基于LC-MS-MS的蛋白质组学

基于LC-MS-MS的蛋白质组学-详情蛋白质组学是对生物系统中所有蛋白质的全面分析，基于质谱的蛋白质组学已成为鉴定和量化生物体蛋白质组的shǒu选工具，随着质谱和分离方法的zuì新进展，液相色谱-串联质谱（LC-MS-MS）技术得以诞生并在包括蛋白质组学在内的各种组学研究广泛运用。LC-MS-MS 技术将质谱的高精度鉴定与色谱的分离技术结合起来，可高通量提供待测物的定性和定量分析。基于LC-MS-MS的蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组

基于iTRAQ的定量蛋白组分析

基于iTRAQ的定量蛋白组分析-详情iTRAQ（Isobaric Tags For Relative And Absolute Quantification）同位素标记相对和jué对定量是一种基于Shotgun鸟枪法的非靶向标记蛋白质定量技术，基于iTRAQ的定量蛋白质组分析允许在一次实验中同时鉴定和相对定量多达12个不同生物样品中的数百种蛋白质，用12-plex iTRAQ试剂分别标记酶解消化后的蛋白样品，再将标记好的样品混合均匀进行质谱分析。由于iTRAQ试剂是等压质量设计的，因此差异标记

混合蛋白的鉴定

混合蛋白的鉴定-详情蛋白质鉴定就是对蛋白质的特征参数或基本性质进行鉴定，主要包括蛋白质的分子质量、含量、纯度、等电点、氨基酸组成和序列、空间结构以及翻译后修饰情况等，通过这些鉴定得以确定蛋白质的身份ID。不同特征参数所使用的鉴定方法大多不同，也存在同样的方法可以满足多种参数鉴定，如质谱法可实现蛋白质的分子质量、含量、氨基酸组成和序列以及翻译后修饰情况的鉴定，是目前蛋白质鉴定的强有力的工具。此外，电泳

宏蛋白测序

宏蛋白测序-详情宏蛋白质也称环境蛋白质，指由环境微生物如土壤、肠道、水体、淤泥以及食品等中含有的微生物所表达的蛋白质，其与普通的蛋白质一样，都是由天然氨基酸脱水缩合形成的。宏蛋白质测序就是对宏蛋白质进行序列分析，主要分析的内容包括多肽链的数目及连接方式、组成各多肽链的氨基酸种类和排列顺序以及二硫键的数目和位置。宏蛋白质的测序技术和原理与一般的蛋白质序列测定技术大致相同，主要可以分为末端序列分析和全

宏蛋白质组学

宏蛋白质组学-详情宏蛋白质组是指特定条件下环境中微生物表达的全部蛋白质，如肠道微生物、土壤微生物、活性淤泥中的微生物、水体微生物和食品微生物等表达的所有蛋白质。宏蛋白质组学（Metaproteomics）就是以宏蛋白质组为研究对象，对其种类、活性和功能等进行分析鉴定，通过进行蛋白质层面的研究也有助于微生物群落结构的研究。‎宏蛋白质组学‎‎作为‎‎蛋白质组学‎‎的一个子领域，已迅速成为在功能水平上对‎‎微生物组‎

寡肽或多肽测序

寡肽或多肽测序-详情寡肽或多肽测序是指对其氨基酸组成和排列顺序进行解析，多肽是类似蛋白质、比蛋白质分子质量小的一类化合物，其序列分析的方法和原理也与蛋白质的序列分析相似，主要有Edman降解法、C末端酶解法以及质谱全序列、从头序列测序法。对于分子量较小、氨基酸组成较简单的寡肽和多肽来说，进行末端序列分析的意义不大，通常是利用质谱技术进行全序列鉴定，基于质谱的从头测序技术可以不依赖于蛋白质理论数据库进行全

固相MALDI-TOF质谱技术

固相MALDI-TOF质谱技术-详情MALDI-TOF（Matrix-Assisted Laser Desorption / Ionization Time of Flight）质谱即基质辅助激光解吸飞行时间质谱，是一种基于软电离和飞行时间质量分析器的质谱分析技术。MALDI即基质辅助激光解吸电离，其将待测物均匀包裹在固体的基质中，吸收了激光能量的基质将能量均匀的传递给样品物质，使样品离子在温和的激光能量刺激下气化并电离，而不会破坏其原来的结构，因而称为软电离方式。TOF飞行时间质

