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差异代谢物分析
差异代谢物分析-详情差异代谢物指不同生理病理状态、药物治疗情况下机体产生的不同浓度和比例的内源代谢物,是外源物质、疾病、药物或遗传变异与生命体相互作用的产物,研究差异代谢物可以从本质上了解某一生物表型或生理状态间的差异。通常利用OPLS-DA模型基于相关系数(Correlation Coefficient)以及VIP (Variable importance in the projection)指标进行差异代谢产物筛选,因为这种方法所有跟分组相关的信息都集中在第yī维
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肠道代谢组学
肠道代谢组学-详情肠道代谢组学又称肠道微生物代谢组学,是研究机体肠道内所有微生物及其代谢物的科学。人体肠道内分布有高达100万亿个细菌,其数量接近自身细胞的10倍,基因组总量约为自身基因数目的150倍,有人体“第二基因组”之称,肠道的微生物菌群也被称为人体另一个“器官”。肠道微生物主要通过其小分子代谢物与宿主进行密切的信息交流和相互作用,在代谢、免疫、疾病以及神经系统发展和调控中起到了重要作用,影响着宿主
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电子电离
电子电离-详情电子电离(Electron ionization,EI),也称为电子碰撞电离和电子轰击电离,是用于鉴定给定有机化合物的zuì有效的质谱方法之一的基础。它是一种电离方法,其中高能电子与固相或气相中的原子或分子相互作用而产生离子。由于该技术使用高能电子来产生离子,因此被认为是硬电离方法(高碎片化)。这会导致广泛的碎裂,从而有助于未知化合物的结构测定。EI可用于分子量小于600的有机化合物分析。此外,当与各种分离方法
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化学电离
化学电离-详情化学电离(Chemical ionization,CI)是一种软电离技术,是分子和离子反应的研究结果在分析化学中的直接应用。CI始于20世纪50年代,产生的碎片很少,在分析化学中具有巨大的潜力。在化学电离过程中,电子shǒu先轰击试剂气体以生成试剂离子。样品分子随后通过分子和离子反应途径被试剂离子电离。20世纪70年代被认为是化学电离发展的一个里程碑。当时,研究人员解决了化学电离需要在真空环境下工作这一缺点,使化学电
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快速原子轰击
快速原子轰击-详情快速原子轰击(Fast atom bombardment,FAB)是1981年建立的一种电离技术,在质谱系统中被广泛用作离子源。与其他电离技术不同,快速原子轰击用一个中性原子(Xe,Ar)轰击样品使样品电离。中性原子的使用避免了jué缘样品中电荷的积累,并促进了样品的电离。快速原子轰击可以成功地确定不是挥发性或衍生化的化合物,以及一些高分子化合物。而且,快速原子轰击对于测定寡糖、寡肽、寡核苷酸、和热不稳定的有机化
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基质辅助激光解吸电离
基质辅助激光解吸电离-详情基质辅助激光解吸电离(MALDI)是一种质谱软电离技术,MALDI使用激光能量吸收基质以zuì小碎片化的方式从大分子中产生离子。它已被广泛用于测量生物大分子的分子量,例如肽、蛋白质、核酸、聚合物的分子量分布以及低聚物分析。MALDI质谱具有灵敏度高、适用范围广、操作简单的特点。它将以小分子研究为主的传统质谱技术扩展到分析高jí性、不易挥发、热不稳定的样品范围。MALDI方法分为三个步骤。shǒu先
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电喷雾电离
电喷雾电离-详情电喷雾电离(Electrospray ionization,ESI)是一种使用电喷雾向液体施加高电压产生气溶胶来产生用于质谱分析的离子的技术。由于生物大分子相对易碎,它们的结构在解离和电离过程中很容易被破坏。电喷雾电离则克服了这些分子在电离时碎裂的趋势。电喷雾电离与其他大气压电离过程不同,电喷雾电离可能会产生多电荷离子,这有效地扩展了分析仪的质量范围,以适应所观察到kDa-mDa的蛋白质及其相关肽的大小。电喷雾电离
