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蛋白质Pull-down实验
蛋白质Pull-down实验-详情蛋白质Pull-downPull-down实验又称拉下实验,是一种体外亲和纯化技术,蛋白Pull-down技术可以提供一种诱饵蛋白来特异性识别配体蛋白质,以达到富集、分离、纯化某种配体蛋白质的目的,是体外研究蛋白与蛋白相互作用的有力工具。诱饵蛋白的实质是被亲和试剂标签(如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸六肽、生物素)标记的已知的蛋白。蛋白Pull-down可用于证实已知的蛋白或肽的相互作用,也可以用来发掘未知的蛋白
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TMT标记定量蛋白组学
TMT标记定量蛋白组学-详情TMT标记定量蛋白组学定义定量蛋白质组学技术主要分为标记和非标记(Label Free)两类,标记定量蛋白技术又分为体内标记和体外标记两种。TMT(Tandem Mass Tag)是一种体外肽标记技术,TMT标记定量蛋白组学即利用TMT技术对一个生命体或组织的基因组所表达的全部蛋白质或一个混合体系中所有的蛋白质进行精确的定性和定量鉴定,以揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。TMT标记定量蛋白组学研究方法TMT
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二硫键检测方法
二硫键检测方法-详情蛋白质二硫键蛋白质二硫键(S-S)是多肽链上两个半胱氨酸残基的硫原子氧化形成的共价键,广泛存在于生物体的各种蛋白质中,如免疫蛋白、蛋白酶、激素、细胞表面受体。不同肽链或同一肽链之间都可以形成二硫键,帮助蛋白质或多肽折叠成独特的空间结构,对其发挥特有的生物功能具有重要意义。二硫键检测方法检测蛋白质二硫键的大体思路如下:shǒu先将样品蛋白水解为肽段混合物,这个过程中要避免二硫键发生重排
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质谱检测二硫键
质谱检测二硫键-详情蛋白质二硫键蛋白质二硫键(S-S)是由不同蛋白肽链或同一蛋白质肽链上的两个半胱氨酸残基-巯基被氧化而形成的共价键。伴随着二硫键的形成,蛋白质或多肽的空间结构也会发生变化,因此二硫键在维持多肽或蛋白质的空间结构,和由此决定的生物学功能方面有着重要作用。二硫键广泛存在于细胞表面受体、抗体、生长因子、激素、酶、血浆以及毒液等蛋白质中,且容易被还原而断裂或发生错配,从而影响原多肽或蛋白的正
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蛋白质结构分析
蛋白质结构分析-详情蛋白质结构指蛋白质分子的立体空间结构或三维构象,每种天然蛋白质都有其独特的空间结构,行使特定的生物学功能。蛋白质分子具有四种不同的空间结构。蛋白质一级结构又称初级结构,指蛋白质多肽链氨基酸的排列顺序和二硫键的位置。蛋白质的二级、三级和四级结构又称为蛋白质的高级结构。蛋白的二级结构指主链折叠产生的由氢键维系的空间构象,包括α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲等,它们进一步折叠、盘绕
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HPLC检测蛋白纯度
HPLC检测蛋白纯度-详情HPLC(high performance liquid chromatography)即高效液相色谱,又称高效液相层析法、高压液相色谱,是近20年在液相色谱技术基础上发展起来的新型分析技术,用于不易挥发的有机化合物中各种成分的分离、鉴定和量化。HPLC与液相色谱法的原理基本相同,不同点在于HPLC通过高压泵对混合物施加压力,使其快速通过装有固体吸附剂的色谱柱,分离速度得到提升;此外,高灵敏度的检测器和高效微粒固定相的使用也大
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蛋白质翻译后修饰组学
