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磷酸化与非磷酸化蛋白的鉴定
磷酸化与非磷酸化蛋白的鉴定-详情蛋白质磷酸化是调节蛋白质功能所需的常见翻译后修饰,在细胞中很常见,对于蛋白质分子的激活或失活是必需的,特别是在影响代谢途径或过程的酶中很常见,这也使得磷酸化蛋白质的研究得到越来越多的关注,磷酸化蛋白研究的内容主要包括磷酸化蛋白的鉴定、水平以及作用等,其中,磷酸化蛋白的鉴定是需要shǒu要解决的问题。磷酸化蛋白的鉴定与天然蛋白(非磷酸化蛋白)的鉴定在内容和方法上都存在差异
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氨基酸成分分析
氨基酸成分分析-详情氨基酸成分分析主要研究蛋白或多肽的氨基酸组成和含量,是多肽和蛋白研究中zuì基本的内容之一。氨基酸是组成生物大分子蛋白质和活性多肽的基本单位,也是维持生物体正常生命活动所必需的物质。此外,氨基酸的成分和含量还影响一些药用物质的功效以及可食用产品的口感和营养价值,氨基酸成分分析已广泛应用于各种食用、药用物质的氨基酸组成和含量研究。目前主要通过氨基酸自动分析仪和高效液相色谱法对多肽或
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磷酸化组学与rna-seq联合分析
磷酸化组学与rna-seq联合分析-详情随着生命科学研究的发展需要,单一的组学分析已不能满足当前的需求,多组学技术由此应运而生。多组学联合分析将两个或两个以上的组学数据整合起来,寻找连接组学之间的关键点,进行网络状的分析,对机体的调控网络和通路进行全面的研究。磷酸化蛋白组学和RNA-seq都是通过研究生物学规律和机制过程进而研究基因表达动态调控的重要工具,将这两个组学的数据进行整合分析,不仅能揭示转录组和蛋白组
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组蛋白修饰位点检测
组蛋白修饰位点检测-详情组蛋白修饰位点检测组蛋白(histones)存在于高等真核生物体细胞染色质中,因富含精氨酸和赖氨酸而呈碱性,可与带负电荷的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合物。在组蛋白酶的作用下,组蛋白会发生不同的修饰,如:甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等。组蛋白修饰在一定程度上会导致转录激活或基因沉默,从而调控基因表达,影响免疫系统和免疫反应,甚至导致肿瘤等疾病的发生。因此,对
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硫巯基化修饰
硫巯基化修饰-详情硫巯基化(S-巯基化,S-sulfhydrate)是一种新发现的在靶蛋白特定半胱氨酸残基上发生的蛋白质翻译后修饰,其通过改变靶蛋白的局部构象和zuì终活性参与广泛的细胞功能和代谢途径,S-巯基化作用被认为介导了由H2S引发的大多数细胞反应。通过在活性半胱氨酸残基中产生氢过硫化物部分(-SSH)或多硫化物,介导由H2S诱导的大部分细胞功能,使与H2S成为向NO和CO一样的气体递质家族中的新成员。百泰派克生物科技采用The
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病毒蛋白质组学
病毒蛋白质组学-详情病毒蛋白质组学病毒(Biological virus)是一种由蛋白质外壳和内部遗传物质组成的结构简单、体积微小的寄生在活细胞内的非细胞型生物,它在宿主细胞内完成增殖、生长、变异等所有生命活动,离开了宿主细胞,病毒将无法生存。病毒的蛋白质外壳是其基因的表达产物,除了可以赋予病毒固定的形态,形成一个独立的空间外,还可以保护遗传物质免遭破坏;此外,蛋白质外壳上的一些受体蛋白可以特异性的识别细胞表面的
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免疫沉淀和质谱分析结果
免疫沉淀和质谱分析结果-详情免疫沉淀和质谱分析即免疫沉淀与质谱联合分析(Immunoprecipitation and Mass Spectrometry,IP-MS),其将免疫沉淀获得的靶蛋白进行后续质谱分析,对靶蛋白进行定性研究,以确认目标蛋白与预期靶标的特异性相互作用。IP-MS分析shǒu先根据目标蛋白选择候选细胞系模型来表达感兴趣的靶蛋白,然后提取细胞裂解物中的靶蛋白进行优化的免疫沉淀实验,zuì后将处理所得的IP洗脱样本并采用质谱法分析,并通
