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BTP-组蛋白翻译后修饰分析
组蛋白是一类高度保守的蛋白,不同变体序列间仅有几个氨基酸的差别,组蛋白的N末端可发生甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、ADP核糖基化等多种修饰,这些共价修饰与基因转录、DNA损伤修复、DNA复制、染色体凝聚等密切相关。组蛋白修饰作为一种重要的表观标志,与其他表观标志之间也存在一定的联系,构成了一个复杂的网络,组蛋白密码大大丰富了传统表观遗传密码的信息含量。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出组蛋白修饰定性和定量分析,提供完美解决方案,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,提供组蛋白修饰方式、修饰位点的鉴定及定量分析。
关于样品
1. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;植物组织样本最少400mg,血液样品至少2ml(血浆注意用EDTA防凝),血清2ml,尿液10ml,动物组织样品至少2g,细胞样品为1X10^8个细胞,酵母、微生物等干重400mg。
2. 如果您提供的是蛋白样品,请您保证蛋白总量在2-5mg;蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。
3. 样品运输:请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。
4. 在正式实验之前,我们都会对您提供的样品进行检测,检测合格后开始正式试验。
一站式服务
您只需下单-寄送样品
百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
与传统的定量蛋白组学分析相比,组蛋白修饰定量分析的关键一步是如何分离纯化得到纯的组蛋白组分。组蛋白都在细胞核,百泰派克公司基于发表在Nature Protocol上的文章:Extraction, purification and analysis of histone,结合自己的实验经验建立了分离纯化组蛋白的实验平台,即把细胞打浆低速离心分离细胞核,然后用再破碎细胞核,分离组蛋白和DNA,高盐buffer沉掉杂质,HPLC分离纯化得到各种组蛋白组份,进行后续的质谱实验分析。同时,在Nature Protocl文章基础上,为了鉴定更多的组蛋白翻译后修饰信息,我们在酶切过程中会使用2-3中不同的酶对蛋白样品进行酶切,提高了组蛋白在质谱分析过程中的肽段覆盖率,排除因为肽段长度不合适、离子化效率低造成的组蛋白翻译后修饰信息的丢失。
组蛋白翻译后修饰鉴定研究路线
中/英文项目报告
在最终的技术报告中,百泰会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 翻译后修饰位点信息
4. 原始数据
5. 生物信息学分析
研究案例
该项目是中国科学院生物物理所一位老师Co-IP样品在百泰派克进行蛋白泛素化修饰位点鉴定。得到的部分结果如下图所示: