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代谢组分析
代谢组分析-详情代谢组分析就是对生物体、器官、组织或细胞中的所有内源代谢物进行分离、定性和定量分析,旨在研究机体响应外界刺激、病理变化以及基因突变等所产生的全部小分子代谢物种类及其动态变化,揭示复杂生物学过程的分子机制。代谢组学分析的大致流程主要包括代谢物样本提取、分离与鉴定、数据分析以及生物学阐释等。代谢物的分离与鉴定就是利用质谱或核磁共振技术对代谢物进行定性定量鉴定,是代谢组分析的重要内容。在
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代谢组和蛋白质组区别
代谢组和蛋白质组区别-详情要了解代谢组和蛋白质组的区别,shǒu先就要了解什么是代谢组,什么是蛋白质组。本期我们就来聊聊代谢组和蛋白质组的区别和联系。代谢组是指一个细胞、组织、器官或者生物体在特定条件下产生的分子质量大多在1000Da以内的所有内源性小分子代谢产物,包括氨基酸、多肽、糖类、有机酸、脂质、尿素、维生素、丙酮酸、辅因子、核苷和核苷酸等。蛋白质组是一个生物体在特定时间表达的所有蛋白质或一个体系中的
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代谢组学swath
代谢组学swath-详情代谢组学研究的主要内容就是对样品中(一般为复杂混合代谢物样品)的小分子代谢物进行定性和定量鉴定,再结合其他生信分析寻找某一生物进程代谢通路的关键代谢物,构建代谢通路的分子模型,帮助我们从本质上认识生命活动的规律。色谱-串联质谱技术是常用的代谢组学分析技术,色谱可以将代谢物与其他杂质以及各代谢物组分分离开来,再利用质谱技术检测扫描并采集代谢物离子的质谱信息对代谢产物进行定性和定量鉴
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代谢组学 糖类
代谢组学 糖类-详情糖类代谢组学就是专门定性和定量研究糖类物质以及糖代谢途径产生的相关物质的靶向代谢组学。糖类是机体直接的供能物质,为各项生命活动提供所需的能量。从化学结构上看,糖类是一类含有多羟基的醛/酮或水解产生这些物质的化合物。按照聚合的程度,可以将糖类分为单糖(葡萄糖等)、寡糖(蔗糖、麦芽糖和乳糖等)和多糖(淀粉、糖原和纤维素等)。糖类不仅是生物体内主要的能源物质,还可作为细胞膜的重要结构成
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代谢组学 血清
代谢组学 血清-详情血清是血液的重要组成部分,离体血液自然凝固后析出的淡黄色液体就称为血清,由于血液自然凝固时纤维蛋白原变成了纤维蛋白,所以血清不含纤维蛋白原。血清约含有1000多种内源性小分子代谢物,是一种重要的代谢组学研究样本,其内容物成分复杂多样且jí性跨度大,主要包括血浆蛋白、生长因子、激素、无机离子、氨基酸、葡萄糖、核苷、脂类和固醇等。血清中的代谢物来源于机体的各个代谢途径,对血清中的代谢物进
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代谢组学 脂质组学
代谢组学 脂质组学-详情代谢组学是对机体产生的所有内源性小分子代谢物进行研究的科学,这些代谢物的分子质量通常不超过1000Da,主要包括氨基酸、多肽、脂质、碳水化合物以及有机酸等。因此,脂质是代谢组学研究的物质之一,脂质组学也是代谢组学的一个重要分支。脂质是生物体内一大类不易溶于水而jí易溶于非jí性有机溶剂,如乙醚、氯仿和丙酮等的碳水化合物,它们种类和数量复杂多样且在结构上有很大的差别,主要包括脂肪酸、糖
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代谢组学定量分析与非定量分析
代谢组学定量分析与非定量分析-详情代谢组学分析的主要任务就是对混合样品中的各代谢物组分进行定性和定量鉴定,常用的分析技术包括质谱技术或核磁共振等技术。质谱技术通常需要与色谱技术如气相色谱或液相色谱联用。除了定性鉴定外,还可以利用生物信息学方法进行其他非定量分析,包括如聚类分析、多元统计分析、差异分析、差异KEGG富集分析以及趋势分析等。统计学分析可以用于判断样品的重复性、筛选差异代谢物以及进行遗传分析
