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比较蛋白质组学和定向蛋白组学有何优势
比较蛋白质组学和定向蛋白组学有何优势-详情比较蛋白质组学又称差异蛋白质组学,主要是通过比较不同条件下样本的蛋白差异表达,寻找表达水平存在差异的蛋白质,从而揭示机体响应外界环境变化或者自身生长调节的本质,解释生理和病理机制,更好的认识机体生命活动规律。比较蛋白质组学建立在样本所表达的全部蛋白质的分析上,需要对全部蛋白进行无差别分析,尽可能多的定性定量鉴定样品中包含的蛋白质,在此基础上再进行差异蛋白筛
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2023-09-11 09:30
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比较蛋白质组
比较蛋白质组-详情比较蛋白质组又称差异蛋白质组,是指两个样本间存在表达差异的蛋白质组。比较蛋白组学(comparative proteomics)即差异蛋白质组学旨在寻找和鉴定不同条件或状态下(如不同的外界刺激、不同的生长时期等)实验组和对照组样品存在差异表达的蛋白质组。蛋白质作为生命活动的物质承担者调节各种生理活动,其在机体内的种类和含量并不是一成不变的,而是处于动态变化中的,以适应生命体的各种生长变化。对这类蛋白质
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氨基酸的分析与测定
氨基酸的分析与测定-详情对氨基酸进行分析测定主要包括对氨基酸种类和含量进行鉴定,可用于蛋白质、多肽以及蛋白类药物样品的氨基酸组成分析,评估蛋白质水平(即当蛋白质水解时)或鉴定蛋白质,作为肽质量指纹图谱或MS/MS测序的补充方法。目前氨基酸分析的方法主要包括离子交换色谱法(IEC)、高效液相色谱法(HPLC)以及离子色谱法(IC)等。这三种方法都包括分离-衍生-检测的步骤:IEC通过阳离子交换柱分离,柱后茚三酮衍生,利
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氨基酸代谢组学
氨基酸代谢组学-详情氨基酸是生物大分子蛋白质的基本组成单位,由一个中心碳原子、H原子、羧基(-COOH)、氨基(-NH2)和可变的R基组成。近年来发现氨基酸不仅是细胞信号分子,也是基因表达和蛋白质磷酸化级联的调节因子。此外,氨基酸也是合成各种具有重要生物学功能的激素和低分子量含氮物质的关键前体,即这些功能的实现需要一定生理浓度的氨基酸及其代谢物。除了作为蛋白质和多肽的组成部分之外,一些氨基酸还调节生长、繁殖和
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western blot技术
western blot技术-详情蛋白印迹(Western Blot,WB)也称免疫印迹,是一种基于抗体的蛋白质分析技术。利用抗体-抗原的特异性相互作用可以在复杂的蛋白质混合物中识别感兴趣蛋白(目标蛋白质),以实现感兴趣蛋白的定性和半定量分析,在蛋白质表达水平、抗体活性、蛋白质相互作用以及蛋白质翻译后修饰分析中广泛应用。WB主要包括以下步骤:(1)样品分离:利用SDS-PAGE分离蛋白混合物;(2)转膜:将蛋白条带从凝胶转移到固相载体—
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WB检测磷酸化蛋白
WB检测磷酸化蛋白-详情蛋白印迹(Western Blot,WB)是基于免疫学原理的一种蛋白质分析技术,常用于检测组织匀浆提取物中特定蛋白质的存在、大小、含量以及相互作用等。WB已广泛用于蛋白质-DNA相互作用、蛋白质-蛋白质相互作用以及蛋白质翻译后修饰等分析。WB同样可以检测特定样品中磷酸化蛋白的存在、含量以及大小等,只是需要选择能特异识别磷酸化蛋白的一抗。其基本原理是通过一级抗体识别并结合经电泳分离并转移到PV膜上的磷酸
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wb检测蛋白互作
wb检测蛋白互作-详情蛋白质控制着细胞中的所有生物系统,虽然许多蛋白质独立地执行它们的功能,但是jué大多数蛋白质通过与其他蛋白质相互作用来执行各种各样的生物活动。因此,研究蛋白质相互作用对于理解蛋白质功能和细胞生物学至关重要。目前,常用的蛋白质相互作用研究技术主要包括免疫共沉淀(Co-IP)、(GST)Pull-down、交联法、标记转移法、蛋白印迹(Western Blot)以及Far-Western Blot等。蛋白印迹(Western Blot,WB)