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蛋白质翻译后修饰组学
蛋白质翻译后修饰组学-详情蛋白质翻译后修饰蛋白质是基因功能的执行者,很多蛋白质在加工合成过程中都要经历一个共价修饰的过程,即在相应酶作用条件下,通过在氨基酸残基加上官能基团而改变蛋白质的性质,这种过程称为蛋白质翻译后修饰(post-translation modifications,PTMs)。目前,已发现超过400多种不同的翻译后修饰,主要形式包括糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等。蛋白质翻译后修饰具有重要的生理意义,参与调节
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免疫沉淀与Pull-down实验
免疫沉淀与Pull-down实验-详情免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是一种基于抗体和抗原特异性结合的原理开发的用来检测、分离、纯化蛋白质以及研究蛋白互作的方法。免疫沉淀技术提供结合抗体蛋白的磁珠,将细胞裂解液或组织提取液等蛋白混合体系与磁珠进行孵化,此时,混合体系中的目标蛋白与磁珠上的抗体蛋白实现特异性结合,再通过离心或洗脱去掉没有与抗体蛋白结合的杂蛋白,将目标蛋白分离出来,通过与其他技术(如质谱)结
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HPLC检测蛋白纯度
HPLC检测蛋白纯度-详情HPLC(high performance liquid chromatography)即高效液相色谱,又称高效液相层析法、高压液相色谱,是近20年在液相色谱技术基础上发展起来的新型分析技术,用于不易挥发的有机化合物中各种成分的分离、鉴定和量化。HPLC与液相色谱法的原理基本相同,不同点在于HPLC通过高压泵对混合物施加压力,使其快速通过装有固体吸附剂的色谱柱,分离速度得到提升;此外,高灵敏度的检测器和高效微粒固定相的使用也大
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蛋白质结构分析
蛋白质结构分析-详情蛋白质结构指蛋白质分子的立体空间结构或三维构象,每种天然蛋白质都有其独特的空间结构,行使特定的生物学功能。蛋白质分子具有四种不同的空间结构。蛋白质一级结构又称初级结构,指蛋白质多肽链氨基酸的排列顺序和二硫键的位置。蛋白质的二级、三级和四级结构又称为蛋白质的高级结构。蛋白的二级结构指主链折叠产生的由氢键维系的空间构象,包括α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲等,它们进一步折叠、盘绕
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免疫多肽组学 质谱
免疫多肽组学 质谱-详情免疫肽是一种非经典肽,它是由蛋白质编码区之外的序列或由非经典抗原加工机制产生的抗原,其在免疫系统识别肿瘤以及在癌症的免疫疗法中至关重要。免疫肽组学(Immunopeptidomics)是指使用质谱法(MS)研究主要组织相容性复合物(MHC)I类和II类分子所呈现的免疫肽的组成和动力学的科学,它可以大规模、深入识别和量化所呈现的HLA免疫肽组,是快速推进癌症免疫疗法的重要方法。百泰派克生物科技采用Thermo F
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质谱检测二硫键
质谱检测二硫键-详情蛋白质二硫键蛋白质二硫键(S-S)是由不同蛋白肽链或同一蛋白质肽链上的两个半胱氨酸残基-巯基被氧化而形成的共价键。伴随着二硫键的形成,蛋白质或多肽的空间结构也会发生变化,因此二硫键在维持多肽或蛋白质的空间结构,和由此决定的生物学功能方面有着重要作用。二硫键广泛存在于细胞表面受体、抗体、生长因子、激素、酶、血浆以及毒液等蛋白质中,且容易被还原而断裂或发生错配,从而影响原多肽或蛋白的正
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免疫印迹怎么测定磷酸化的蛋白
