蛋白组学靶向和非靶向

蛋白组学靶向和非靶向-详情蛋白质组学靶向和非靶向是根据研究的蛋白质是否是特定的来区分的，靶向蛋白质组学是针对一个或多个特定的目标蛋白质进行研究，非靶向蛋白质组学则是对尽可能多的或体系中包含的全部蛋白质进行研究。往往通过非靶向蛋白质组学研究找到感兴趣蛋白或关键蛋白后可利用靶向蛋白质组学技术进行进一步研究和验证。常用的靶向定量蛋白质组学质谱技术是基于SRM（选择反应监测）和PRM（平行反应监测）扫描模式进行

蛋白组学PRM和DDA

蛋白组学PRM和DDA-详情PRM（Parallel Reaction Monitoring）平行反应监测和DDA（Data Dependent Acquisition）数据依赖采集模式是两种不同的质谱扫描模式或称数据采集模式。二者的区别如下表所示：PRMDDA原理利用高分辨、高精度的四级杆质量分析器选择目标肽段的母离子进行二级质谱，对每一个母离子产生的所有碎片离子进行全扫描根据预设的条件如信噪比、同位素分布和离子强度等筛选肽段母离子进行二级质谱片段化和分析优点无需建

蛋白组和代谢组学植物样品

蛋白组和代谢组学植物样品-详情植物在不同生长时期及外界环境影响下会表达不同的蛋白质或代谢产物以适应和应对这种变化，研究植物体内蛋白质或小分子代谢产物的变化规律即植物蛋白质组学和植物代谢组学有助于理解植物体内相关生命过程的本质和分子机理。进行植物蛋白质组学和代谢组学研究shǒu先要从待研究的植物组织如种子、根、茎、皮、木、叶和果实中提取蛋白质和代谢物样品，或者提供相应的植物组织。需要注意的是，蛋白质提取

蛋白的动态磷酸化修饰

蛋白的动态磷酸化修饰-详情磷酸化修饰是zuì常见的、重要的蛋白质翻译后修饰方式之一，指蛋白质的氨基酸残基在相关酶的作用下共价结合磷酸基团的过程。磷酸化修饰不仅丰富了蛋白质的生物学功能，还通过影响蛋白质的活性、稳定性、细胞内定位和蛋白质互作等参与调控众多信号转导途径和细胞代谢过程，如细胞周期、基因表达、转录、信号传导以及DNA修复损伤等。机体内的磷酸化修饰是处于动态变化中的，不同时期或不同生理病理条件下，

蛋白代谢组学

蛋白代谢组学-详情蛋白代谢组学就是进行蛋白组与代谢组联合分析。蛋白质组学通过从整体水平上研究生物体或系统内的蛋白质组成、活动规律以及蛋白质之间的相互作用来揭示各项生命活动的分子机理。代谢组学通过定性和定量表征不同时期或生理病理条件下机体产生的小分子代谢物的变化，挖掘关键代谢产物和代谢通路，探索生物体与细胞代谢相关的关键科学问题。蛋白组学与代谢组学联合分析不是简单的将两者的数据汇合，而是进行归一化处

蛋白从头测序的样本处理

蛋白从头测序的样本处理-详情从头测序是一种不依赖于已知蛋白序列数据库的序列分析方法，它利用质谱检测到的两个片段离子之间的质量差来计算肽链上氨基酸残基的质量，进而推断多肽或蛋白的氨基酸序列。对于一个没有相应理论数据库、或者新发现的蛋白/多肽来说，从头测序就显得十分重要。进行蛋白质分析shǒu先要制备合适的蛋白样品。制备从头测序的蛋白样本应从其含量、纯度、保存以及运输等方面进行考虑：（1）可以制备液体或冻干

蛋白纯化抗体的质谱鉴定

蛋白纯化抗体的质谱鉴定-详情蛋白质纯化技术可以去除复杂混合蛋白样品中的非蛋白杂质，并将各蛋白组分分离开来，是进行后续蛋白分析的重要步骤。纯化后的蛋白质可以进行进一步定性或定量以及其他鉴定，以明确其种类、含量等理化性质。质谱技术可以通过检测蛋白质的分子质量而实现定性鉴定，通过分子量信息还可以进行蛋白氨基酸组成、氨基酸序列以及蛋白质翻译后修饰情况分析。另外，根据质谱数据中蛋白肽段的质荷比强度信息还可以

