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生物药氨基酸组成分析
氨基酸分析可以对蛋白质(多肽)类药物氨基酸的组成成分及含量进行测定,并且可以对蛋白质(多肽)类药物中存在的非典型氨基酸进行鉴定。氨基酸组成分析是蛋白质全测序前的必要步骤,同时氨基酸组成分析能够为确认蛋白质一级结构提供有力佐证。百泰派克基于氨基酸衍生技术和HPLC高效液相色谱分析,提供高效精准的蛋白质(多肽)药物氨基酸组成成分分析服务。服务主要包含两个重要步骤:1)对蛋白质及多肽样品进行水解,将他们水解
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蛋白质等电点测定
蛋白质是同时含有带正电荷和负电荷官能团的两性分子,其总电荷通常是由其周围环境的pH值所决定。当外部pH使蛋白质分子的酸性解离和碱性解离相等,即分子所带的正电荷和负电荷相互抵消,此时的pH值被称为该蛋白质的等电点(isoelectric point, pI)。当pH=pI时,蛋白质表面总电荷为零,蛋白质溶解度最小。特定蛋白的等电点是固定的,与该蛋白的组分与构象相关,因此精确测定等电点常用作蛋白鉴定的有效手段。此外,蛋白等电点也是许
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16S/18S/ITS扩增子测序
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,目前主要是应用高通量测序技术对特定环境中特定遗传物质进行测序。大多数天然微生物都不能通过传统的分离培养方法进行分离和克隆,这对于天然微生物定性和定量,探索微生物多样性是严重的挑战。扩增子测序可以克服传统分离培养的弱点,对样品中的微生物进行定性和定量,目前在微生物多样性检测中广泛应用。16S和18S rDNA是细菌和真菌中16s或18s rDNA基因的高变区,而ITS(
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转录组测序
转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录组的集合。转录组测序的主要目的是对所有转录物进行分类,包括mRNAs、非编码RNA和小RNA;根据基因的起始位点、5′端和3′端、剪接模式和其他转录后修饰来确定基因的转录结构;量化每个转录物的表达水平的变化在发育期间和不同条件下的转录本。了解转录组对于解释基因组的功能成分、揭示细胞和组织的分子成分以及理解发育和疾病是必不可少的,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药
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原核生物转录组测序
转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA的集合。转录组测序作为研究转录组的一个技术手段被广泛应用于生物科学研究。分析生物样品的转录组信息,有助于研究细胞中基因转录的情况及转录调控的规律。在原核生物中绝大部分的RNA为rRNA,mRNA只占其全部RNA的1%至5%,因此要对原核生物转录组进行测序必须先对其mRNA进行纯化。此外,原核生物的mRNA并不像真核生物的mRNA具有poly A结构,因此无法直接利用oligo T将其纯化出来
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真核有参转录组测序
转录组测序是对特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA进行测序。转录组测序对从整体水平上研究基因的表达量以及基因结构提供帮助,揭示特定生物学过程中的分子机理。已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等各个领域。真核有参转录组测序,指对已有参考基因组的真核生物或其组织、细胞等进行转录组测序。通过与参考基因组比对,可验证转录组测序的测序饱和度和基因覆盖度,同时可获得基因结构、基因表达差异,和
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宏转录组测序
宏转录组学也称为环境转录组学,指从整体水平上研究某一特定环境、特定时期菌群群体全部基因转录情况以及转录调控规律,以揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的相互作用机理。其适用范围包括人体微生态、环境、工业、农业等领域。宏转录组学以生态环境中的全部RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。百泰派克生物科技转录组测序服务基于Illumina高通量测序
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脂质组学与蛋白质组学整合分析
脂质组学是代谢组学的一个重要分支,是对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,了解脂质的结构和功能,进而揭示脂质代谢与生命活动的关系的科学。蛋白质组学是从整体水平上分析一个生物体、组织或细胞中的蛋白质组成及其活动规律的科学。整合脂质组学与蛋白质组学数据对生物样本进行研究,可以更系统全面地解析生物分子功能和调控机制,筛选重点生物通路或者基因、脂质代谢产物及蛋白酶等进
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转录组学与代谢组学整合分析
转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内完整转录信息的集合,代表了基因表达的中间状态。代谢组学是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物)的大规模研究。代谢物是生物体在内外调控下基因转录的最终结果,是生物体表型的物质基础。将生物样本进行转录组学和代谢组学整合分析,从原因和结果两个层次分析生物体的内在变化,可以更系统全面地解析生物分子功能和调控机制,实现对生物变化大趋势及方向的了解,进
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转录组学和蛋白质组学整合分析
转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的集合,代表了基因表达的中间状态。转录组测序可以对所有转录物进行分类、确定基因的转录结构、量化转录物的表达水平。蛋白质是生命功能的直接执行者,蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。整合转录组学和蛋白质组学的表达数据对生物样本进行研究,可以从整体上解释生物学问题,探究生物体生理和疾病机理等。百泰派克生物科技基于Illumina高通量测序平台的转录
