|
日期
|
时间
|
课程名称
|
课程内容
|
第一天
上午
|
9:00~10:30
|
生物信息学概述与前沿
|
1、基因组学与生物信息学背景知识介绍;
2、生物信息进展与前沿技术介绍;
|
10:30~12:00
|
生物信息学数据库及公共资源
|
生物信息学数据库及、公共资源应用GenBank、RefSeq、UniProt、Ensembl、PDB等;
|
|
第一天
下午
|
13:30~17:00
|
Linux与高性能计算机
|
1、常用数据下载工具
2、Linux系统操作;
3、shell脚本的编写;
4、高性能服务器的操作与软件安排;
|
第二天
上午
|
9:00~12:00
|
序列分析与分子进化软件
|
1、Bioedit操作序列;
2、Blast序列检索(在线+本地);
3、ClustalW/X序列比对;
4、Mega序列分析与进化分析;
|
第二天
下午
|
13:30~17:00
|
生物信息在线数据库及工具
|
1、基因本体数据及GO注释;
2、生物学通路KEGG注释方法与实现;
3、David基因注释;
4、基因组浏览器;
|
第三天
上午
|
9:00~12:00
|
蛋白质分析技术与软件
|
1、蛋白质结构分析概述及PDB数据库等;
2、Swiss-PDB Viewer、PyMol等蛋白结构分析软件的使用;
3、Amber在分子动力学研究中的应用;
|
第三天
下午
|
13:30~16:30
|
分子网络与生物学通路分析
|
1、分子相互作用与通路概述;
2、分子网络分析工具Cytoscape使用;
|
16:30~17:00
|
自主练习与交流讨论
|