高通量糖基化组学技术

高通量糖基化组学技术-详情糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰方式，指在相关酶的作用下，蛋白质肽链上特殊氨基酸残基共价结合寡糖链的过程。糖基化修饰通过影响蛋白质结构进一步影响其功能、定位以及活性等方面。糖基化组学研究就是对特定样品中的糖基化蛋白即糖蛋白进行鉴定，包括蛋白质是否发生了糖基化以及发生了哪种糖基化、糖基化的氨基酸位点以及水平、糖链的种类和结构。由于寡糖的种类和结构复杂多样，使得蛋白质糖基化

高通量蛋白质组学

高通量蛋白质组学-详情蛋白质组学诞生初期主要基于Western blot技术进行研究，其鉴定的通量、分辨率以及灵敏度等都差强人意，也使蛋白质组学研究遇到了一些瓶颈。随着生命科学技术的发展进步，先进的、高分辨率及高灵敏度的质谱仪登上历史舞台，为蛋白质组学研究带来了全新的分析技术，也使蛋白质组学研究进入了新时代。高通量蛋白质组学就是利用高通量质谱技术进行各项蛋白质组学分析，在保证分析结果准确性的基础上同时保证了通

蛋白组学靶向和非靶向

蛋白组学靶向和非靶向-详情蛋白质组学靶向和非靶向是根据研究的蛋白质是否是特定的来区分的，靶向蛋白质组学是针对一个或多个特定的目标蛋白质进行研究，非靶向蛋白质组学则是对尽可能多的或体系中包含的全部蛋白质进行研究。往往通过非靶向蛋白质组学研究找到感兴趣蛋白或关键蛋白后可利用靶向蛋白质组学技术进行进一步研究和验证。常用的靶向定量蛋白质组学质谱技术是基于SRM（选择反应监测）和PRM（平行反应监测）扫描模式进行

蛋白组学PRM和DDA

蛋白组学PRM和DDA-详情PRM（Parallel Reaction Monitoring）平行反应监测和DDA（Data Dependent Acquisition）数据依赖采集模式是两种不同的质谱扫描模式或称数据采集模式。二者的区别如下表所示：PRMDDA原理利用高分辨、高精度的四级杆质量分析器选择目标肽段的母离子进行二级质谱，对每一个母离子产生的所有碎片离子进行全扫描根据预设的条件如信噪比、同位素分布和离子强度等筛选肽段母离子进行二级质谱片段化和分析优点无需建

蛋白组和代谢组学植物样品

蛋白组和代谢组学植物样品-详情植物在不同生长时期及外界环境影响下会表达不同的蛋白质或代谢产物以适应和应对这种变化，研究植物体内蛋白质或小分子代谢产物的变化规律即植物蛋白质组学和植物代谢组学有助于理解植物体内相关生命过程的本质和分子机理。进行植物蛋白质组学和代谢组学研究shǒu先要从待研究的植物组织如种子、根、茎、皮、木、叶和果实中提取蛋白质和代谢物样品，或者提供相应的植物组织。需要注意的是，蛋白质提取

蛋白的动态磷酸化修饰

蛋白的动态磷酸化修饰-详情磷酸化修饰是zuì常见的、重要的蛋白质翻译后修饰方式之一，指蛋白质的氨基酸残基在相关酶的作用下共价结合磷酸基团的过程。磷酸化修饰不仅丰富了蛋白质的生物学功能，还通过影响蛋白质的活性、稳定性、细胞内定位和蛋白质互作等参与调控众多信号转导途径和细胞代谢过程，如细胞周期、基因表达、转录、信号传导以及DNA修复损伤等。机体内的磷酸化修饰是处于动态变化中的，不同时期或不同生理病理条件下，