蛋白质翻译后修饰组学-详情蛋白质翻译后修饰蛋白质是基因功能的执行者,很多蛋白质在加工合成过程中都要经历一个共价修饰的过程,即在相应酶作用条件下,通过在氨基酸残基加上官能基团而改变蛋白质的性质,这种过程称为蛋白质翻译后修饰(post-translation modifications,PTMs)。目前,已发现超过400多种不同的翻译后修饰,主要形式包括糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等。蛋白质翻译后修饰具有重要的生理意义,参与调节
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病毒蛋白质组学
病毒蛋白质组学-详情病毒蛋白质组学病毒(Biological virus)是一种由蛋白质外壳和内部遗传物质组成的结构简单、体积微小的寄生在活细胞内的非细胞型生物,它在宿主细胞内完成增殖、生长、变异等所有生命活动,离开了宿主细胞,病毒将无法生存。病毒的蛋白质外壳是其基因的表达产物,除了可以赋予病毒固定的形态,形成一个独立的空间外,还可以保护遗传物质免遭破坏;此外,蛋白质外壳上的一些受体蛋白可以特异性的识别细胞表面的
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组蛋白修饰位点检测
组蛋白修饰位点检测-详情组蛋白修饰位点检测组蛋白(histones)存在于高等真核生物体细胞染色质中,因富含精氨酸和赖氨酸而呈碱性,可与带负电荷的双螺旋DNA结合成DNA-组蛋白复合物。在组蛋白酶的作用下,组蛋白会发生不同的修饰,如:甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等。组蛋白修饰在一定程度上会导致转录激活或基因沉默,从而调控基因表达,影响免疫系统和免疫反应,甚至导致肿瘤等疾病的发生。因此,对
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氨基酸成分分析
氨基酸成分分析-详情氨基酸成分分析主要研究蛋白或多肽的氨基酸组成和含量,是多肽和蛋白研究中zuì基本的内容之一。氨基酸是组成生物大分子蛋白质和活性多肽的基本单位,也是维持生物体正常生命活动所必需的物质。此外,氨基酸的成分和含量还影响一些药用物质的功效以及可食用产品的口感和营养价值,氨基酸成分分析已广泛应用于各种食用、药用物质的氨基酸组成和含量研究。目前主要通过氨基酸自动分析仪和高效液相色谱法对多肽或
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差异蛋白质组学
差异蛋白质组学-详情差异蛋白质组学差异蛋白质组学是蛋白组学的一个分支,蛋白组学研究的是一个体系的所有蛋白质,而差异蛋白质组学旨在寻找和鉴定不同样本或不同状态下的同一样本间蛋白组的差别和变化。生物体不同生长、发育及生理过程中,蛋白质种类和水平也不尽相同,对这类蛋白质组的组成和含量进行研究,即差异蛋白质组研究,可以揭示生命活动的本质,如:细胞调控机理、细胞应激反应途径等。差异蛋白质组学研究方法常用的差
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IP与Co-IP
IP与Co-IP-详情IP技术IP(Immunoprecipitation)免疫沉淀技术,是一种基于抗体和抗原特异性结合的原理开发的用来检测、分离、纯化蛋白质以及研究蛋白互作的方法。免疫沉淀技术通过结合抗体蛋白的磁珠,将细胞裂解液或组织提取液等蛋白混合体系与磁珠进行孵化。混合体系中的目标蛋白与磁珠上的抗体蛋白实现特异性结合,再通过离心或洗脱去掉没有与抗体蛋白结合的杂蛋白,将目标蛋白分离出来。通过与其他技术(如质谱)结合可以鉴定
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氨基酸序列测定
氨基酸序列测定-详情氨基酸序列测定氨基酸序列指蛋白质或多肽分子的氨基酸排列顺序,是蛋白质一级结构的一部分,在很大程度上决定了蛋白质或多肽的高级结构和生物学功能。因此,氨基酸序列测定有助于研究功能蛋白或活性多肽作用的机理,也为人工合成活性多肽提供了依据。氨基酸序列测定方法氨基酸序列测定方法主要包括传统的Edman降解测序法和质谱法:传统的Edman降解测序法操作较繁琐,不能对N末端封闭或修饰的序列进行测定。基于
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GST pull-down实验
