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    • PLS-DA/OPLS-DA二维图

      PLS-DA/OPLS-DA二维图

      PLS-DA/OPLS-DA二维图-详情不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。分别建立两两分组比较的PLS-DA模型(图1)或OPLS-DA模型(图2),模型得到的参数评价会以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分别表示所建模型对X和Y矩

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    • 糖尿病

      糖尿病

      糖尿病-详情糖尿病的典型症状包括高血糖, 由于胰岛素分泌和/或胰岛素作用的缺陷而引起的碳水化合物、脂肪和蛋白质代谢紊乱等。Ⅰ型糖尿病 (T1D) 是T细胞介导的以胰腺β细胞特异性损伤为特征的炎症自身免疫疾病。浸润胰岛的巨噬细胞,淋巴细胞等产生的细胞因子如IL-1β、TNF α和干扰素α,干扰素γ肿瘤坏死因子IL-2等通过有道胰腺β细胞凋亡/坏死和胰岛素分泌缺陷调节T细胞的活化和种群比例,以及调控T细胞对β细胞的免疫识别和杀

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    • 细胞凋亡

      细胞凋亡

      细胞凋亡-详情细胞死亡可以通过多种途径发生, 包括细胞凋亡, 坏死, 和其他 "新兴" 的途径, 有望成为研究的焦点。细胞凋亡在免疫系统中起重要作用,与胞内稳态、T 细胞聚集、反应淋巴细胞的死亡和靶细胞的细胞毒性反应密切相关。其中APO-1/Fas 是细胞凋亡的信号受体分子;Caspase-3在细胞凋亡以及破骨的活化中起着重要作用;CD30 刺激导致生长停止和凋亡。通过对细胞凋亡过程中的细胞因子进行同时的定量检测,对研究相关疾病的发生

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    • 单细胞质谱流式技术分析

      单细胞质谱流式技术分析

      单细胞质谱流式技术分析-详情随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的研究需要了,我们需要更进一步了解细胞之间的差异性,于是针对单细胞的各类研究技术应运而生。单细胞质谱流式(Mass Cytometry)技术是利用质谱技术对单细胞进行多参数检测的流式技术,它既有传统流式细胞术能够高速分析的特点,又兼并了质谱检测的高分辨能力。单细胞测序和质谱流式都是目前非常强大的技术,越来越多的高分文献都是将两者结

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    • iTRAQ和DIA

      iTRAQ和DIA

      iTRAQ和DIA-详情iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)同位素标记相对和jué对定量技术是由美国AB Sciex公司研发的一种基于等质量同位素标签的体外标记定量技术,其利用4种至8种不同的等质量同位素标签,与肽段氨基(氨基酸N-末端和赖氨酸侧链基团)反应实现报告基团、平衡基团和反应基团的连接,之后通过液相色谱串联质谱分析,可同时实现4-8个不同样本的蛋白质组定性和定量分析。DIA(Data independent acqu

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    • 蛋白DIA

      蛋白DIA

      蛋白DIA-详情随着静电场轨道阱Orbitrap质谱的发展,由此带来一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术——数据非依赖性采集模式(Data independent acquisition,DIA)。DIA数据采集模式是在传统的数据依赖性采集模式(Data dependent acquisition,DDA)的基础上发展和革新而来,其目前主要应用于蛋白分析与研究。使用蛋白DIA分析可避免对高丰度肽段采集的偏好性,具有更高的数据挖掘性和检测通量,在定量准确性和技术重复性方

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    • 细胞代谢组学

      细胞代谢组学

      细胞代谢组学-详情代谢组学通过表征体内各种生化反应的产物——内源性小分子(代谢物),揭示了在活细胞内运作的不同途径之间的联系。代谢组学分析可以定性和定量地描述细胞调节途径的zuì终产物,并且可以被视为生物系统对遗传因素或环境变化的zuì终反应。细胞代谢组学以单个细胞中的所有代谢物为研究对象,旨在利用细胞中的小分子来构建个体独有的“指纹”,细胞代谢物被认为是研究生物体表型的zuì佳指标。细胞广泛用于疾病研

