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  • 翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析

    翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析

    翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析-详情蛋白质的翻译后修饰(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白质在翻译中或翻译后经历的一个共价加工过程。翻译后修饰蛋白质组是指细胞或组织等整体水平上的翻译后修饰蛋白质。目前,已知的蛋白质翻译后修饰主要包括糖基化、磷酸化、酰化、泛素化、二硫键配对、甲基化和亚硝基化等等。代谢组是细胞、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的整体水平。翻译后修饰蛋白质可以调

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    2023-09-18 13:09

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  • 代谢组与16S rDNA测序整合分析

    代谢组与16S rDNA测序整合分析

    代谢组与16S rDNA测序整合分析-详情代谢组学是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的大规模研究。16S rDNA是编码16S rRNA的基因,存在于所有细菌基因组。16S rDNA既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,目前被广泛用于病原菌的检测和鉴定,以及不同微生物群落的属或种系统进化分类。整合分析16S rDNA测序数据和代谢组学数据,可揭示特定菌群与特定代谢物(群)之间的关联性,

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  • 转录组学与脂质组学整合分析

    转录组学与脂质组学整合分析

    转录组学与脂质组学整合分析-详情转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA的集合,转录组学是在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控的规律。脂质组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的所有脂质的集合,脂质组学是代谢组学的一个重要分支,是在整体水平上分析和鉴定生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子。结合转录组学与脂质组学数据进行整合分析,可以更系统全面地解析生物脂质分子功能和调控机

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  • 16S/18S/ITS全长测序

    16S/18S/ITS全长测序

    16S/18S/ITS全长测序-详情16S/18S/ITS全长测序是指通过提取样品中微生物的DNA,使用通用引物扩增微生物的16S rDNA、18S rDNA或ITS区域全长,然后对其进行测序的过程。16S/18S/ITS全长测序可用于微生物多样性的检测。16S rDNA存在于所有细菌基因组,能体现不同菌属之间的差异,目前被广泛用于病原菌的检测和鉴定。16S rDNA全长测序可用于分析细菌群落结构多样性。18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,在结构上分为保

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  • 百泰派克推出多组学整合分析服务

    百泰派克推出多组学整合分析服务

    百泰派克推出多组学整合分析服务-详情多组学分析是一种集合了多个组学的生物学分析方法,其数据集包含基因组、代谢组和微生物组等多个组学领域。即利用多种组学技术研究生命。通过不同组学数据的结合,研究学者们可以分析复杂的生物大数据,从而找到生物体之间的关联,精确定位相关生物标志物,为疾病和生理学研究新的方向。基于蛋白组分析平台、代谢组分析平台和自主生信学分析平台,结合Illumina高通量测序平台,百泰派克生物科

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  • 非变性质谱分析(Native MS)

    非变性质谱分析(Native MS)

    非变性质谱分析(Native MS)-详情蛋白质和蛋白质复合物类生物药的不断发展及对精准测定需求的提升,结构表征技术也在不断更新。当传统的质谱技术不能完全满足复合物类药物精准测定的需求,非变性质谱(Native MS)技术应运而生。非变性质谱的应用广泛,如抗体-药物偶联物(Antibody-drug conjugates, ADCs)中药物的药物抗体比率(drug to antibody ratio, DAR)测定:ADCs药物根据抗体偶联的位点分为赖氨酸和半胱氨酸偶联的ADCs

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  • MALDI TOF分子量分析

    MALDI TOF分子量分析

    MALDI TOF分子量分析-详情Matrix-assisted laser desorption/ionization(MALDI)是在质谱中使用的软电离技术,适用于通过电离方法能产生碎片的蛋白类样品的鉴定与另一种软电离技术电喷雾电离(ESI)相比,MALDI产生更少的多电荷离子,不需要额外的deconvolution步骤即可对蛋白样品进行全谱分析。然而,对于分子量较大的蛋白质,平均质量与准确质量差别很大。所以大于25kDa分子量的蛋白质类物质分子量鉴定推荐高分辨率质谱鉴定策略