GST pull-down实验-详情GST pull-down实验原理Pull-down(拉下实验)是一种体外亲和纯化蛋白的技术,Pull-down技术利用被亲和试剂标签(如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸六肽、生物素)标记的已知的蛋白特异性识别混合体系中的配体蛋白,以达到富集、分离、纯化某种配体蛋白质的目的,是体外研究蛋白与蛋白相互作用的有力工具。当诱饵蛋白被谷胱甘肽S-转移酶(GST)标记时进行的Pull-down实验,称为GST pull-down实验,也称GST pull-do
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Shotgun蛋白质鉴定
Shotgun蛋白质鉴定-详情Shotgun蛋白质鉴定原理Shotgun(鸟枪法)蛋白质鉴定基于质谱技术对混合体系中的蛋白质进行定性鉴定。其基本原理为利用液相色谱分离经酶解的肽段,被分离的肽段在质谱仪中解离成带电荷的离子,通过串联质谱分析获得相应的质谱数据,利用生物信息学软件结合相应蛋白质数据库质谱数据进行分析,从而实现蛋白质的鉴定。Shotgun蛋白质鉴定技术相比传统的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D-PAGE)鉴定技术来说,Shotgun
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串联质谱鉴定蛋白质
串联质谱鉴定蛋白质-详情串联质谱鉴定蛋白质原理串联质谱通过检测在质谱中获得的肽段碎片的分子质量来鉴定蛋白质,鉴定内容包括蛋白质的分子质量、蛋白质或多肽一级结构以及修饰位点等。经过酶解的肽段在质谱仪中按照一定的规律解离成不同系列的离子,通过分析不同系列相邻离子的质量差等质谱数据推算氨基酸的质量及序列,进一步分析得到蛋白或多肽的分子质量和结构等信息。串联质谱鉴定蛋白质技术蛋白质串联质谱鉴定技术基于肽段
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蛋白质圆二色谱分析
蛋白质圆二色谱分析-详情圆二色谱圆二色谱也称圆二色光谱,是一项依据圆二色性(circular dichroism,CD)发展而来的分析技术。圆二色性是指当平面偏振光经过光活性物质时,由于光活性物质对左、右圆偏振光的吸收不同,导致左、右圆偏振光变成椭圆偏振光的现象。大多数具有活性的生物大分子由于其不对称的空间结构都具有光学活性,均可作为圆二色谱研究的对象。蛋白质圆二色谱分析圆二色谱分析利用光活性物质(如有机化合物、生物
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Edman测序
Edman测序-详情Edman测序原理Edman测序又称Edman降解法测序,是由埃德曼在上世纪50年代创立的用于测定蛋白质一级结构的方法。Edman测序基本原理是将蛋白多肽的N端氨基酸用化学方法依次断裂,每次只断裂一个氨基酸,通过高效液相色谱(HPLC)分析断裂后氨基酸片段,再将少了一个氨基酸的多肽链回收,重复进行以上操作,直到zuì后鉴定出整条多肽链的氨基酸排列顺序。Edman测序技术Edman测序技术每一次循环只能鉴定一个氨基酸,大致
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Label Free蛋白定量
Label Free蛋白定量-详情Label Free蛋白质是生命物质的承担者,生物体的组织或细胞内的蛋白质种类和含量的变化与其生命机能有着密切的联系。定量蛋白质组学把一个细胞、组织或生命体中所有的蛋白质或一个混合体系中(通常为体外)所有的蛋白质作为研究对象,对其进行精确的定量和鉴定,用于揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。定量蛋白组学技术包括标记和非标记两类,Label Free是一种非标记蛋白质定量技术,基于液相色谱
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Co-IP质谱分析
Co-IP质谱分析-详情Co-IPCo-IP(Co-Immunoprecipitation)免疫共沉淀技术,是一种基于抗体与抗原特异结合的原理发展起来的用于研究体内蛋白质相互作用的经典方法。该技术使用非变性剂裂解细胞,保留细胞中蛋白质A-蛋白质B间的相互作用,再将其与蛋白A的专一性抗体混合,此时抗体会与蛋白A结合使其沉淀,同时蛋白B也被共沉淀下来。相互作用的蛋白质种类和数量可以通过后续的质谱分析进行鉴定,即Co-IP质谱分析。Co-IP质谱分析可以用
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