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代谢组学如何鉴别代谢物
代谢组学如何鉴别代谢物-详情代谢物的鉴定是代谢组学(Metabolomics)研究的重要内容之一,鉴定代谢物就是确定代谢物的种类,对代谢物进行定性鉴定。质谱法(MS)和核磁共振法(NMR)是代谢组学zuì常用的分析方法,二者均可实现代谢物的定性鉴定。质谱法通常与色谱分离技术联合使用,其基本原理是利用色谱技术的分离功能将不同的代谢物质分离开来,然后再进行质谱鉴定,经质谱仪的离子源处理后的代谢物电离为不同质荷比的代谢物,
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代谢组学用血清还是血浆
代谢组学用血清还是血浆-详情血液是常用的也是重要的代谢组学分析样本,通过不同的收集处理方式可以制备不同的血液样本:血清和血浆。血清是离体血液自然凝固后离心收集的上清液,主要包括各种蛋白、多肽、氨基酸、脂类、碳水化合物、生长因子、激素、无机物等。血浆是离体血液加入抗凝剂后离心收集的上清液,与血清相比,血浆中含有纤维蛋白原,也可以说血清是不含纤维蛋白原的血浆。总之,血清和血浆所含的内容物种类差别不大,
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代谢组学植物
代谢组学植物-详情代谢组学是研究生物体、器官、组织以及细胞所产生的所有小分子代谢物科学,植物代谢组学顾名思义就是专门研究各种植物体所产生的全部代谢物,主要是对不同物种在不同生长时期或受某种刺激前后所表达的所有小分子代谢产物进行定性、定量分析,是代谢组学的一个重要分支。植物的种类和数目庞大,目前已知的植物有30万余种,其产生的初生代谢物和次生代谢物的种类更为惊人,这些结构迥异的代谢物不仅在植物体的生理
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代谢组学质谱
代谢组学质谱-详情代谢组学主要是通过对生物体的内源性小分子代谢物进行定性和定量分析来阐明机体在不同生长时期或受其他刺激时的分子机制,揭示生命活动的本质规律。质谱技术可以对化合物进行快速高效的定性分析和准确的定量,是代谢组学分析的强有力工具。代谢组学质谱就是利用质谱技术进行代谢组学分析,通常联合质谱技术与色谱技术分析复杂混合代谢物样本,色谱技术主要用于实现各代谢物的分离。色谱-质谱联用技术包括液相色谱
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代谢组 转录组联合分析
代谢组 转录组联合分析-详情转录组是指生物体在特定生长发育时期或不同生理病理条件下转录得到的所有mRNA的集合。根据中心法则可知,DNA通过转录成mRNA再翻译成蛋白质,mRNA在遗传法则中处于中央枢纽地位,可以作为桥梁将基因表达与下游的zuì终翻译物质联系起来。转录组分析是功能基因的研究利器,分析转录组学数据可以得到大量差异表达的基因以及众多调控网络,但是难以确定关键调控途径以及控制关键途径的物质。代谢组是指生物
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单蛋白修饰鉴定
单蛋白修饰鉴定-详情蛋白质的不同氨基酸位点可以在相关酶的作用下共价结合不同的官能基团进行多种翻译后修饰,包括磷酸化、糖基化、泛素化、亚硝基化、甲基化和乙酰化等,这些翻译后修饰大大丰富了蛋白质的生物学功能。单蛋白修饰鉴定就是指对单个蛋白质进行翻译后修饰鉴定,包括修饰类型、修饰位点以及对修饰的含量等进行鉴定。液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术是进行蛋白质修饰鉴定的shǒu选技术,可以同时实现修饰类型、修饰
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单抗轻重链的CDR序列检测