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大气压光电离
大气压光电离-详情大气压光电离(Atmospheric pressure photoionization ionization,APPI)是一种用于液相色谱-质谱(LC-MS)的软电离技术,该技术使用光化学作用来电离气相中的样品。通过质谱,APPI有助于分析检测弱jí性和非jí性化合物。大气压光电离的原理在APPI中,来自液相色谱中的溶剂和样品shǒu先形成气态分析物(M),气态分析物被离子化与光源发出的光子相互作用,然后离子被引入质谱仪中进行分析。在此过程中,分析物
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大气压化学电离
大气压化学电离-详情大气压化学电离(Atmospheric pressure chemical ionization,APCI)是一种新的电离方法,主要作为高效液相色谱和质谱分析中的一个连接技术。大气压化学电离具有广泛的电离范围、高灵敏度和高选择性的特点。它与液相色谱的高效分离能力相匹配,使液相色谱-大气压化学电离质谱成为生物和环境化学领域中的一种标准分析技术。大气压化学电离的原理APCI的示意图在气体辅助下,溶剂和样品流经进样器。溶剂和样品在进
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成像分析
成像分析-详情凝胶电泳技术是一种重要的分离分析技术,目前已发展有多种不同的凝胶电泳技术,如SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)、IEF(等电聚焦电泳)、2-DE(二维电泳)以及2D Blue Native/SDS-PAGE等,不同的电泳技术根据样品物质的不同理化参数进行电泳分离,也可以将不同的电泳技术结合起来对样品进行多个维度的分离。在凝胶电泳实验当中,凝胶图像的分析是zuì后也是zuì关键的一步,其分析结果直接影响到整个
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纯蛋白分子筛
纯蛋白分子筛-详情蛋白纯化是蛋白质组学研究的重要内容,要研究一个蛋白质,shǒu先要将其从生物样品中分离纯化出来。蛋白质的纯度对后续的蛋白质研究也至关重要,含有杂质的样品往往会导致不准确的分析结果。蛋白纯化主要是依据蛋白质的相似性和差异性来开展的,根据蛋白质的相似性可以将蛋白质与非蛋白质区分开来,而不同的蛋白质的分子量和形状等差异可以作为进一步分离的依据。常用的蛋白质纯化方法大多都是基于色谱的技术,根
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纯度、等电点、蛋白浓度
纯度、等电点、蛋白浓度-详情蛋白质纯度、等电点以及浓度是蛋白质分析中重要的理化参数。蛋白纯度在各种蛋白质组学分析中十分重要,纯度越高的蛋白样品实验结果的可靠性越高。等电点是蛋白质基本的特征参数,指蛋白质溶解度zuì低时溶液的pH值,不同的蛋白质等电点也不同。蛋白质的浓度可以用于计算一定量的溶液中蛋白质的含量。蛋白纯度、等电点以及浓度的测定方法各有不同。常用的蛋白纯度测定方法主要有凝胶电泳法、基于色谱的
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纯度SEC检测
纯度SEC检测-详情SEC(Size exclusion chromatography)分子筛色谱也称凝胶过滤色谱或尺寸/体积排阻色谱,是一种zuì温和、zuì简单的液相色谱分离技术,在组织提取液、核酸、蛋白质以及多肽等物质的分离纯化中广泛应用。分子筛色谱主要由色谱柱和检测器构成,色谱柱的填充物为多孔的球形颗粒材料,这种材料能起到像分子筛一样的过滤作用。分子质量较大的物质被排阻在孔外,随流动相从颗粒的间隙中流出色谱柱,洗脱路径和时间较短
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打质谱鉴定的是混合蛋白还是单个蛋白