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蛋白质组学与代谢组学整合分析
蛋白质组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。代谢组是一种细胞乃至一种生物所有代谢物的集合。代谢物的产生和代谢是一系列调节事件的最终结果,蛋白质组引起的功能改变会在代谢层面放大。将生物样本进行蛋白质组学和代谢组学整合分析,可以相互验证和相互补充,从而更系统全面地解析生物分子功能和调控机制,实现对生物变化大趋势及方向的了解。百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nano
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翻译后修饰蛋白组分析
蛋白质翻译后修饰(PTMs)是指蛋白质在翻译中或翻译后的化学修饰过程。蛋白质翻译后修饰(PTMs)通过给蛋白质添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能团增加蛋白质组的功能多样性,并影响正常细胞生物学和发病机理的几乎所有方面。蛋白质翻译后修饰在许多细胞过程中起着关键作用,如细胞分化、蛋白质降解、信号传导和调节过程、基因表达调节以及蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰PTMs通常包括磷酸化、糖基化、泛素化、亚硝基化、甲
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蛋白磷酸化质谱检测
蛋白磷酸化质谱检测可以检测蛋白磷酸化类型和位点等情况,可以用于磷酸化定量蛋白组学的研究。百泰派克生物科技提供磷酸化定量蛋白组学研究的服务。蛋白磷酸化质谱检测顾名思义,蛋白磷酸化质谱检测就是利用质谱技术检测蛋白质的磷酸化。质谱分析蛋白磷酸化包括:识别磷酸化多肽的存在,根据氨基酸序列确定磷酸化类型,确定磷酸化的位点,以及对磷酸化蛋白进行定量。由于磷酸化修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,磷酸化
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蛋白质甲基化质谱
蛋白质甲基化是常见的蛋白质翻译后修饰,主要发生在组蛋白和转录因子蛋白上,部分细胞质蛋白也可发生甲基化修饰。在甲基转移酶的作用下,甲基酶促转移到蛋白质的某个残基上,如赖氨酸、精氨酸、组氨酸、半胱氨酸和天冬酰胺等,发生甲基化修饰。蛋白甲基化质谱分析就是利用质谱技术检测蛋白是否发生甲基化,以及在哪个氨基酸位点发生何种甲基化。其基本原理是利用液相色谱串联质谱将分离、富集得到的甲基化肽段进行分析,再根据质谱
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蛋白质组学生物信息学分析
随着蛋白质组学质谱分析技术的发展,蛋白质组学分析仪器精度不断提高,由此获得的数据也更多。虽然详细的蛋白质数据信息有利于对蛋白质组学进行更为深入的研究,但是高通量蛋白质组学检测生成的大量蛋白质样本数据也给蛋白质样品特征分析带来升级的挑战。依靠人工处理如此庞大的质谱信息,分析蛋白质的特征的难度极大,因此这些蛋白组学数据需要采用专业生物信息学的方法进行分析处理。百泰派克公司生物信息学分析人员专业从事蛋白
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磷酸化蛋白质组学
磷酸化蛋白质组学是专门研究磷酸化蛋白的一门科学,包括在组学水平上对磷酸化蛋白进行定性和定量分析。百泰派克生物科技提供磷酸化定量蛋白组学研究服务。磷酸化蛋白质组学磷酸化是蛋白质最常见的翻译后修饰方式之一,是生物最重要的调控修饰形式。在哺乳动物的细胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白磷酸化参
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蛋白质磷酸化检测的经典方法32P
放射性标记是一种传统的蛋白质磷酸化检测技术。该方法利用被32P标记的ATP对细胞进行培养,进而使磷酸化蛋白质通过细胞代谢被32P标记上,然后将提取的蛋白样品进行凝胶电泳或色谱分离,最后通过放射自显影进行检测,实现蛋白质磷酸化的鉴定。该方法检测灵敏度高、结果直观。但由于丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸等的磷酸化和去磷酸化代谢速率不同,对某些磷酸化转化速率较低的蛋白质可能检测不到;且存在放射性污染,对环境有一定的危害。
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4D蛋白质组学
质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析,根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前,蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量,即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility),主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分
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蛋白磷酸化位点分析
蛋白磷酸化位点分析是对蛋白质发生磷酸化的氨基酸残基位点进行鉴定。百泰派克生物科技提供磷酸化定量蛋白组学的服务。蛋白磷酸化位点蛋白质磷酸化位点指的是蛋白质被磷酸化的具体的氨基酸残基位点。大多数磷酸化蛋白不只含有一个磷酸化位点。组氨酸、天冬氨酸和谷氨酸残基是原核生物中常见的蛋白质磷酸化位点;丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基是真核生物中常见的蛋白磷酸化位点;精氨酸、赖氨酸和半胱氨酸等也是已知的磷酸化位点。磷酸
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蛋白质磷酸化位点分析
蛋白质磷酸化是一类由蛋白激酶催化的重要的蛋白质翻译后修饰,是在蛋白激酶的作用下,三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)的末端磷酸分子断裂并与底物蛋白氨基酸残基共价结合的过程。蛋白质磷酸化位点分析主要研究蛋白质磷酸化发生在肽链的几号位氨基酸上以及发生在何种氨基酸上。可通过磷酸酶法或串联质谱测序法进行检测,将样品蛋白进行酶解,得到肽段混合物,然后特异性识别并富集发生磷酸化的肽段,再对该肽段的氨基酸序列进
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