单抗轻重链的CDR序列检测-详情单克隆抗体是由单一B淋巴细胞克隆产生的高度均一且只特异性识别并结合某一抗原的免疫球蛋白,其与普通的抗体一样都由两条较短、分子质量较小的轻链(L链)和两条较长、分子质量较大的重链(H链)组成。L链和H链都包含氨基酸序列变化较大的可变区(V区)和氨基酸序列相对稳定的恒定区(C区)。在V区内存在一些氨基酸序列十分容易发生变异的区域,称之为高变区(HVR)或抗原互补决定区(CDR),CDR是整
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单抗糖分析
单抗糖分析-详情单克隆抗体是专一性识别并结合特异抗原的免疫球蛋白,由单一的B淋巴细胞克隆产生,目前已广泛开发为生物类药物并应用于各种疾病如传染病、肿瘤以及自身免疫性疾病等的治疗之中,并显示出良好的治疗效果,在生物技术药物开发领域具有广阔的应用前景。单克隆抗体的生物学活性和功能除了受其本身的氨基酸序列影响外,还受翻译后修饰影响,如糖基化、二硫键以及末端赖氨酸剪切等。糖基化修饰是单克隆抗体药物中zuì常见
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单克隆抗体可以二代测序吗
单克隆抗体可以二代测序吗-详情单克隆抗体是由氨基酸组成的一类免疫球蛋白,其本质是一种蛋白质。而二代测序技术是一种DNA测序技术,其测序原理是根据DNA的性质决定的,因此不能直接用于检测蛋白质,但是可以利用反转录法则获得编码单克隆抗体的cDNA序列,再通过二代测序技术检测cDNA的序列,根据遗传信息的中心法则可以推导单克隆抗体的氨基酸序列。简而言之,二代测序技术不能直接检测单克隆抗体,但是可以根据反转录获得的编码
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单细胞代谢组
单细胞代谢组-详情细胞是生物体形态结构的zuì基本组成单位,是所有生命运动的基础,其生命活动和新陈代谢状态与生物体的生长发育分化、信息交流、遗传进化以及衰老死亡等密切相关。单细胞代谢组学以单个细胞产生的所有分子质量小于1kD的代谢物为研究对象,通过对这些代谢物进行定性定量鉴定寻找关键的代谢通路以及代谢物,旨在揭示生物体生理病理等生命活动的基本规律。由于单细胞难以获取、细胞代谢物质种类繁多且浓度和组成都处
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单细胞蛋白质组学质谱
单细胞蛋白质组学质谱-详情蛋白质组学就是研究生物体不同时期所表达的全部蛋白质或系统中所包含的所有蛋白质的科学,通过对生命物质的承担者—蛋白质进行定性定量等多重分析可以解释众多疾病发病的分子机理,为疾病治疗提供相关的理论根据和解决途径。单细胞蛋白质组学顾名思义就是对单个细胞中的所有蛋白质进行分析,从蛋白质水平解释细胞的多样性和复杂性,可以实现细胞异质性以及细胞类型的评估,并用于推断细胞类型与蛋白质种
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单一蛋白纯化
单一蛋白纯化-详情蛋白质是机体通过遗传表达产生的一种生物大分子,存在于细胞、组织和器官中。要获取蛋白质通常需要利用特殊方法从各种组织混合液中进行提取,此时一些蛋白提取试剂或者组织液中的其他内含物以及除目标蛋白质以外的其他蛋白质可能会同时被提取出来,造成蛋白污染,影响后续的蛋白质检测。此外,一些不纯的蛋白质类药物或产品会影响其药性以及安全性,因此进行蛋白质纯化就显得十分重要。蛋白质纯化主要是为了去除
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蛋白PRM
蛋白PRM-详情PRM(Parallel Reaction Monitoring)平行反应监测技术是在多反应监测技术(MRM)的基础上发展起来的靶向定量蛋白质技术,其通过特殊的数据采集技术选择性的检测、扫描目标蛋白质或肽段离子从而实现目标蛋白质或肽段的相对/jué对定量。PRM蛋白分析技术建立在高分辨率、高精度的Orbitrap系列质谱仪上,其大致分析流程为利用具有选择能力的四级杆质量分析器选择目标蛋白/肽段母离子并在碰撞池进行碎裂,然后通过高分辨
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