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  • PLS-DA/OPLS-DA二维图

    PLS-DA/OPLS-DA二维图

    PLS-DA/OPLS-DA二维图-详情不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型(图1)或OPLS-DA模型(图2),模型得到的参数评价会以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分别表示所建模型对X和Y矩

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  • 糖尿病

    糖尿病

    糖尿病-详情糖尿病的典型症状包括高血糖, 由于胰岛素分泌和/或胰岛素作用的缺陷而引起的碳水化合物、脂肪和蛋白质代谢紊乱等。Ⅰ型糖尿病 (T1D) 是T细胞介导的以胰腺β细胞特异性损伤为特征的炎症自身免疫疾病。浸润胰岛的巨噬细胞,淋巴细胞等产生的细胞因子如IL-1β、TNF α和干扰素α,干扰素γ肿瘤坏死因子IL-2等通过有道胰腺β细胞凋亡/坏死和胰岛素分泌缺陷调节T细胞的活化和种群比例,以及调控T细胞对β细胞的免疫识别和杀

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  • 细胞凋亡

    细胞凋亡

    细胞凋亡-详情细胞死亡可以通过多种途径发生, 包括细胞凋亡, 坏死, 和其他 "新兴" 的途径, 有望成为研究的焦点。细胞凋亡在免疫系统中起重要作用,与胞内稳态、T 细胞聚集、反应淋巴细胞的死亡和靶细胞的细胞毒性反应密切相关。其中APO-1/Fas 是细胞凋亡的信号受体分子;Caspase-3在细胞凋亡以及破骨的活化中起着重要作用;CD30 刺激导致生长停止和凋亡。通过对细胞凋亡过程中的细胞因子进行同时的定量检测,对研究相关疾病的发生

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  • 单细胞质谱流式技术分析

    单细胞质谱流式技术分析

    单细胞质谱流式技术分析-详情随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的研究需要了,我们需要更进一步了解细胞之间的差异性,于是针对单细胞的各类研究技术应运而生。单细胞质谱流式(Mass Cytometry)技术是利用质谱技术对单细胞进行多参数检测的流式技术,它既有传统流式细胞术能够高速分析的特点,又兼并了质谱检测的高分辨能力。单细胞测序和质谱流式都是目前非常强大的技术,越来越多的高分文献都是将两者结

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  • iTRAQ和DIA

    iTRAQ和DIA

    iTRAQ和DIA-详情iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)同位素标记相对和jué对定量技术是由美国AB Sciex公司研发的一种基于等质量同位素标签的体外标记定量技术,其利用4种至8种不同的等质量同位素标签,与肽段氨基(氨基酸N-末端和赖氨酸侧链基团)反应实现报告基团、平衡基团和反应基团的连接,之后通过液相色谱串联质谱分析,可同时实现4-8个不同样本的蛋白质组定性和定量分析。DIA(Data independent acqu

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  • 蛋白DIA

    蛋白DIA

    蛋白DIA-详情随着静电场轨道阱Orbitrap质谱的发展,由此带来一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术——数据非依赖性采集模式(Data independent acquisition,DIA)。DIA数据采集模式是在传统的数据依赖性采集模式(Data dependent acquisition,DDA)的基础上发展和革新而来,其目前主要应用于蛋白分析与研究。使用蛋白DIA分析可避免对高丰度肽段采集的偏好性,具有更高的数据挖掘性和检测通量,在定量准确性和技术重复性方

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  • 细胞代谢组学

    细胞代谢组学

    细胞代谢组学-详情代谢组学通过表征体内各种生化反应的产物——内源性小分子(代谢物),揭示了在活细胞内运作的不同途径之间的联系。代谢组学分析可以定性和定量地描述细胞调节途径的zuì终产物,并且可以被视为生物系统对遗传因素或环境变化的zuì终反应。细胞代谢组学以单个细胞中的所有代谢物为研究对象,旨在利用细胞中的小分子来构建个体独有的“指纹”,细胞代谢物被认为是研究生物体表型的zuì佳指标。细胞广泛用于疾病研