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    • 未知蛋白序列测试

      未知蛋白序列测试

      未知蛋白序列测试-详情蛋白质分子本身的一级结构是其生物学功能的核心。因此,准确快速地分析蛋白质的完整序列有利于对未知蛋白质的功能研究,对于包括单克隆抗体在内的蛋白质药物的开发和生产具有重要意义。蛋白质从头测序(De novo sequencing)是一种基于质谱的新型测序技术,它可以直接确定蛋白质的氨基酸序列,无需事先了解其DNA序列,也无需任何已知的序列或蛋白质数据库信息,是进行未知蛋白序列分析的shǒu选方法。从头测

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    • 药物蛋白质组学分析

      药物蛋白质组学分析

      药物蛋白质组学分析-详情药物蛋白质组学就是将蛋白质组学技术应用到药物研究领域上,通过对比正常和病理状态下以及药物治疗前后的细胞、组织或生物体的蛋白质表达差异,用于寻找疾病相关的生物标志物,评价药物的治疗效果、结构与活性的关系等。蛋白质组学技术在药物发现和药物开发工程中得到了广泛的应用。蛋白质组被定义为基因组的蛋白质补体,是一种多样化和动态的分子库,在许多方面决定了基因组所采用的功能形式。蛋白质组学

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    • 热蛋白质组分析

      热蛋白质组分析

      热蛋白质组分析-详情热蛋白质组分析(Thermal Proteome Profiling,TPP)将细胞热移位测定(CETSA)的原理与基于多重定量质谱的蛋白质组学相结合,CETSA基于蛋白质在受热时变性并变得不溶的原理,通过在多个温度下监测剩余的可溶性馏分,可以获得每种检测到的蛋白质的熔解曲线。熔化曲线取决于蛋白质的背景,可以通过与小分子(如药物或代谢物)、核酸或其他蛋白质的相互作用或翻译后修饰来改变。百泰派克生物科技采用Thermo Fishe

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    • 气质和液质非靶向代谢组学检测物质

      气质和液质非靶向代谢组学检测物质

      气质和液质非靶向代谢组学检测物质-详情非靶向代谢组学是相对于靶向代谢组学来说的,非靶向代谢组学旨在研究已知和未知的代谢物,识别所有可检测的代谢物,以分析整体代谢特征并发现现象背后的代谢机制。非靶向代谢组学是大规模早期诊断和发现新生物标志物的强大工具。非靶向代谢组学分析通过使用能够检测大量代谢物的技术,可以快速了解样品的代谢特征。气相色谱-质谱联用(GC-MS)与液相色谱-质谱联用(LC-MS)都是强有力的代谢

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    • 鸟枪法蛋白质测序

      鸟枪法蛋白质测序

      鸟枪法蛋白质测序-详情蛋白质测序就是对蛋白质的一级结构即组成蛋白质的氨基酸序列进行测定,蛋白质的一级结构在很大程度上决定了其高级结构和生物学功能。目前,常用的蛋白质序列分析方法主要有末端测序法(Edman降解法和羧肽酶法等)和基于质谱的方法。鸟枪法(Shotgun)蛋白质测序就是一种基于质谱的测序方法,其利用自下而上的质谱分析策略,将蛋白质多重水解成小分子肽段,再对经高效液相色谱分离的肽段进行质谱鉴定,根据肽

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    • 纳米液相色谱-串联质谱分析法

      纳米液相色谱-串联质谱分析法

      纳米液相色谱-串联质谱分析法-详情纳米液相色谱-串联质谱分析法(Nano LC-MS/MS)已成为蛋白质组学领域的重要工具,与传统的LC-MS/MS相比,其灵敏度具有更大的优势,可以在样品有限的情况下分析蛋白/肽混合物,如通过二维凝胶电泳分离的蛋白水解消化的蛋白质。串联质谱法是一种基于片段化模式(MS/MS扫描)鉴定肽的有效技术。它可以为每个肽段生成单独的光谱,从而在肽表征的基础上创建强大的蛋白质鉴定工具。自动数据采集这一重要

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    • 膜蛋白质组分析

      膜蛋白质组分析

      膜蛋白质组分析-详情膜蛋白是zuì大和zuì重要的蛋白质类别之一,根据膜蛋白与细胞膜或细胞内的细胞器相关或附着的情况,可分为外周膜蛋白或整体膜蛋白。外周膜蛋白通过与膜的外周区域或整体膜结合而与膜相关联,但它们不能完全跨越膜。整体膜蛋白含有疏水性的α-螺旋或β-折叠结构,因此可以跨越整个脂质双层,并通过膜外环区域连接。膜蛋白质组学是蛋白质组学的一个细分分支,是指对一个基因组编码的所有膜蛋白或者机体、器官、