蛋白测序Edman和质谱法区别

蛋白测序Edman和质谱法区别-详情蛋白质测序是指测定蛋白质的氨基酸组成和排列顺序，也可以称为蛋白质一级结构分析。目前用于蛋白质氨基酸序列分析的方法可以大致分为基于质谱的方法和非质谱法，Edman降解法是zuì常用的非质谱法。质谱法和Edman 降解法基于不同的原理实现蛋白质的序列分析，二者所能分析的片段也不同，Edman降解法是针对N末端序列的测序方法，但是对于N端封闭的蛋白质无能为力；质谱法可用于蛋白从头测序、蛋白全序

蛋白表征分析

蛋白表征分析-详情蛋白质是生命物质的承担者和生物功能的执行者，对维持机体正常生命活动具有十分重要的作用。蛋白表征分析（Protein characterization analysis）包括对蛋白纯度、分子量、结构、翻译后修饰情况以及相互作用等进行表征，作为生物科学研究的核心领域之一，蛋白表征分析揭示了蛋白质如何在生物系统中发挥作用，以及它们如何相互作用以维持正常的生理功能。常用的蛋白表征分析方法包括核磁共振（NMR）、质谱（MS）和

代谢组研究靶向和非靶向

代谢组研究靶向和非靶向-详情根据不同的研究目的可以将代谢组学分为靶向代谢组学和非靶向代谢组学。靶向代谢组学主要是对目标代谢物或已知代谢物进行多重分析；非靶向代谢组学通过高通量分析生物体或系统内的所有代谢物以寻找并筛选关键代谢物进行后续分析。简而言之，靶向代谢组学的研究对象在实验前是确定的，而非靶向代谢组学的研究对象在实验前是不确定的。靶向代谢组学利用标准品和同位素内标来实现特定代谢物的精准定性和定

代谢组学样品处理

代谢组学样品处理-详情样本采集是进行各种研究的第yī步，也是关键的一步，好的开始是成功一半，只有制备了合适的、满足检测条件的样本才能保证实验和分析更加准确可靠。可以用来做代谢组学的样本多种多样，包括组织液、血清、血浆、尿液、唾液、脑脊液、关节液、淋巴液、粪便、唾液、植物器官、微生物细菌、细胞及其培养基以及真菌及其发酵液等。目前还没有一种通用的代谢组学样本采集方法，不同的样本有不同的特点，收集保存的方

代谢组学如何区分内外源

代谢组学如何区分内外源-详情代谢物是生物体新陈代谢产生的小分子化合物的集合，通常指分子质量小于1000Da的化合物，如氨基酸、多肽、糖类、有机酸、脂质、维生素、生长因子、核苷和核苷酸等，这些物质都是生物体内产生和发现的，又称内源性代谢产物，通常所说的代谢物都是指内源性代谢产物。外源性代谢物又称外源性小分子，是指来源于食品添加剂、膳食补充剂、药物以及环境污染物的化学物质，这些外源性小分子进入机体后通过吸收

代谢组学分析血液要求

代谢组学分析血液要求-详情血液是含有多种蛋白、生长因子、激素、抗体、酶和无机盐等代谢物的复杂体液，可以zuì直接、zuì有效的反映生物体的代谢情况，是非常重要的代谢组学样本。利用血液进行代谢组学分析shǒu先要制备合适的血液样本，一般采集血清或血浆进行检测分析，血浆样本和血清样本代谢物种类存在细微的差别，因此需要视实验目的确定采集哪种样本。进行血清/血浆样本采集时，将自然凝固/加入抗凝剂的血液于4℃在3000rpm