免疫印迹怎么测定磷酸化的蛋白-详情免疫印迹(Western blot,WB)是利用抗原抗体特异性结合的原理,基于SDS-PAGE凝胶电泳进行蛋白质分离、纯化以及相互作用研究的技术,也是评估蛋白磷酸化状态的zuì常用方法。蛋白印迹技术先利用SDS-PAGE分离蛋白质样品,随后将电泳条带转移到固相载体膜上(如PVDF或尼龙膜),再利用磷酸化特异的抗体(一抗)来鉴定目的蛋白,能与磷酸化特异抗体结合的蛋白质即为磷酸化蛋白,zuì后通过标记的二
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二硫键检测方法
二硫键检测方法-详情蛋白质二硫键蛋白质二硫键(S-S)是多肽链上两个半胱氨酸残基的硫原子氧化形成的共价键,广泛存在于生物体的各种蛋白质中,如免疫蛋白、蛋白酶、激素、细胞表面受体。不同肽链或同一肽链之间都可以形成二硫键,帮助蛋白质或多肽折叠成独特的空间结构,对其发挥特有的生物功能具有重要意义。二硫键检测方法检测蛋白质二硫键的大体思路如下:shǒu先将样品蛋白水解为肽段混合物,这个过程中要避免二硫键发生重排
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膜蛋白互作蛋白质谱
膜蛋白互作蛋白质谱-详情细胞膜由数百种脂质组成,其中嵌入了不少蛋白质复合物,例如离子通道、受体和支架复合物等,这些蛋白质组装体充当生命基础过程的信号和运输平台,并且是大量治疗药物的靶标。然而,通过质谱分析它们的表达、结构、修饰以及蛋白质与蛋白质相互作用却落后于可溶性蛋白质的类似研究。膜蛋白之间的相互作用分析是了解其功能的重要手段,为结构和功能的研究提供了大量的信息,目前常用的膜蛋白相互作用研究方法
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TMT标记定量蛋白组学
TMT标记定量蛋白组学-详情TMT标记定量蛋白组学定义定量蛋白质组学技术主要分为标记和非标记(Label Free)两类,标记定量蛋白技术又分为体内标记和体外标记两种。TMT(Tandem Mass Tag)是一种体外肽标记技术,TMT标记定量蛋白组学即利用TMT技术对一个生命体或组织的基因组所表达的全部蛋白质或一个混合体系中所有的蛋白质进行精确的定性和定量鉴定,以揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。TMT标记定量蛋白组学研究方法TMT
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膜蛋白质组分析
膜蛋白质组分析-详情膜蛋白是zuì大和zuì重要的蛋白质类别之一,根据膜蛋白与细胞膜或细胞内的细胞器相关或附着的情况,可分为外周膜蛋白或整体膜蛋白。外周膜蛋白通过与膜的外周区域或整体膜结合而与膜相关联,但它们不能完全跨越膜。整体膜蛋白含有疏水性的α-螺旋或β-折叠结构,因此可以跨越整个脂质双层,并通过膜外环区域连接。膜蛋白质组学是蛋白质组学的一个细分分支,是指对一个基因组编码的所有膜蛋白或者机体、器官、
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纳米液相色谱-串联质谱分析法
纳米液相色谱-串联质谱分析法-详情纳米液相色谱-串联质谱分析法(Nano LC-MS/MS)已成为蛋白质组学领域的重要工具,与传统的LC-MS/MS相比,其灵敏度具有更大的优势,可以在样品有限的情况下分析蛋白/肽混合物,如通过二维凝胶电泳分离的蛋白水解消化的蛋白质。串联质谱法是一种基于片段化模式(MS/MS扫描)鉴定肽的有效技术。它可以为每个肽段生成单独的光谱,从而在肽表征的基础上创建强大的蛋白质鉴定工具。自动数据采集这一重要
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蛋白质Pull-down实验
蛋白质Pull-down实验-详情蛋白质Pull-downPull-down实验又称拉下实验,是一种体外亲和纯化技术,蛋白Pull-down技术可以提供一种诱饵蛋白来特异性识别配体蛋白质,以达到富集、分离、纯化某种配体蛋白质的目的,是体外研究蛋白与蛋白相互作用的有力工具。诱饵蛋白的实质是被亲和试剂标签(如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸六肽、生物素)标记的已知的蛋白。蛋白Pull-down可用于证实已知的蛋白或肽的相互作用,也可以用来发掘未知的蛋白
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