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    • 膜蛋白互作蛋白质谱

      膜蛋白互作蛋白质谱

      膜蛋白互作蛋白质谱-详情细胞膜由数百种脂质组成,其中嵌入了不少蛋白质复合物,例如离子通道、受体和支架复合物等,这些蛋白质组装体充当生命基础过程的信号和运输平台,并且是大量治疗药物的靶标。然而,通过质谱分析它们的表达、结构、修饰以及蛋白质与蛋白质相互作用却落后于可溶性蛋白质的类似研究。膜蛋白之间的相互作用分析是了解其功能的重要手段,为结构和功能的研究提供了大量的信息,目前常用的膜蛋白相互作用研究方法

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    • 免疫印迹怎么测定磷酸化的蛋白

      免疫印迹怎么测定磷酸化的蛋白

      免疫印迹怎么测定磷酸化的蛋白-详情免疫印迹(Western blot,WB)是利用抗原抗体特异性结合的原理,基于SDS-PAGE凝胶电泳进行蛋白质分离、纯化以及相互作用研究的技术,也是评估蛋白磷酸化状态的zuì常用方法。蛋白印迹技术先利用SDS-PAGE分离蛋白质样品,随后将电泳条带转移到固相载体膜上(如PVDF或尼龙膜),再利用磷酸化特异的抗体(一抗)来鉴定目的蛋白,能与磷酸化特异抗体结合的蛋白质即为磷酸化蛋白,zuì后通过标记的二

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    • 免疫多肽组学 质谱

      免疫多肽组学 质谱

      免疫多肽组学 质谱-详情免疫肽是一种非经典肽,它是由蛋白质编码区之外的序列或由非经典抗原加工机制产生的抗原,其在免疫系统识别肿瘤以及在癌症的免疫疗法中至关重要。免疫肽组学(Immunopeptidomics)是指使用质谱法(MS)研究主要组织相容性复合物(MHC)I类和II类分子所呈现的免疫肽的组成和动力学的科学,它可以大规模、深入识别和量化所呈现的HLA免疫肽组,是快速推进癌症免疫疗法的重要方法。百泰派克生物科技采用Thermo F

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    • 免疫沉淀与Pull-down实验

      免疫沉淀与Pull-down实验

      免疫沉淀与Pull-down实验-详情免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是一种基于抗体和抗原特异性结合的原理开发的用来检测、分离、纯化蛋白质以及研究蛋白互作的方法。免疫沉淀技术提供结合抗体蛋白的磁珠,将细胞裂解液或组织提取液等蛋白混合体系与磁珠进行孵化,此时,混合体系中的目标蛋白与磁珠上的抗体蛋白实现特异性结合,再通过离心或洗脱去掉没有与抗体蛋白结合的杂蛋白,将目标蛋白分离出来,通过与其他技术(如质谱)结

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    • 免疫沉淀和质谱分析结果

      免疫沉淀和质谱分析结果

      免疫沉淀和质谱分析结果-详情免疫沉淀和质谱分析即免疫沉淀与质谱联合分析(Immunoprecipitation and Mass Spectrometry,IP-MS),其将免疫沉淀获得的靶蛋白进行后续质谱分析,对靶蛋白进行定性研究,以确认目标蛋白与预期靶标的特异性相互作用。IP-MS分析shǒu先根据目标蛋白选择候选细胞系模型来表达感兴趣的靶蛋白,然后提取细胞裂解物中的靶蛋白进行优化的免疫沉淀实验,zuì后将处理所得的IP洗脱样本并采用质谱法分析,并通

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    • 硫巯基化修饰

      硫巯基化修饰

      硫巯基化修饰-详情硫巯基化(S-巯基化,S-sulfhydrate)是一种新发现的在靶蛋白特定半胱氨酸残基上发生的蛋白质翻译后修饰,其通过改变靶蛋白的局部构象和zuì终活性参与广泛的细胞功能和代谢途径,S-巯基化作用被认为介导了由H2S引发的大多数细胞反应。通过在活性半胱氨酸残基中产生氢过硫化物部分(-SSH)或多硫化物,介导由H2S诱导的大部分细胞功能,使与H2S成为向NO和CO一样的气体递质家族中的新成员。百泰派克生物科技采用The

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