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wb蛋白定量
wb蛋白定量-详情"蛋白质印迹(Western blotting,WB)是细胞和分子生物学中的一项重要技术。通过使用蛋白质印迹,研究人员能够从细胞中提取的复杂蛋白质混合物中鉴定出特定的蛋白质。该技术使用通过三个步骤来完成这一任务:(1)按大小进行蛋白分离,(2)将蛋白转移到固体支持物上,(3)使用合适的一级和二级抗体标记靶蛋白进行可视化。WB通常用于分离和鉴定蛋白质的研究,也可用于蛋白含量的鉴定。在这种技术中,根据蛋白质分
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swath-ms
swath-ms-详情"SWATH-MS是一个新兴的用于非标记定量的蛋白质组学平台,该平台基于数据非依赖型采集(DIA)原理,用于同时进行蛋白质鉴定和定量。不同于传统的基于数据依赖型模式的质谱技术如Shotgun和SRM等,SWATH-MS从某种意义上说完整地记录了蛋白样品中任何可检测的前体离子的所有碎片信息,集Shotgun(高通量)和SRM(高准确性和重复性)的优点于一身,正在成为一种将深度蛋白质组覆盖能力与定量一致性和准确性相结合的技术。S
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SRM、MRM与PRM的区别
SRM、MRM与PRM的区别-详情"MRM(Multiple Reaction Monitoring)多重反应监测也称SRM(selected reaction monitoring)选定反应监测,与PRM(Parallel Reaction Monitoring)平行反应监测技术是靶向定量蛋白质组学研究中两种不同的质谱数据采集模式,PRM是在MRM/SRM的基础上发展而来的,两者主要存在以下几点不同之处:(1)MRM/SRM一次监测每个前体离子/产物离子的转变,而PRM以高分辨率和高质量精度分
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SILAC最多可以标记多少样品
SILAC最多可以标记多少样品-详情"SILAC(Stable isotope labeling using amino acids in cell culture)细胞培养条件下稳定同位素标记技术是一种基于质谱的标记定量蛋白质组学方法,使用非放射性同位素标记来检测样品中蛋白质丰度的差异。SILAC通过正常的代谢过程标记细胞蛋白质组,利用含同位素标记的氨基酸培养基培养细胞,通过细胞正常的新陈代谢使所有新合成的蛋白质带上非放射性、稳定的含同位素的氨基酸,zuì后利用液相色谱
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SILAC技术和免疫共沉淀法结合质谱联用技术
SILAC技术和免疫共沉淀法结合质谱联用技术-详情"免疫共沉淀(Co-IP)是基于免疫学原理研究蛋白质相互作用的经典方法,通过使用靶蛋白特异性抗体来间接捕获与特定靶蛋白结合的蛋白,从而识别生理相关的蛋白-蛋白相互作用,并可通过质谱技术来鉴定新的相互作用蛋白质。SILAC(Stable isotope labeling using amino acids in cell culture)细胞培养条件下稳定同位素标记技术是一种基于同位素标记的蛋白定量技术。SILAC方法使用体内新
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shotgun和TMT
shotgun和TMT-详情"Shotgun鸟枪法蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组学分析策略,这种分析策略将完整蛋白质酶解消化为小分子肽段,通过液相色谱进行分离后进行串联质谱分析,根据质谱数据信息如肽段母离子的质荷比(m/z)等结合生物信息学软件进行数据分析,以实现蛋白/多肽序列以及含量分析等。TMT串联质量标签是一种典型的Shotgun基于鸟枪法的蛋白质标记定量技术。同位素标记包括用合成的含有轻或重同位素的试剂化学修饰靶肽,
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shotgun策略蛋白质分析