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  • 未知蛋白序列测试

    未知蛋白序列测试

    未知蛋白序列测试-详情蛋白质分子本身的一级结构是其生物学功能的核心。因此,准确快速地分析蛋白质的完整序列有利于对未知蛋白质的功能研究,对于包括单克隆抗体在内的蛋白质药物的开发和生产具有重要意义。蛋白质从头测序(De novo sequencing)是一种基于质谱的新型测序技术,它可以直接确定蛋白质的氨基酸序列,无需事先了解其DNA序列,也无需任何已知的序列或蛋白质数据库信息,是进行未知蛋白序列分析的shǒu选方法。从头测

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  • 药物蛋白质组学分析

    药物蛋白质组学分析

    药物蛋白质组学分析-详情药物蛋白质组学就是将蛋白质组学技术应用到药物研究领域上,通过对比正常和病理状态下以及药物治疗前后的细胞、组织或生物体的蛋白质表达差异,用于寻找疾病相关的生物标志物,评价药物的治疗效果、结构与活性的关系等。蛋白质组学技术在药物发现和药物开发工程中得到了广泛的应用。蛋白质组被定义为基因组的蛋白质补体,是一种多样化和动态的分子库,在许多方面决定了基因组所采用的功能形式。蛋白质组学

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  • 热蛋白质组分析

    热蛋白质组分析

    热蛋白质组分析-详情热蛋白质组分析(Thermal Proteome Profiling,TPP)将细胞热移位测定(CETSA)的原理与基于多重定量质谱的蛋白质组学相结合,CETSA基于蛋白质在受热时变性并变得不溶的原理,通过在多个温度下监测剩余的可溶性馏分,可以获得每种检测到的蛋白质的熔解曲线。熔化曲线取决于蛋白质的背景,可以通过与小分子(如药物或代谢物)、核酸或其他蛋白质的相互作用或翻译后修饰来改变。百泰派克生物科技采用Thermo Fishe

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  • 气质和液质非靶向代谢组学检测物质

    气质和液质非靶向代谢组学检测物质

    气质和液质非靶向代谢组学检测物质-详情非靶向代谢组学是相对于靶向代谢组学来说的,非靶向代谢组学旨在研究已知和未知的代谢物,识别所有可检测的代谢物,以分析整体代谢特征并发现现象背后的代谢机制。非靶向代谢组学是大规模早期诊断和发现新生物标志物的强大工具。非靶向代谢组学分析通过使用能够检测大量代谢物的技术,可以快速了解样品的代谢特征。气相色谱-质谱联用(GC-MS)与液相色谱-质谱联用(LC-MS)都是强有力的代谢

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  • 鸟枪法蛋白质测序

    鸟枪法蛋白质测序

    鸟枪法蛋白质测序-详情蛋白质测序就是对蛋白质的一级结构即组成蛋白质的氨基酸序列进行测定,蛋白质的一级结构在很大程度上决定了其高级结构和生物学功能。目前,常用的蛋白质序列分析方法主要有末端测序法(Edman降解法和羧肽酶法等)和基于质谱的方法。鸟枪法(Shotgun)蛋白质测序就是一种基于质谱的测序方法,其利用自下而上的质谱分析策略,将蛋白质多重水解成小分子肽段,再对经高效液相色谱分离的肽段进行质谱鉴定,根据肽

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  • 纳米液相色谱-串联质谱分析法

    纳米液相色谱-串联质谱分析法

    纳米液相色谱-串联质谱分析法-详情纳米液相色谱-串联质谱分析法(Nano LC-MS/MS)已成为蛋白质组学领域的重要工具,与传统的LC-MS/MS相比,其灵敏度具有更大的优势,可以在样品有限的情况下分析蛋白/肽混合物,如通过二维凝胶电泳分离的蛋白水解消化的蛋白质。串联质谱法是一种基于片段化模式(MS/MS扫描)鉴定肽的有效技术。它可以为每个肽段生成单独的光谱,从而在肽表征的基础上创建强大的蛋白质鉴定工具。自动数据采集这一重要

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