蛋白代谢组学

蛋白代谢组学-详情蛋白代谢组学就是进行蛋白组与代谢组联合分析。蛋白质组学通过从整体水平上研究生物体或系统内的蛋白质组成、活动规律以及蛋白质之间的相互作用来揭示各项生命活动的分子机理。代谢组学通过定性和定量表征不同时期或生理病理条件下机体产生的小分子代谢物的变化，挖掘关键代谢产物和代谢通路，探索生物体与细胞代谢相关的关键科学问题。蛋白组学与代谢组学联合分析不是简单的将两者的数据汇合，而是进行归一化处

蛋白从头测序的样本处理

蛋白从头测序的样本处理-详情从头测序是一种不依赖于已知蛋白序列数据库的序列分析方法，它利用质谱检测到的两个片段离子之间的质量差来计算肽链上氨基酸残基的质量，进而推断多肽或蛋白的氨基酸序列。对于一个没有相应理论数据库、或者新发现的蛋白/多肽来说，从头测序就显得十分重要。进行蛋白质分析shǒu先要制备合适的蛋白样品。制备从头测序的蛋白样本应从其含量、纯度、保存以及运输等方面进行考虑：（1）可以制备液体或冻干

蛋白纯化抗体的质谱鉴定

蛋白纯化抗体的质谱鉴定-详情蛋白质纯化技术可以去除复杂混合蛋白样品中的非蛋白杂质，并将各蛋白组分分离开来，是进行后续蛋白分析的重要步骤。纯化后的蛋白质可以进行进一步定性或定量以及其他鉴定，以明确其种类、含量等理化性质。质谱技术可以通过检测蛋白质的分子质量而实现定性鉴定，通过分子量信息还可以进行蛋白氨基酸组成、氨基酸序列以及蛋白质翻译后修饰情况分析。另外，根据质谱数据中蛋白肽段的质荷比强度信息还可以

蛋白测序Edman和质谱法区别

蛋白测序Edman和质谱法区别-详情蛋白质测序是指测定蛋白质的氨基酸组成和排列顺序，也可以称为蛋白质一级结构分析。目前用于蛋白质氨基酸序列分析的方法可以大致分为基于质谱的方法和非质谱法，Edman降解法是zuì常用的非质谱法。质谱法和Edman 降解法基于不同的原理实现蛋白质的序列分析，二者所能分析的片段也不同，Edman降解法是针对N末端序列的测序方法，但是对于N端封闭的蛋白质无能为力；质谱法可用于蛋白从头测序、蛋白全序

蛋白表征分析

蛋白表征分析-详情蛋白质是生命物质的承担者和生物功能的执行者，对维持机体正常生命活动具有十分重要的作用。蛋白表征分析（Protein characterization analysis）包括对蛋白纯度、分子量、结构、翻译后修饰情况以及相互作用等进行表征，作为生物科学研究的核心领域之一，蛋白表征分析揭示了蛋白质如何在生物系统中发挥作用，以及它们如何相互作用以维持正常的生理功能。常用的蛋白表征分析方法包括核磁共振（NMR）、质谱（MS）和

代谢组研究靶向和非靶向

代谢组研究靶向和非靶向-详情根据不同的研究目的可以将代谢组学分为靶向代谢组学和非靶向代谢组学。靶向代谢组学主要是对目标代谢物或已知代谢物进行多重分析；非靶向代谢组学通过高通量分析生物体或系统内的所有代谢物以寻找并筛选关键代谢物进行后续分析。简而言之，靶向代谢组学的研究对象在实验前是确定的，而非靶向代谢组学的研究对象在实验前是不确定的。靶向代谢组学利用标准品和同位素内标来实现特定代谢物的精准定性和定

代谢组学样品处理

代谢组学样品处理-详情样本采集是进行各种研究的第yī步，也是关键的一步，好的开始是成功一半，只有制备了合适的、满足检测条件的样本才能保证实验和分析更加准确可靠。可以用来做代谢组学的样本多种多样，包括组织液、血清、血浆、尿液、唾液、脑脊液、关节液、淋巴液、粪便、唾液、植物器官、微生物细菌、细胞及其培养基以及真菌及其发酵液等。目前还没有一种通用的代谢组学样本采集方法，不同的样本有不同的特点，收集保存的方