
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性。SNP在群体遗传学研究和疾病相关基因研究,药物基因组学,分子诊断和生物医学研究中起着重要作用。
我们提供的SNP分型服务,采取直接测序法,Taqman探针和质谱三种方法。
●直接测序法
在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。
技术特点:信息量大,能发现未知SNP位点;辅助疾病的诊断
●Taqman探针法(定量PCR)
设计与SNP位点互补的荧光探针
适合位点数少,高效快速自动判定SNP位点信息;
●质谱法
精确测量PCR产物的分子量,就可以知道SNP位点上的碱基A/C/G/T
技术特点:灵敏度高、误差机率低、操作简单,反应快
蛋白质标志物分析
盛世华康以蛋白芯片分析、Western blot检测、免疫共沉淀、ELISA检测、双向凝胶电泳以及免疫组化/免疫荧光等技术为依托进行基于蛋白质为标志物进行的各项分析。
盛世华康已成功开发的蛋白标志物超过100种,其中与肿瘤相关的靶点有25种,与细胞凋亡相关的靶点有7种,细胞周期相关有5种,细胞因子5种,肝硬化相关3种,其他组织特异性靶标50余种。涉及到Westernblot,ELISA,流式细胞术和免疫组化和免疫荧光等多种技术手段。