打质谱鉴定的是混合蛋白还是单个蛋白-详情质谱技术是蛋白质组学分析中zuì主流zuì常用的技术,将蛋白质样品进行质谱分析俗称“打质谱”可以实现多种蛋白分析,包括相对分子质量、空间结构、氨基酸组成和排列顺序、含量、翻译后修饰类型和修饰位点鉴定以及蛋白质相互作用分析等。单一的蛋白质和复杂混合蛋白质样品都可以进行质谱分析,分析的原理也相同,大致流程包括:(1)将蛋白质样品多重酶切为小分子肽段;(2)液相色谱分离
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打质谱鉴定泛素化位点
打质谱鉴定泛素化位点-详情泛素(Ubiquitin,Ub)是一种小分子量多肽,在相关酶的作用下,Ub能通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上,这一过程就称为蛋白泛素化修饰,是真核生物中一种常见的蛋白翻译后修饰。根据蛋白所连接的泛素分子的多少,可以将泛素化分为单泛素化和多泛素化,根据Ub所在的位置又将多泛素化分为多聚泛素化和线形多聚泛素化。因此,一个蛋白质可能有多个泛素化修饰位点,且每个位点可能连接不止有一个泛素分子
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大规模蛋白分析方法
大规模蛋白分析方法-详情质谱技术作为蛋白质组学研究中zuì先进的技术,具有高通量、高灵敏度以及高分辨率的jué对优势,可以说目前没有任何一种技术能超越质谱技术,质谱技术无疑是进行大规模蛋白分析的shǒu选技术。基于“自下而上”(bottom-up)策略的质谱技术,又称鸟枪法(Shotgun),可以同时鉴定细胞裂解液、组织提取液、血清等样品中的成百上千的蛋白质,是大规模研究蛋白质的重要技术。“自下而上”就是通过蛋白肽段来研
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代谢和蛋白关联
代谢和蛋白关联-详情蛋白质组学是研究某种生物体所表达的全部蛋白质或系统中所有蛋白质的科学,蛋白质作为生命活动的执行者,在维持机体正常运行方面发挥着重要作用,其种类和含量的变化与生物体的生长、应激以及疾病等密切相关。因此,蛋白质组学研究对揭示生命活动的本质、寻找疾病相关的生物标志物具有重要意义。代谢组是细胞或机体某个时期全部代谢物质的总和,如脂质、糖类和氨基酸等,这些物质在代谢过程中充当反应的底物或
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代谢通量分析
代谢通量分析-详情代谢通量分析(Metabolic Flux Analysis,MFA)是一种重要的代谢通量组学研究技术,用于定量研究某个目标系统中各个代谢途径的分布情况,通过分析生物系统中各代谢物的产生和消耗速率来刻画生物体的生理状态,以深层次的了解生物体内遗传、代谢调控以及环境因素的相互作用。代谢通量分析通过测定目标体系中的代谢通量的速率和方向来刻画生物体的代谢情况、评估遗传或环境对生命活动的影响。其大致思路是假定一段
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代谢组
代谢组-详情“组”是一个整体的概念,如蛋白质组是指一个生物体表达的全部蛋白质或某一体系中的所有蛋白质。同理,代谢组(Metabolome)就是指一个细胞、组织、器官或者一个生物体在特定状态下产生的所有内源性小分子代谢产物,其分子质量大多在1000Da以内,如氨基酸、多肽、糖类、有机酸、脂质、维生素、辅因子、核苷和核苷酸等。处于基因调控网络、转录表达网络以及蛋白质作用网络下游的代谢组提供的是生物学的终端信息,小分子
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代谢组 转录组 肠道微生物
代谢组 转录组 肠道微生物-详情肠道微生物以其庞大的数量和基因组数目被称为人体的另一个“器官”,也被称为人体的“第二基因组”。这些微生物主要通过小分子代谢产物与机体进行密切的相互作用,影响机体的代谢、免疫、疾病以及神经系统等多个方面,如消化吸收能力、抵御感染风险的能力以及对疾病治疗药物的反应等,在机体的生理病理以及稳态调节中起着重要的作用。转录组是指在特定发育阶段或生理条件下转录得到的所有mRNA 分子的
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