shotgun策略蛋白质分析-详情"Shotgun鸟枪法蛋白质组学分析是指利用高效液相色谱和质谱联用技术,使用自下而上的蛋白质组学策略鉴定复杂混合物中的蛋白质。鸟枪法蛋白质组学zuì常见分析策略是先酶解消化混合物中的蛋白质,然后用液相色谱(LC)法分离酶解产生的多肽,被分离的肽段在质谱仪中解离成带电荷的离子,通过串联质谱分析获得相应的质谱数据,利用生物信息学软件结合相应蛋白质数据库质谱数据进行分析,从而实现蛋白质的定
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SEC检测
SEC检测-详情"SEC尺寸排阻或凝胶色谱是一种特别适用于高分子量物质的分离分析技术,其使用多孔材料作为固定相,液体作为流动相,多孔材料的孔径约为50-3000Ǻ,与许多分子的大小相似。在这种技术中,分离是根据溶质分子的大小进行的,溶质分子根据多孔材料孔径的大小穿透球形材料。小分子比大分子渗透得更快,大分子经常被排除在小孔之外,这导致分子通过色谱柱的速度不同从而实现不同分子的分离。SEC检测是zuì被大众认可的测定大
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sec蛋白分析
sec蛋白分析-详情"尺寸排阻色谱SEC是一种基于组分分子尺寸的色谱分离技术。利用 SEC,分子可按其在溶液中的尺寸从大到小依次分离。非常大的分子将被排出柱床, 在死体积内zuì先洗脱;大小适中的分子依据其体积的不同可以不同程度地渗透进微孔中;而zuì小的分子在微孔结构中扩散zuì深,从而zuì后洗脱。与其他色谱模式不同,SEC 的分离不依靠分析物和色谱柱固定相之间的任何化学作用。这是从多种干扰物(包括聚集体、赋形剂、细
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sec测蛋白纯度
sec测蛋白纯度-详情"尺寸排阻色谱(Size exclusion chromatography,SEC)也称为体积排阻色谱、分子筛色谱或凝胶过滤色谱,是所有色谱技术中zuì温和的一种液相色谱。SEC根据分子大小差异通过填充在色谱柱中的树脂对其进行分离,这种树脂是一种多孔的球形颗粒,当水溶液样品进入色谱柱时,大小介于孔径之间的分子可以渗透到孔隙中,洗脱时间较长;而大于孔径的分子无法进入孔隙,只能从颗粒间隙流过,因此会zuì先被洗脱出来。SEC
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SDS-PAGe可以跑出蛋白纯度吗
SDS-PAGe可以跑出蛋白纯度吗-详情"SDS-PAGE聚丙烯凝胶电泳是一种基于分子质量的高分辨率大分子化合物电泳分离技术,被测物由于相对分子质量不同导致其在凝胶中的迁移速率不同而分离开来。根据SDS-PAGE电泳的原理可知,SDS-PAGE可以间接判断蛋白质样品的纯度,将未知纯度的蛋白质样品进行SDS-PAGE凝胶电泳,观察电泳结束后产生的蛋白条带,若凝胶上有且仅有一个蛋白条带,则说明该蛋白样品只含有一种蛋白质;反之,若观察到不止一个
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sds-page鉴定目的蛋白质
sds-page鉴定目的蛋白质-详情"SDS-PAGE十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种zuì常用的高分辨率分析分离电泳技术。电泳通过施加电场使带电分子在基质中移动,在这种技术中,影响带电分子迁移率的因素包括其本身的相对分子量、电荷以及结构等。SDS-PAGE用阴离子去污剂对待检测样品进行初始变性,赋予所有待测分子与其分子量成比例的负电荷,再结合聚丙烯酰胺凝胶可以消除结构以及电荷的影响,使待测物质仅根据其分子量的差异进行
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SDS-PAGE电泳鉴定抗体纯度
SDS-PAGE电泳鉴定抗体纯度-详情"抗体是免疫系统响应进入体内的外来分子而产生的宿主蛋白质。这些外来分子被称为抗原,它们被免疫系统的分子识别并产生能够结合特定抗原的抗体。抗体由B淋巴细胞产生,并在血液和淋巴液中循环,特异性结合并清除外来抗原。抗体可制造成探针,用于在各种研究和诊断应用中检测感兴趣的分子,一些新型的蛋白类抗体药物便由此产生。抗体生产是指产生可用的特异性抗体的整个过程,包括免疫原制备、免疫、
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