代谢组学lc-ms

代谢组学lc-ms-详情代谢组学旨在通过定性和定量表征细胞、组织、器官或生物体的内源性小分子代谢产物揭示机体生理和病理生物学过程的代谢通路和分子机理，帮助我们更好的认识生命活动的规律。LC-MS（Liquid Chromatography-Mass Spectroscopy）液相色谱-串联质谱技术是代谢组学常见的分析方法，该技术可以实现多种代谢产物的定性和定量鉴定。通常所提取的组织代谢物包含多种不同的代谢产物，甚至含有其他杂质，液相色谱技术在去除

代谢组差异阈值

代谢组差异阈值-详情代谢组学是对生物体所有内源性小分子量代谢物（通常指分子量小于1000Da的物质，如氨基酸、多肽、糖类、脂肪酸、核苷、核苷酸、有机酸、花青素、脱落酸和类固醇等）进行定性定量分析的一门新兴科学，旨在寻找代谢物与生理病理变化相关关系，进而揭示生命活动变化的本质，解析生物学问题。代谢组学分析主要通过寻找不同组间的关键差异代谢物来阐明生物体的代谢通路以及生理病变机制。因此，差异代谢物的筛选是代

转录组蛋白组代谢组的关联

转录组蛋白组代谢组的关联-详情根据中心法则可知，基因通过转录成mRNA，mRNA进一步翻译表达为蛋白质来调控生命活动。在这一过程中，mRNA处于基因表达的中央枢纽地位，代表了基因表达的中间状态，可以反映基因转录、转录调控以及转录后调控的相关分子机理；蛋白质是生物功能的zuì终载体，蛋白质组代表生物体执行直接功能的状态，反映了转录本的真实表达情况；代谢组处于转录表达网络以及蛋白质作用网络下游，提供的是生命活动的终

大分子药物质谱

大分子药物质谱-详情随着生物科学技术和医疗水平的发展，越来越多的生物药物进入大众的视野，并在临床治疗中发挥着重要作用。大分子药物也称生物类药物，通常指通过生物技术如基因工程、蛋白质工程、细胞工程等获得的生物材料而制备的药品，如新型抗体、新型疫苗、聚糖以及核酸药物等。对于新型的大分子药物，必须保证其对人体的安全性和疗效性。因此，采取合适的方法进行严格的质量把控格外重要。质谱技术是进行大分子药物质控的

肠道微生物代谢产物检测

肠道微生物代谢产物检测-详情肠道微生物以其庞大的数量以及其在机体健康中扮演的重要的作用被称为人体的另一个“器官”。肠道微生物主要通过小分子代谢物实现与宿主的相互作用，因此研究肠道微生物与机体的联系机制就必须以代谢物为桥梁，对代谢物进行检测、鉴定以及溯源等分析，为复杂的是生理病理作用网络揭开神秘的面纱。肠道所寄生的微生物种类繁多，微生物的代谢产物类型也多种多样，根据其是否与微生物的生长密切相关可以分

sumo与蛋白互作

sumo与蛋白互作-详情类泛素分子（Small ubiquitin-like modifier，SUMO）是泛素样蛋白超家族的一员，其本质是一类多肽小分子，在真核生物中存在三种不同形式的SUMO蛋白。研究表明，SUMO可以通过共价键与其他蛋白相互作用，这种结合就称为蛋白SUMO化修饰，是真核生物中一种重要的常见的蛋白质翻译后修饰。除了通过小分子如磷酸盐和碳水化合物等进行蛋白质修饰外，肽和小蛋白质也可作为修饰剂，类泛素化修饰就是一种典型的小多肽共价

pull down和免疫共沉淀

pull down和免疫共沉淀-详情Pull Down与免疫共沉淀都是用于蛋白质与蛋白质相互作用的分析方法，二者在原理上存在差异。免疫共沉淀（Co-immunoprecipitation，Co-IP）通过使用靶蛋白特异性抗体来间接捕获与特定靶蛋白结合的蛋白，从而识别生理相关的蛋白-蛋白相互作用，进一步分析这些蛋白质复合物可以鉴定新的结合蛋白、结合亲和力、结合动力学以及靶蛋白的功能。Co-IP是免疫沉淀（IP）的延伸，原理也与IP相同，只是与抗原相结合的